獨(dú)立營分成兩股軍隊(duì)，李化成帶領(lǐng)的一隊(duì)假扮國民黨，唐運(yùn)龍帶領(lǐng)的一隊(duì)則聲東擊西，策應(yīng)李化成的特別行動(dòng)小組，協(xié)助其順利突破敵人封鎖線。李化成到達(dá)國民黨軍駐扎地后，在醫(yī)務(wù)兵營帳中并未發(fā)現(xiàn)奎寧，但得知婁富貴家中有治療瘧疾的特效藥奎寧。紅軍在駐扎地拿走了醫(yī)藥箱和食物，隨后炸了此處離去。
李化成的特別行動(dòng)小組假扮國民黨人士，再次突破縣保安團(tuán)封鎖，堂而皇之來到縣里。還張貼了“革命紅旗永不倒”的字條。陳天佑跑來慰問婁富貴等一幫地主，一幫地主熱情的恭維著陳天佑，表明了想要大干一場的意愿。大家一塊吃菜喝酒，賓主各歡。飯罷，陳天佑帶著隊(duì)伍離去，地主們又賄賂了馮禿子，望他在夏收時(shí)多多出力。
李化成帶著隊(duì)伍趕到婁府，處決了婁富貴，找到了奎寧。其他地主看著婁富貴被殺的場面，都是瑟瑟發(fā)抖。呂臻病情惡化，為了不讓李化成看見自己重病的樣子，她留下一封訣別信，獨(dú)自離開獨(dú)立營。李化成等人帶著奎寧回到營地，生病的戰(zhàn)士獲救。大頭欣喜若狂的拿著奎寧奔向汪小小，汪小小露出笑容。而李化成也同樣狂喜的來到呂臻住所，卻發(fā)現(xiàn)呂臻出走，瘋狂尋找后，終于在一處山洞里找到昏迷不醒的呂臻。李化成將她帶回營地，悉心照料。
李化成很擔(dān)心呂臻出事，邊握著她的手哭，邊訴說著自己的真情。他告訴昏迷的呂臻，自己美好的明天就是革命勝利后，他攬著她，去蘇維埃政府領(lǐng)結(jié)婚證。他保證自己種的地是全村最好的，他們再生幾個(gè)小孩，這就是他美好的明天。他哭著請求呂臻一定要醒過來。
胡嫂告別溪兜嫂，準(zhǔn)備去月流向閩西南軍政委員會匯報(bào)游擊區(qū)的情況。駝背被馮禿子威脅后叛變，將溪兜嫂偽造證據(jù)一事告訴了馮禿子。馮禿子向情報(bào)科長告密，揭發(fā)溪兜嫂的共產(chǎn)黨員身份，情報(bào)科長將溪兜嫂逮捕。溪兜嫂誤以為此事是陳天佑所為，大罵著他是叛徒。事后，陳天佑來找了馮禿子，大罵他找死搶自己的功勞，馮禿子不甘心的認(rèn)錯(cuò)，陳天佑威脅他之后離開。馮禿子又來到胡嫂住處，發(fā)現(xiàn)胡嫂已經(jīng)離開。
呂臻病愈，拿出離開營地時(shí)在國民黨軍據(jù)點(diǎn)撿到的一張報(bào)紙，告知大家半個(gè)月前紅軍主力已經(jīng)到達(dá)陜北吳起鎮(zhèn)。李化成提議趁國民黨軍士氣低落，利用晝伏夜出的戰(zhàn)術(shù)把何明仁的數(shù)萬軍隊(duì)拖垮在金豐大山里。獨(dú)立營于深夜時(shí)分對敵軍的薄弱據(jù)點(diǎn)實(shí)施侵?jǐn)_。
夏季攻勢這張網(wǎng)眼看被撕破，而國民黨的先頭部隊(duì)也失利，讓國民黨軍直接損失了一個(gè)連。何明仁有一個(gè)不詳?shù)念A(yù)感，黨國的現(xiàn)在從未像這樣風(fēng)雨飄搖，他不敢往下想。正當(dāng)此時(shí)，何明仁得知溪兜嫂掌握游擊隊(duì)的接頭暗號、時(shí)間及營地位置等信息，立即親自審問溪兜嫂。駝背正在審訊室，向溪兜嫂認(rèn)錯(cuò)，求她說出接頭暗號，這時(shí)接到消息，要把溪兜嫂押進(jìn)山，接受何明仁的親自審問。
