一個月之后的一天，武太后突然傳令，當日的早朝改在太極宮正殿乾元殿舉行。這道諭旨看來是某種重大事件即將發生的明顯征兆，一時間驚動了滿朝文武。當文武百官在黎明晦暗的光線下走向乾元殿時，他們不安地注意到，大殿內外增設了御林軍士卒，他們披甲執劍而立，表情肅穆。?像往常一樣，中宗皇帝跟在武皇身后來到乾元殿，也許是他尚未從睡夢中完全醒來，他對于早朝儀式改在正殿舉行以及殿內的緊張氣氛并不在意。中宗皇帝正想登上御座，中書令裴炎從一旁突然閃了出來，伸手擋住了他的去路。中宗顯還來不及詫異，兩名身材高大的御林軍士兵已經上來，抓住了中宗的肩膀。?裴炎宣讀了武后的詔書，即日起廢天子為廬陵王。第二天，武后降旨將廬陵王貶往均州，半個月后又將其流放房州。?根據高宗的遺囑，凡朝廷政事皆由武太后處置。?為了防止出現內亂，武太后立相王李旦為帝，是為睿宗。?令武太后心里別扭的是，李旦對自己即位做皇帝的事情并沒顯出多么興奮，只是平平淡淡地接受。看得出來他根本就不想做這個皇帝。他對母親表示，所有的朝政仍舊聽母親的，他自己不準備做什么。這讓武太后深感失望。李旦進而提出請母親稱制天下，自己寧愿只做個普通的王。武后在失望之余成全了兒子，貶他為皇嗣，自己臨朝稱制。?為防生變，武太后派大臣前往巴州監視廢太子李賢。不久，就傳來李賢自殺的消息。武太后大為震驚，她最不愿發生的事情終于發生了。這是件讓她有苦難言的事情。她知道是誰在背地里逼死了自己的二兒子，而使她永遠背上了逼殺親子的千古罵名。?這時武太后顧不上洗清自己，因為丈夫還停柩在堂。她命令將丈夫的靈柩由洛陽運往長安下葬，自己緊密觀察著朝廷內外的一切動靜。
隨著睿宗旦被廢為皇嗣，武太后正式在洛陽紫帳稱制。她代天子頒發詔書，更改年號和皇旗的顏色，將東都洛陽改名為“神都”，將洛陽宮改稱“太初宮”。并將衙門以官職的名稱再度進行更改。?武太后現在已經六十多歲了，但她看上去依然眉如新月，肌若冰雪。她在分封武氏親族的同時，將大唐王室門閥一一貶往外地。她現在可以有條不紊地進行此事，而不需要察看任何人的眼色。?武太后看中了上官儀的孫女，才名甚高的上官婉兒，想用她陪伴自己左右，助輔政的一臂之力。但群臣皆奏不可，理由是婉兒乃上官儀之孫女，其祖為武太后所殺，疑其挾仇帶怨，恐武太后有不虞之危。?武太后命召婉兒上殿，令她觀朝臣奏表，讓她知無不言，言無不盡。婉兒娓娓道來，言中其弊，簡潔明快。武太后又令其即席著文，修改奏表。婉兒立于武太后之側，文不加點，一揮而就。武太后令眾臣過目，群臣莫不嘆服其才能。?武太后笑言，從即刻起，婉兒就立于朕躬之右，以理國事。事后，武太后問婉兒是否真會挾仇帶怨。婉兒從容以對：臣雖為罪臣上官儀之孫，但知陛下殺我祖非因仇而因罪，那是因為法度，我若因此恨陛下，則是置天下法度于不顧，再者，陛下非一己之身，陛下乃天下人的陛下，我不能因私仇而背天下人之心。武太后對上官婉兒更加信任。?武太后治下的大唐帝國似乎出現了吉祥和瑞的征兆。全國各地報來的祥瑞綠章被刻在青藤紙上不斷送達宮廷，這些綠章的內容讀來饒有趣味，比如，河南刺史的一道綠章聲稱，在河南豐縣有人發現了一顆九穗靈芝；在山西文水縣一群白鵲棲息在縣城外的合歡樹林中三日不去，最使武太后感興趣的還是嵩陽縣令樊文獻上的一枚赤心瑞石。這些綠章既是天降祥瑞的吉兆，又是民心歸附的重要信號。但在武太后心里，總是時時涌起一種不祥之感。
果然，僅僅幾天以后，徐敬業以匡復為名在楊州起兵，起兵之前，還請當時著名的詩人駱賓王寫了《為徐敬業討武氏檄》。這篇文采橫溢的文章很快傳遍了全國。文中將武太后罵了個狗血噴頭。武太后讓上官婉兒給她念了這篇文章，面色沉靜。看完后她平靜地對婉兒說，這是個人才，這樣的人才沒有被發現和起用，是宰相的失職。朝臣們都被武太后的大氣所折服。?武太后并沒有急于發兵平叛，她認為這次叛亂的根源正在朝中，先絕根，后斬蔓才是上策。?武太后將中書令裴炎召到內宮的英賢殿，與他商量平息叛亂一事。早在中宗被廢之時，武太后即對裴炎大失所望。尤其是當武承嗣請求準許建立武氏七廟以追尊武氏宗族時，裴炎表示了強烈的反對。他以不容置疑的口吻說自古以來，尊崇內戚往往導致國破家敗，漢朝的呂后即是一例。裴炎將自己與呂后相提并論，在武太后的心中留下了難以除去的刺痛。尤其是一想到太子賢的自殺，武太后心里在更中怒不可遏。她毫不猶豫地將宰相裴炎斬于都亭。朝臣們不禁感到奇怪，武太后這才說出謎底，當年慫恿李賢謀為不軌，之后又暗使人逼李賢自殺的，都是這個裴炎。人們這才明白武太后有多強的忍耐力。?之后，武太后命令李孝逸發兵討伐徐敬業，徐敬業造反很快就被平息了，而武太后并沒顯出多么欣喜，她對朝臣們說，和我又失去了一個兒子比起來，這一切都太微不足道了。?武太后下令，凡有上堂訴冤者，御史一律不得擱置，要馬上處理。另外，她隆重地頒行《求賢制》，允許天下有德有才之人向朝廷自舉。然后親自寫下文章，普賜臣僚，讓朝臣知道什么是為臣之道。