內官沐敬向朱棣和妙云行禮，他是鄭和下西洋前從司禮監調過來伺候朱棣的親隨，看起來很伶俐。朱棣和妙云聊到了孫子朱瞻基，夸贊朱瞻基讀書和弓馬都好，和太子小時候一點都不一樣，而后兩人又再聊了幾句后，妙云就昏睡過去。后來朱棣叫來盛太醫詢問，盛太醫只好說實話，她的身體在這些年沉疴太深，已是積重難返，她的脈象已呈油盡燈枯之相。朱棣讓他無論如何都要醫治好妙云，可生死司命，皆是天數，盛太醫只能盡力而為。
盛太醫曾幫朱棣治好了風濕，還救回了一個奄奄一息的太監，所以朱棣一直認為盛太醫是生白骨活死人的名醫，可就連他也無法幫妙云治好病，朱棣得是多絕望。妙云身體不適，朱棣下口諭，宮中不再殺生，除坤寧宮之外，各宮一律齋戒；今年的死囚，一律暫緩，有條件的可降罪赦免。同時讓派人去靈谷寺，請哈立麻大師攜眾僧為皇后祈福。宮人下去后，朱棣大哭出聲。
徐允恭先妙云一步離開人世，徐府現只剩下妙云和妙錦兩姐妹。妙云不懂朱棣為什么要逼死大哥，她本以為自己和二哥徐增壽幫朱棣，便能讓他放過大哥徐允恭，可是到頭來，二哥沒了，大哥也撒手人寰。妙云心中亦滿是酸楚，她還沒來得及說話，人就暈了過去。朱棣下旨讓徐允恭長子徐欽承襲魏國公爵位，說完這些，朱棣趕忙走進去看妙云。妙云已經打扮就緒，她此時此刻想單獨和朱棣兩個人待一會兒。
妙云有些事情要告訴朱棣，當年隨同她一起守北平的將士家眷，她每年都有薄賞，她希望自己走后，朱棣能記得對他們多加照拂。妙云躺在朱棣的懷里，絮絮叨叨說起在鳳陽的回憶，然后慢慢地斷氣了。朱棣悲痛欲絕，三日不食不眠，并且不讓妙云入殮。朱高熾不得已，請來了道衍大師。皇孫朱瞻基的哀求，終于讓朱棣清醒，答應讓妙云入館。鄭和下西洋回歸，帶回了屬國的多個醫者。朱棣夸贊了鄭和的差事，還要他明年再度下西洋，還讓他安排好前來的醫者，鄭和領命退下。
道衍已經編好書，朱棣讓朱瞻基陪自己去看看。他讓人都退下，獨獨留下了道衍，他說妙云生前最喜歡看書，要是看到這些書，她得有多高興。阿魯臺弒君的消息傳回朝廷，朱棣大為驚詫，這又是一個燕帖木兒。朱棣立即下令，準備出巡，并著皇長孫隨行，京師由太子監國。朱棣將出使漠北的任務交給了郭驥，讓他負責韃靼之事。通過朱棣北巡的所做之事，以及建陵等事宜，夏原吉知道陛下決定要遷都北平了。
漠北大汗趁著伯顏帖木兒不在的時候接見明廷使臣，伯顏回到大營發現郭驥已經被斬首示眾。海別明白朱棣絕對不會咽下這口氣的，于是指示弟弟聚兵。果不其然，朱棣大發雷霆，下旨出兵漠北，塞外三大部有韃靼、瓦剌和兀良哈，后兩者已經歸順，唯獨韃靼的本雅失里敬酒不吃吃罰酒，楊子榮將他的心思分析透徹地說給朱棣聽。朱棣問起朱瞻基的看法，朱瞻基說得頭頭是道，瓦剌和兀良哈無論從什么樣的角度來看，這次都不會與朝廷為敵。
朱棣教導朱瞻基，他剛才說的固然有道理，但道理也只是道理，用兵要考慮萬無一失，畢竟草原人和中原人不同，他們是在馬背上就能生孩子的，況且這些年他們又多了這么多騎兵，難免會有二心。朱棣也知道大明尚蘇，百姓休養生息，不宜興大兵，可這次也是為形勢所迫，不得已而為之。此時，臚朐河的明軍大營內，大將軍已經下令，明早奔襲元人大營。只因他們抓到了一個元人尚書，知道王廷所在，并表示其守衛松懈，僅有兩千多人。安平侯和武成侯都認為此事蹊蹺，不可掉以輕心。
這位征敵大將軍認為機不可失，不顧下屬的勸諫，貿然出兵，最終中了元人的圈套，丘福被元人一箭射死。朱棣傳話回京師，丘福喪師辱國，除其爵位，舉家流放海南。李遠、王聰勸諫有功，均追封公爵。朱棣決意，年內再度北伐。楊子榮私下和夏原吉訴說自己的擔憂，軍中似乎無人能擔任大將軍率軍出征漠北，夏原吉卻說，全大明最好的將軍，不就是朱棣本人。京中的朱高熾很快得知，父皇要親征漠北，廓清沙漠。朱棣有一個深深的擔憂，他親征后，卻沒有一個替自己坐纛的皇子。
道衍提到了朱瞻基，他已經十二歲。朱棣便決定讓朱瞻基坐鎮，夏原吉身兼四部，輔佐皇孫朱瞻基，而朱棣則以知天命的年紀率兵親征。瓦剌派使者來見朱棣，對方忌憚大明，所以語言十分恭敬。韃靼大汗棄了大營，帶著親衛投奔瓦剌去了，太師（伯顏帖木兒）震驚得站起來，海別不同意讓弟弟帶人去追，伯顏不解。海別說這一場禍事他們是躲不過了，而大汗去投奔瓦剌，瓦剌也未必會容得下他。朱棣要先打韃靼，不過是想抑強扶弱，所以必然也不會放過阿魯臺。
