鎮守廬州的大將呂珍突然發現城下的朱元璋大營里空無一人，留下了很多火炮輜重，似乎撤離的很緊急。聽到探馬來報，朱元璋大軍分兩路撤退，主力部隊朝長江方向撤退，還有小隊人馬向東撤退。呂珍料想，必是西風刮起，陳友諒的大軍開動，所以朱元璋不得不連夜撤軍，回援應天。
呂珍果然中計，為貪戰功，率鐵騎部隊追擊元璋東撤的小股部隊。追至半夜，遭遇徐達埋伏，損兵折將，呂珍也被生擒。待徐達押著呂珍回到廬州時，元璋已經率軍攻下城池。呂珍也知張士誠乃鼠目寸光之輩，難成大器，愿投入朱家軍麾下效力。朱元璋用人不疑，仍將廬州城交呂珍駐守。大隊人馬則返回應天，準備與陳友諒一戰。
元璋回軍后，在安慶的長江兩岸部署火炮，準備封鎖江面助洪都御敵。這時軍師來信，他已命洪都將士死守，消耗陳友諒的軍力和士氣。元璋則應趁此時爭取湖口，封鎖鄱陽湖與長江的出入口，將陳友諒的水師困在鄱陽湖內。隨后加緊訓練水軍，待時機成熟之時，再與陳友諒在鄱陽湖決戰。
而陳友諒卻在開戰前設壇祈禱，求神靈相助。哪知剛下令出發，西風突然轉成了東南風。友諒誠心向喜陽道人請教，喜陽道人稱是上天不許大漢出征應天，如強行發兵只怕兇多吉少。所以可暫緩取應天，改攻洪都。這本是友諒最初的戰略，后因急于奪取應天才放棄?，F在既然天意如此，友諒決定先發兵洪都，再沿江攻打至應天。喜陽道人見自己的任務已完成，便向友諒告辭，回廬山繼續修行。
高敏到了汴梁，見到擴廓帖木兒后二人抱頭痛哭。擴廓帖木兒隨即調撥二十萬人馬，要直搗應天，為朵而只報仇。但被高敏制止。她將事件的經過，原原本本的說了出來。如今直兇劉福通已自焚而死，再去應天尋仇，只是徒傷士兵性命。雖說如此，仍難以平息擴廓帖木兒的心頭怒火。他讓施都尉帶書信給朱元璋，讓朱元璋在半個月內親自將朵而只的靈柩送到汴梁，否則就帶大軍直搗應天。
洪都由朱元璋的侄子朱文正鎮守，有部屬研制出火銃，以御強敵。同時還送了幾支樣品到應天，劉伯溫也是第一次見到威力如此強大的火器，忙命人召集能工巧匠加緊改良仿制，大量裝備部隊。這時施都尉回到了應天，秀英見到擴廓帖木兒的書信，便向軍師請教。目前元璋在前線不可能離開，只有讓秀英扶靈柩前往汴梁，暫時消消擴廓帖木兒的怒氣。
陳友諒收到戰報，稱朱元璋在安慶布防，又派兵沿江而上至湖口，欲封鎖鄱陽湖進長江的入口。陳友諒大喜，決定將計就計，等朱元璋進了湖口就關門打狗。
陳友諒那邊想關門打狗，可朱元璋也不笨，到了澎澤卻遲遲不打湖口，就與陳友諒對峙。為了讓陳友諒的大軍有事可做，劉伯溫模仿秀英的筆跡給秀蓮寫了封信。
洪都的朱文正，誓言旦旦要拖住陳友諒大軍兩三個月?？伤诔抢镏皇秋嬀谱鳂?，直到陳友諒的水師殺來，他才召開軍事會議。以他平時的作風，城內諸將都頗有微詞。兵臨城下，才臨時抱佛腳，眾將更是不服。為了豎立威信，朱文正當場與意見最大的將領趙德勝，一對一單打獨斗。讓諸將沒想到的是，平時只知吃喝玩樂的紈绔子弟，上了場卻是威風八面，把個趙德勝打得無還手之力。朱文正到洪都后一直不務正業，一是因為洪都將領擅戰，無需他指手畫腳；二是為了麻痹陳友諒，讓其輕敵。主帥既然這么說，眾將均誓死守住洪都。
朱文正早已對洪都城做過仔細觀察，發現城池堅固有余，但城門過多。按各將軍的能力分配好所守城門后，朱文正與各人拱手相別。此戰之后，不知還有多少人能再相見，幸存之人此后也必能飛黃騰達。
