長葶帶斯語到密室和李時珍相見，自己卻默默離去。
李時珍派金基泰找徐長明幫忙取出藥灌，卻遭到楊洪勤的阻攔，徐、楊兩人鬧翻。李時珍又求萇葶幫助。萇葶以視察太醫院為名，來到太醫院庫房，設法將藥灌打碎帶出宮中，經李時珍查驗，藥灌碎片上果然有毒。
萇葶將藥灌下毒一事上報皇上，嘉靖赦免了李時珍，并責令大太監崔方徹查。經崔方查證，為張惠妃送藥灌的太監已自殺，死無對證，于是將張惠妃身邊的貼身丫頭紫蘭頂罪處死。張惠妃不服，告訴皇上此事一定是楊敬妃干的。嘉靖大怒，下令將楊敬妃軟禁宮中。
張惠妃來到楊敬妃禁宮嘲笑她的失敗，結果反遭到楊敬妃的譏諷。李行義見到楊敬妃被軟禁，心痛不已。
李時珍官復原職回到太醫院。玉蘭為了報復丁冬強告密，假裝與他合作經營美容藥膳。丁冬強上當，按玉蘭給的秘方做出藥膳送于嚴世蕃，結果害得嚴世蕃的小老婆滿臉長豆，嚴世蕃大怒，將百珍齋砸了，丁冬強垮臺。
徐階、高拱來到裕王府，報告德安的景王府已完工，要想辦法讓景王盡快離開京城，好立裕王為太子。嚴世蕃則讓景王說服皇上，以編修《本草》為名留在京城，尋找翻身的機會。
景王找到皇上陳述編修《本草》的理由，聲淚俱下，嘉靖被感動，答應了景王的要求，并讓李時珍協助景王完成此項大計。李時珍決定再相信一次景王，和他一起著手編修《本草》。就在景王想一展宏圖之時，李行義出現在景王府，有意透露出皇上仙丹已煉成，皇上還會再活三百年。景王一聽覺得自己再無機會當皇帝，于是決意謀反，暗地里拿編修《本草》的經費四處收買殺手。
由于楊洪勤按嚴世蕃的要求給裕王藥中下慢性毒藥，裕王終于病入膏肓。楊洪勤作為主治醫官，被關入大牢。嚴世蕃答應很快就會救他出來。
徐長明找到李時珍，讓他為裕王治病。景王卻以修《本草》為名反對其為裕王治療，被李時珍拒絕。