陳天佑派馮禿子經(jīng)由下都據(jù)點(diǎn)給何明仁部隊(duì)運(yùn)送物資，馮禿子得知護(hù)送全程都很安全后，欣然答應(yīng)；另一邊，李化成命林木根、王興旺等去往下都據(jù)點(diǎn)“接應(yīng)物資”，林木根一聽要和馮禿子斗爭，立即表示這個(gè)任務(wù)誰也不要跟自己爭。
馮禿子為了“污蔑”陳天佑詐降，殺掉了幾個(gè)跟隨進(jìn)山的保安團(tuán)成員。還發(fā)出“活捉林木根賞50大洋，拿到林木根尸首賞30大洋”的告示。王興旺等人故意綁了林木根來見馮禿子，林木根被帶進(jìn)帳篷，馮禿子看見他后狂笑起來，既得意又猖狂。他正發(fā)狠話要把林木根閹了，再把他的肉一刀一刀割下，突然，外面共軍的槍聲響起，游擊隊(duì)互相配合，馮禿子被林木根親手處決。
參謀長匯報(bào)下都據(jù)點(diǎn)被劫的消息，目的是為了一批物資。參謀長表示這說明山區(qū)里還有大批游擊軍。何明仁再次來審訊了溪兜嫂，何明仁以全國上下呼吁國共兩黨再次合作、聯(lián)合抗日為由，誘騙溪兜嫂將國民黨談判代表帶去獨(dú)立營營地。溪兜嫂受騙上當(dāng)，帶領(lǐng)幾個(gè)“代表”到達(dá)營地后，何明仁派出的大批后續(xù)部隊(duì)沿著“代表”留下的路標(biāo)趕來。溪兜嫂得知受騙上當(dāng)，一把掙開押她的紅軍，快速跑往營地報(bào)信，被國民黨軍槍殺。獨(dú)立營悲憤不已，將溪兜嫂葬了，向她致敬。
王興旺帶人偵查得知，國民黨有一個(gè)團(tuán)的隊(duì)伍，且有多項(xiàng)重兵器。李化成下令摘除“代表”留下的舊路標(biāo)，刻上新路標(biāo)，將敵人困在深山里。并充分運(yùn)用游擊戰(zhàn)術(shù)，在夜晚敵人休息的時(shí)候襲擊敵人，為溪兜嫂報(bào)仇。
國民黨一個(gè)團(tuán)被小小的獨(dú)立營打得抱頭鼠竄，這讓何明仁很憤怒。多次戰(zhàn)敗，讓何明仁不由慨嘆毛澤東是一個(gè)軍事奇才，感嘆共產(chǎn)黨對信仰的堅(jiān)守、游擊戰(zhàn)術(shù)的偉大和古田會議決議的重要作用。何明仁來到空無一人的獨(dú)立營營地，看到營地上埋葬的紅軍戰(zhàn)士的墳?zāi)梗兄斑@是一只什么樣的隊(duì)伍”，惱羞成怒，暈倒在地。至此，國民黨軍夏季攻勢草草收場。
寒冬來臨，何明仁大病初愈，全國上下對國共兩黨團(tuán)結(jié)一致、停止內(nèi)戰(zhàn)、聯(lián)合抗日的呼聲越來越高漲。但蔣介石仍然堅(jiān)持“攘外必先安內(nèi)”的政策，隨后發(fā)生了震驚全國的“西安事變”。何明仁接到衛(wèi)司令電話，得知蔣介石已經(jīng)和共產(chǎn)黨簽署了停止內(nèi)戰(zhàn)、聯(lián)合抗日的六項(xiàng)協(xié)議，但仍堅(jiān)持在停戰(zhàn)命令正式下達(dá)前繼續(xù)對紅軍游擊隊(duì)進(jìn)行“圍剿”。何明仁忿忿不平，他深知就此放過共軍將貽害無窮。激動(dòng)表示，只要一天不下達(dá)命令，就一天不能放松圍剿，決不能讓紅旗在他的眼皮子下繼續(xù)飄揚(yáng)。
