徐長(zhǎng)明從李行義那里得知李時(shí)珍已經(jīng)死了，斯語(yǔ)等人悲痛萬(wàn)分。大家正在給李時(shí)珍辦喪事的時(shí)候，李時(shí)珍卻奇跡般地回來(lái)了。原來(lái)，李時(shí)珍掉下山崖之后，幸虧被八戒師父發(fā)現(xiàn)。李時(shí)珍與斯語(yǔ)相見(jiàn)，相擁而泣。李時(shí)珍來(lái)到大牢之中看望李行義。李行義已經(jīng)被判處凌遲處死，于是他提出讓李時(shí)珍幫忙，讓他體面地死去。李時(shí)珍設(shè)法給他一杯藥酒，等到行刑時(shí)，李行義已安樂(lè)死去。
嘉靖病愈后看見(jiàn)發(fā)瘋的景王，便交待崔方，讓他離開(kāi)人間少受些罪。然后召見(jiàn)李時(shí)珍，想讓他為自己尋找長(zhǎng)壽之法，但李時(shí)珍卻向皇上提出自己已經(jīng)決意要離開(kāi)太醫(yī)院，回家鄉(xiāng)去安心修本草。嘉靖無(wú)柰，同意讓李時(shí)珍離去。李時(shí)珍離京之前，將一本醫(yī)藥筆記交給徒弟金基泰，讓他帶回朝鮮，將中華醫(yī)藥學(xué)發(fā)揚(yáng)光大。
李時(shí)珍回蘄州后，費(fèi)盡周折將萇葶接回，與家人團(tuán)聚，然后帶著兒子建元和徒弟龐憲等人專心編修《本草》，他們還輾轉(zhuǎn)湖廣、江蘇等地，歷盡千辛萬(wàn)苦，尋醫(yī)問(wèn)藥，為修本草收集第一手資料。萬(wàn)歷六年，六十一歲的李時(shí)珍終于完成《本草》編修，并取名《本草綱目》。
為了此書付印，李時(shí)珍帶著黃一豐東奔西走卻到處碰壁，顧先生出面請(qǐng)王世貞為此書寫序。萬(wàn)歷十八年，金陵藏書家胡承龍見(jiàn)到《本草綱目》，并欣然應(yīng)允出資刻印此書。此后不久，李時(shí)珍和斯語(yǔ)先后去世。
三年后，《本草綱目》全部刻印完畢，萇葶滿意地離去。李時(shí)珍兒子建元將這部巨著進(jìn)獻(xiàn)給神宗皇帝，神宗派使者將《本草綱目》送往大明鄰國(guó)，并流傳至世界各地。《本草綱目》不僅對(duì)中醫(yī)藥學(xué)具有極大貢獻(xiàn)，而且對(duì)世界自然科學(xué)的發(fā)展也起了巨大的推動(dòng)作用。