鹿兆鵬讓白靈先跟鹿兆海轉移，他為根據地取完消炎藥，隨后就去和白靈匯合，白靈讓鹿兆鵬給他們即將出世的孩子取個名字，鹿兆鵬稱不管是男孩還是女孩，都叫天明。
一早，鹿兆海找到鹿兆鵬藏身的房子，他才知道自己的嫂子竟然是白靈，鹿兆海看著身懷六甲的白靈，吃驚地不知如何是好，他轉身就要離開，鹿兆鵬趕忙追上來解釋，鹿兆海回身狠狠揍了他一拳，鹿兆鵬站在原地，讓他盡情打自己出氣。
白靈趕忙過來解釋，她是真的愛鹿兆鵬，鹿兆海委屈地質問鹿兆鵬，他明明知道自己喜歡白靈，而且還一直在等著她，怎么就能忍心拆散他們，并且大聲指責鹿兆鵬就帶白靈過這種短暫而未知的生活，根本不是真的愛她。鹿兆鵬羞愧難當，只能連連道歉，并且表明他和白靈是經歷了生死，絕望與關卡，互相扶持走到現在，他們倆的感情是認真的。鹿兆海氣得火冒三丈，他聲明從今天起再沒有哥哥了，鹿兆海剛要離開，鹿兆鵬跪下懇求他，救出白靈和孩子，鹿兆海內心掙扎了片刻，只好答應鹿兆鵬的請求。
由于叛徒一連幾天帶著特務抓捕共產黨，給地下組織造成很大傷害，鹿兆鵬接到任務除掉叛徒，可是叛徒非常狡猾，臨時改到東門出城。鹿兆鵬蹲守在東門的時候，看到鹿兆海和白靈乘坐黃包車就從他身邊走過，白靈依依不舍地望著鹿兆鵬。
鹿兆鵬看到汽車被劫停，他舉槍擊斃了叛徒，他也不幸中槍，白靈聽到槍聲，想返回去找鹿兆鵬，鹿兆海緊緊抱住她，提醒她要為孩子著想。眼看守軍就要關閉城門，鹿兆海強行拉著白靈離開。
守城門的士兵攔住鹿兆海，他一氣之下氣得打了士兵一大耳光，他們才順利出了城門，白靈一直不放心地回頭張望，直到城門被緊緊關閉。
白嘉軒和族里的老人正在商量村里修水渠的事，他提議每家每天都要出勞力，鹿子霖急匆匆來到祠堂，埋怨白嘉軒不叫他，白嘉軒氣得要趕他走，不許他參加族里的會議，鹿子霖指責白嘉軒是公報私仇，白嘉軒讓他當眾說明自己報的什么私仇，鹿子霖無言以對，悻悻地離開。
鹿兆海趕著馬車護送白靈路過白鹿原，白靈真想回去看看白嘉軒，可是她不能回去連累家人，鹿兆海得知是白靈拿磚頭砸的陶部長，對她佩服有加，覺得自己冒險護送她也值了，鹿兆鵬覺得白靈懷孕不能餓著，就提議去她姑姑家吃點飯。
姑姑看到白靈欣喜若狂，她想把白嘉軒叫來，讓他們父女見一面，白靈趕忙阻止了姑姑，朱先生讓她帶著兒子朱懷仁給白靈做點熱飯。朱先生看著白靈，心中不免感慨當年的小女孩現在也要當孩子媽媽了，朱先生得知鹿兆鵬在城里和叛徒開戰，可能九死一生，就問起孩子的名字，白靈很心痛地說叫天明。朱先生贊嘆白靈砸的不光是一個陶部長，還有投降派和軟骨頭，又親手寫了?“白鹿精魂”?這幅字送給白靈，盛贊她就是白鹿原的白鹿。
此時，田福賢帶白嘉軒和鹿子霖來到白鹿書院，白靈和鹿兆海趕忙躲進屋子里。鹿子霖和白嘉軒爭執不下，只好來找朱先生評理。白靈隔著窗戶看到自己年邁的父親，激動地眼淚不停地流。鹿子霖堅持要留下來吃飯，并走進屋子，他突然看到鹿兆海和白靈，嚇得趕緊出來。鹿子霖要拉田福賢和白嘉軒離開，白嘉軒還想找朱先生給他們評理，鹿子霖表示不用朱先生勸解了，他承認是自己錯了，并不停地和白嘉軒賠禮，急忙拉他們倆回去喝酒。白靈看著父親離開，心中百感交集，鹿兆海想拉白靈的手，可還是忍住了。隨后，白靈和鹿兆海離開了白鹿書院。