明軍打過來以后，韃靼沒能支撐多久，海別不得不讓弟弟請封，向朱棣稱臣。朱棣凱旋而歸，朱高熾率眾官員迎接。夏原吉同朱棣匯報會通河疏通所需的人力和物力，這還只是第一步，南北水運南北貫通還需要幾年的時間。朱棣看得明白，夏原吉之所以著急疏通會通和立刻開鑿清江浦，與自己著急用兵漠北脫不開關系。但朱棣讓他再等一等，因為這兩年阿魯臺是老實了，可馬哈木卻越來越放肆。公元1413年，明永樂十一年，朱棣遷皇后梓宮于北京長陵。
朱棣在長陵里，妙云的牌位前說這些事，他明年要再征一次漠北。在忽蘭忽失溫之戰中，明軍千里遠來，在野戰中以游牧民族最為擅長的騎兵對決，正面擊潰了號稱塞外無敵的瓦剌騎兵！此役，瓦剌三萬騎兵折損殆盡，馬哈木兵敗后率部遠遁，至死不敢再南顧。道衍也老了，躺在病床上，他跟隨朱棣四十多年，如今生死有命，也肯定了朱棣身為帝王的功績，隨后他勸誡朱棣也要好生休息。公元1420年，朱棣頒遷都詔，正式遷都北京。元人來犯，朱棣決定明春再度北伐。
夏原吉前去勸諫，而朱棣像高皇帝，決定了的事不會再改，楊子榮勸說夏原吉放棄去勸諫的想法，但夏原吉執意前去，到底還是惹怒了朱棣，錦衣衛奉皇命抄了夏原吉的家，卻發現其十分清貧。朱棣念著這些年夏原吉兢兢業業，下旨每日供給一肉，牢房要大，冬日供給炭火，佳節日時的湯圓等必不可少。
該給夏原吉的待遇，朱棣一樣都不會少，而戶部的諸多事宜，也仍要夏原吉負責，沒人說在牢里就不能處理公務了。就這樣，夏原吉在牢里度過三年，朱棣這才去見了他一面。朱棣這些年做成了許多事，夏原吉不知道該說什么。其實他不否認朱棣做這些事是對的，只是他不明白，為什么要勞民傷財地頻繁北征，為什么要在幾年之內數度下西洋。朱棣聽他的話越發刺耳，轉身離去。夏原吉在后面行禮，漠北苦寒，望陛下珍重。
后來朱棣告訴朱高熾，他這次去牢里本來是要放出夏原吉，沒想到又被他擠對了一頓。三年前，夏原吉不同意用兵漠北，自有他的道理，而朱棣也有自己的考量。諫言這件事本無可厚非，只是朱棣惱怒于夏原吉攛掇了各部一起給他遞上奏書。天子豈可受制于眾臣，這也是他為什么將夏原吉下獄的原因。朱棣之所以和朱高熾說這些，不僅僅是因為他是未來的皇帝，還因為他是自己的長子，朱棣擔心朱高熾的仁厚，會在未來造成麻煩。
長久以來，朱棣對朱高熾要求甚嚴，這一回，聽著朱棣的肺腑之言，朱高熾也終于明白他的良苦用心。翌日，朱棣早早起身，前往漠北北征。這幾日連連趕路，朱棣的身體已經吃不消，幾天之后是朱棣的圣壽，如往常一樣，朱棣沒有過。阿魯臺果然連夜行軍，所以白日里根本沒有阿魯臺的蹤跡和消息，元婦人的一個孩子丟了，她哭著要回去尋找，阿魯臺自然沒允許，畢竟在這節骨眼上，命更加重要一些。天亮后，張輔發現元人遺落的孩子，將他帶回大營，他似餓了很久，狼吞虎咽似的吃東西。
據抓到的元人說，阿魯臺已經退到了答蘭納木兒河，在糧草不夠的情況下，朱棣還是讓人清點了一萬精騎，奔襲答蘭納木兒河。阿魯臺如同驚弓之鳥，立刻逃之夭夭，朱棣這次還是沒能追上。張輔提議由他帶一萬精騎，備足一月口糧，深入漠北俘獲罪人，朱棣并沒有同意。阿魯臺已經不想再和朱棣周旋，朱棣問了楊子榮幾句話，雖然眾將士都愿意為自己身先士卒，但朱棣已經不愿意冒險了，最終決定班師回北平。伯顏帖木兒很意外，以往朱棣都是在草原上至少了待五月以上，沒想到這次不足三月就回去了。海別明白，朱棣是個愛面子的人，這一回無功而返，怕是因為身體撐不住了。
朱棣已然發鬢斑白，年老體衰，騎馬更是難上加難，他將楊子榮和張輔叫到身邊，吩咐自己死后的諸多事宜。他死后，傳位皇太子，禮儀喪服，一律按太祖制。朱棣執意要騎馬，他們只得聽令。最終，永樂皇帝朱棣于班師途中駕崩，享年六十五歲。
朱棣一生馳騁戰場，經歷風雨，促成鄭和下西洋，數度北征，疏通運河，創下永樂盛世，在位期間，經濟繁榮，國力強盛，史稱“永樂盛世”。
全劇終。