陳友諒船艦到達洪都水道口時，蘆葦塘中突然炮聲大作，二十余艘戰船來不及反應就沉入水底。待陳友諒率軍下船搜索蘆葦塘，發現十余門火炮之時，朱文正又派出一隊火銃隊從地道出來，對著蘆葦塘一通亂謝，打得陳家軍抱頭鼠竄。陳友諒吃了這么一個下馬威，哪肯善罷甘休。他命人將火炮搬上岸，對著洪都城墻就是狂轟濫炸，一定要在數日內拿下洪都，震懾朱家軍。
秀英已將朵而只的靈柩護送到汴梁城下。見擴廓帖木兒扶棺大哭，秀英就地跪倒，求擴廓帖木兒放應天軍民一條生路。擴廓帖木兒之前也是一時意氣之言，現在有秀英行此大禮，再有高敏從旁勸說，就答應不再提發兵之事。不僅如此，擴廓帖木兒欽佩秀英的勇氣，愿與元璋結為兄弟之情，借五萬精兵交元璋對抗陳友諒。但秀英婉言謝絕，此舉對擴廓帖木兒不利，而且義軍中出現元軍更會讓人懷疑元璋與元廷的關系。
陳家軍日夜不停攻打洪都，整整三天，連一個城門都沒拿下。陳友諒急得親自上陣督戰。幾百里外的朱元璋也是心急如焚，不知侄兒是生是死。這時從應天傳來消息，徐達和常遇春已率領水軍出發，總算讓元璋心中安定少許。
連攻數日不下，陳友諒命人到城門下招降朱文正，得到的卻是城頭更猛烈的炮火。陳友諒大怒，命幾十萬大軍同時攻打洪都的九座城門。而在江州皇宮中的皇后秀蓮，卻在為收到“姐姐”的來信欣喜不已。信中“秀英”稱已到澎澤，想請友諒到澎澤議和，兩軍合并同赴大都，推翻元廷后平分天下。
陳友諒連日攻打洪都不克。張定邊知守土步城門的趙德勝脾氣暴躁，便在城下罵戰，果然引得趙德勝出城拼殺。所幸朱文正得到消息后迅速支援，才沒讓城門有失。此戰趙德勝雖擅自出城，但殺出了氣勢，滅了陳家軍的威風，總算功過相抵。
而元璋也收到回信。韓林兒被安置在滁州，文武大臣天天定時向他請安，他也樂得在那做個不問世事的土皇帝。安排好小明王，也算是了了樁心事。突然軍營守門士兵來報大漢皇后馬秀蓮前來求見。兩人見面一說到休兵之事，元璋是一頭霧水，秀英也覺莫名其妙。這時劉伯溫匆匆趕了來，稱因秀英去了汴梁，所以休兵之事由他代秀英來談。秀蓮不知是計，就留了下來。
劉伯溫是想借著洪都給陳友諒下馬威的勢頭上，再接再厲，將秀蓮引到澎澤，讓陳友諒無心戀戰。此時去封書信，讓陳友諒停止攻打洪都，來澎澤接皇后。戰事一停，陳家軍的士氣必泄，再想重振旗鼓就難上加難。洪都的守軍，也可利用這個空檔休整，稍作喘息。元璋本不想用自己的小姨子相威脅，可想想陳友諒本就是個無情無義之人，不必和他講道義。于是他就聽從軍師之言，寫了書信送到洪都。
洪都之戰打了十余天，仍是毫無進展。最可恨的是，在攻城之時，背后會出現一只奇兵，持火銃猛射，讓陳家軍傷亡慘重。友諒這才意識到，城內有地道通向城外。這時他又收到元璋書信，只能下令停止攻打洪都，親自赴澎澤接秀蓮。
元璋料定友諒必會來澎澤，畢竟秀蓮是正宮娘娘，明知自己老婆在別人手里都不敢來，只會讓世人恥笑。既然難得見面，元璋就在路邊擺下酒菜，嘗試勸友諒罷兵?？捎颜徳缫岩曁煜聻槟抑兄?，怎么可能答應與元璋平分天下。在他看來，元璋要么歸順大漢，要么被大漢消滅。話不投機半句多，元璋和友諒已沒有結盟的可能性，只有在戰場上一決勝負，成者為王敗者寇。