莎莉娜在布拉塔諾博士處得到了卡洛斯地方圖鑒，并選擇了火狐貍作為自己的初學者神奇寶貝。在前往白檀道館的途中，柚麗嘉在照顧小智的神奇寶貝時，之前的咚咚鼠再次出現。柚麗嘉十分想要收養它，但咚咚鼠再次逃走。于是小智和希特隆分別派出皮卡丘和掘掘兔前去收服咚咚鼠。皮卡丘抓到了咚咚鼠但是卻和小智等人走散了，并且和咚咚鼠一起被火箭隊追捕。皮卡丘帶著咚咚鼠逃過了火箭隊的追捕，并被小智的小箭雀找到。小智等人趕到皮卡丘處，希特隆幫咚咚鼠回復了體力。再一次擊敗來襲的火箭隊后，咚咚鼠自愿被希特隆收服，并被柚麗嘉帶在身邊。
小智一行人來到了白檀市，與此同時莎莉娜也來到了白檀市。在前往道館的路上小智與道館訓練家紫羅蘭碰面了，但卻不知道她的道館訓練家身份。抵達道館，小智在門口遇見了三色堇和她的傘電蜥，從來采訪結束來到這里等小智一行人的三色堇那里得知，這里便是她妹妹的道館后十分激動，尾隨而至的紫羅蘭與小智等人見面，小智才知道原來她就是道館訓練家。穿過一層時，小智一行人看見了墻上的照片十分贊賞，這時，被照片迷住的柚麗嘉決定將紫羅蘭選為希特隆的新娘，但是被希特隆的機械之手拖到對戰場地了。之后，小智的皮卡丘和紫羅蘭的溜溜糖球開始進行道館賽，第一輪由于溜溜糖球用急凍光線造出來冰之場地使得皮卡丘被打敗了。接著出場的小箭雀扳回一局，打敗了溜溜糖球，但接下來登場的碧粉蝶利用幻象術將小箭雀撞上冰之場地和黏網，最后被陽光烈焰一擊打敗，在對戰中，莎莉娜來到這里參觀比賽。小智輸了后，和紫羅蘭約定再次挑戰，然后便帶著受傷的神奇寶貝去了神奇寶貝中心，卻把背包忘在了道館，莎莉娜看到后決定幫他送去。在神奇寶貝中心后的對戰場地上的小智送來背包的莎莉娜碰面了，柚麗嘉和希特隆過來告訴了小智，剛才莎莉娜也在場，小智對只注意神奇寶貝和對戰而忽略她了感到抱歉，這時，神奇寶貝中心的通知聲音打斷了莎莉娜想和小智說的話。在神奇寶貝中心里小智見到了火狐貍，也告訴了莎莉娜喬伊小姐有很多的事。接著，小智和趕來的三色堇在對戰場地進行特訓，決定先來突破烈暴風，便讓三色堇的音波龍造出大風，讓綁著氣球皮卡丘他們進行突破，可是總是失敗，每當失敗摔下時，小智都會替它們擋下摔下的傷害，這時，莎莉娜為小智遞上了手帕，莎莉娜再次和她說起過去的事…
經過莎莉娜的提點，小智恢復了活力，繼續接受三色堇的特訓，讓皮卡丘、小箭雀適應了在大風中的戰斗。吃過晚飯后，又接受了希特隆的科學特訓。第二天小智跟神奇寶貝們精神滿滿地前去挑戰紫羅蘭，對決開始！皮卡丘對戰溜溜糖球，打敗了紫羅蘭獲得蟲蟲徽章。