閩西南軍政委員會根據(jù)黨中央“聯(lián)蔣抗日”的新方針向全區(qū)游擊隊(duì)發(fā)布命令，命令區(qū)內(nèi)游擊隊(duì)停止對國民黨軍的進(jìn)攻。獨(dú)立營成員們不明白為什么要聯(lián)蔣抗日，這樣對不起他們逝去的英魂。李化成無表情告訴大家，命令就是命令。大家紛紛叫著想不通，李化成斥責(zé)大家想不通也得想得通，他們是執(zhí)行革命任務(wù)的政治集團(tuán)，是黨的槍桿子，必須服從黨的命令。大家漸漸無聲。呂臻宣讀工作計(jì)劃，重申共黨性質(zhì)，宣布增補(bǔ)嚴(yán)家財(cái)為獨(dú)立營營部成員。
共軍執(zhí)行命令，但國民黨軍并未放松對游擊區(qū)的嚴(yán)密封鎖，正值雪天，獨(dú)立營饑寒交迫，再次陷入絕境。陳天佑以土豪劣紳犒勞前線國民黨軍戰(zhàn)士的名義準(zhǔn)備了一批物資，交給了司務(wù)長莊善仁去辦。莊善仁和王興旺暗中通消息，保安團(tuán)的大部分成員已經(jīng)被他們策動(dòng)，天要變回來了。
在深山里生存日久，紅軍一個(gè)個(gè)都像野人一般，留著長頭發(fā)長胡子。唐運(yùn)龍將自己的入黨申請書拿給喜喜看，喜喜從他的入黨申請書中看到了他的心路歷程，申請做他的入黨介紹人，唐運(yùn)龍高興答應(yīng)。大家伙聚在火堆前，暢想著新中國成立的那一天，家家居者有其屋，少有所學(xué)，老有所養(yǎng)，家家幸福美滿。李化成告訴大家，國共決定正式停戰(zhàn)，可以光明正大下山領(lǐng)物資，他們明天就下山。
駝背被陳天佑叫過來，陳天佑告訴他溪兜嫂進(jìn)山第二天被打死之事，駝背不由痛哭，感到自己是作孽。陳天佑給駝背安排了一個(gè)保安團(tuán)的差事。莊善仁帶著被拉攏進(jìn)游擊隊(duì)的保安團(tuán)團(tuán)丁和先前招進(jìn)保安團(tuán)的駝背一起送進(jìn)山去。
李化成帶人堂而皇之來到國軍營地，表示已經(jīng)停戰(zhàn)，他是來商量事兒的。國軍營長看到李化成等人的尊容，不由感慨是幫野人。李化成和國黨營長宋科杰商量讓借個(gè)道運(yùn)點(diǎn)吃喝，李化成軟硬兼施，先說起國共兩黨的同脈同源，后又威脅稱他們紅軍是光腳的。宋科杰終于答應(yīng)讓他們借道。二連順利接到物資，莊善仁歸隊(duì)，駝背認(rèn)罪，保安團(tuán)團(tuán)丁紛紛表示愿意加入紅軍隊(duì)伍。
獨(dú)立營接應(yīng)回程再次經(jīng)過國民黨軍據(jù)點(diǎn)時(shí)，國民黨軍上校接到上峰命令，要利用最后時(shí)機(jī)堅(jiān)決消滅紅軍。雙方發(fā)生激戰(zhàn)，李化成肩胛骨中彈，包括孫大成、唐運(yùn)龍?jiān)趦?nèi)的19名紅軍戰(zhàn)士犧牲，駝背與國民黨軍同歸于盡。危急關(guān)頭，陳天佑帶領(lǐng)被策反的保安團(tuán)及時(shí)趕到，化解危機(jī)。與此同時(shí)，閩北、閩東、閩中地區(qū)的地方武裝、游擊隊(duì)也對企圖繼續(xù)堅(jiān)持內(nèi)戰(zhàn)的國民黨軍發(fā)動(dòng)了一場大規(guī)模的戰(zhàn)役，迫使國民黨軍回到談判桌前，共商抗日大計(jì)。蘇喬民帶領(lǐng)李化成、陳天佑與何明仁談判。在國共兩黨摒棄前嫌、共同抗日的大背景下，獨(dú)立營被改編為國民革命軍陸軍新編第四軍第二支隊(duì)第一團(tuán)，并被授予閩西模范團(tuán)的軍旗，踏上了北上抗日的征程……