第二天大院君離開京城到南部各處巡行，所到之處大受百姓歡迎，甚至一度曾經遭受大院君迫害的儒林書生也敬仰大院君。明成判斷大院君走訪各地聚集民心，起因就是因為王室尚未得到世孫，因此要求世子不得拒絕幫他安排的年輕內人，必須要早日生下世孫才行。大院君走訪各地回到云峴宮的第一個晚上，云峴宮又發生了爆炸事件…
【明成皇后第三部44集：101~144集】
日本的伊藤博文與井上馨，準備將掌握對朝鮮的宗主權征服朝鮮，唯有這樣才能完成日本的理想進出清國。此時，朝鮮引起東學黨之亂，清國借機派軍到朝鮮，日本也打算把握這次機會。甲申政變的主謀金玉均在上海被洪鐘宇暗殺，尸體運回朝鮮，再度遭受凌遲。另外東學黨勢力日益高漲，攻破黃土峴奪取武器，全州城也被東學黨攻陷，士兵們兵敗如山倒，全羅監事金文鉉棄甲逃亡。大院君連夜入宮，再次強調皇后必須退位，改革國家政策，才能扶正國家不至于走向滅亡之途…
袁世凱再三強調清軍登陸朝鮮只是為了鎮壓東學黨之亂，不是為了要干涉朝鮮內政，不過清軍出兵朝鮮也引起日軍也登陸仁川，袁世凱并且揚言如果日軍敢登陸朝鮮，免不了與清軍一戰，如此朝鮮就會成為清日之戰的戰場。東學黨已經占領了全州城并且氣勢高漲，明成派洪啟熏出面與東學黨談判…