鹿子霖請田福賢和白嘉軒喝酒，他連連賠不是，白嘉軒卻一言不發，田福賢聲明，岳維山讓他天天盯著鹿子霖和白嘉軒，如果不能活捉鹿兆鵬和白靈，自己就得被砍頭。等田福賢走了以后，鹿子霖一把拉住白嘉軒要今天的飯錢，因為都是為了保護他閨女白靈不被田福賢發現，白嘉軒才知道停在白鹿書院的馬車是鹿兆海送白靈的，白嘉軒埋怨他不早點說，然后急急忙忙趕往村外。
鹿兆海依依不舍地和白靈告別，她想知道鹿兆海還恨不恨鹿兆鵬，鹿兆海聲明，自己恨他，這一點永遠無法改變，鹿兆海只想知道還能不能見到白靈，她表示三五年內恐怕不行。臨走前，鹿兆海緊緊摟著白靈，心中愁腸百轉，鹿兆海自己知道，這世上再沒有人能讓他動心了，他永生不娶。
白嘉軒遠遠地看到白靈又被人接走了，直到看不見女兒的身影。白靈被安全轉移到龍灣村一個大娘家里，大娘一家人已經成功安置了二十三個女同志，大娘的兒子是地下黨，兒媳種地做飯，他們倆還有一個兒子叫狗子。
白孝文因為白靈的事被停職審查，他向白嘉軒不停地發牢騷，指責都是鹿兆鵬把白靈帶壞的，并且試探著問白嘉軒知不知道白靈還懷了鹿兆鵬的孩子，他想從白嘉軒口中套出白靈的下落，白嘉軒早看出他回來的目的就是盯人。
白靈以為鹿兆鵬兇多吉少，整天悶悶不樂，大娘從區上的同志口中得知鹿兆鵬受傷住院了，就不停地安慰她，白靈得知鹿兆鵬已經安全脫險，她激動地抱著大娘喜極而泣。
田福賢帶人把鹿子霖從地里帶走，白嘉軒很緊張，又聽白孝文說鹿兆鵬在西安城鬧事，被打傷，估計是活不成了，白嘉軒焦急萬分。
鹿子霖的家被團丁看管起來，只要一天找不到鹿兆鵬就不放他們出來，白嘉軒不顧團丁的阻攔，強行闖進鹿子霖家，并且大聲喊他親家，鹿子霖和媳婦都不敢相信，別人躲著都來不及，白嘉軒竟然還能來自己家，鹿子霖對白嘉軒感激涕零。
第二天，田福賢和白孝文眼睜睜地看著白嘉軒來叫鹿子霖下地干活，田福賢明知道白嘉軒是騎在自己頭上拉屎，可是也無可奈何，白孝文也無奈，他很清楚白嘉軒什么都不怕，他們倆對白嘉軒都束手無策。
很快，白靈的預產期到了，她正在分娩的時候，縣里保安團來龍灣村大肆搜捕逃出來共產黨，他們來到大娘家使勁砸門。
白靈被迅速轉移到地窖，保安團進來搜查的時候，大娘正在為白靈接生，她強忍著撕心裂肺的劇痛，不小心發出痛苦的呻吟，團兵很警覺。這時候，狗子故意大聲哭泣，掩蓋了白靈的聲音，團兵搜查無果只好離開。
白靈順利生下一個女兒，母女平安，大娘抱著白靈的女兒鹿天明，夸她仁義，她一聲也沒有哭，躲過了大搜查，大娘一家也都替白靈高興，大娘告訴白靈，她之前接生的二十三個孕婦，只有三個孩子跟著母親一起走了，其他的都讓鄉親們認領了。鹿兆鵬醒來的第一件事，就是打聽白靈和孩子下落。
日本帝國主義加緊對中國的進攻，南京政府步步投降，北方四省繼東北之后淪亡了，共產黨發布了動員全民抗戰的宣言，號召國內外工農，軍政，商學各界男女同胞們，為祖國生命而戰，為民族生存而戰，為國家獨立而戰。白靈和同志們一起學習了這份激動人心的宣言。
白靈要趕往橋山根據地，她不得不把女兒鹿天明留給大娘撫養，大娘一家送白靈離開，她把朱先生寫給她的字讓大娘交給鹿兆鵬，然后含淚頭也不回地離開了。
轉眼幾個月過去了，白靈在根據地取得了很大的進步，不但學會了紡線，織布，射擊，還教戰士們學文化，受到大家的尊重。鹿兆鵬傷愈回到橋山根據地，廖軍長熱情地歡迎他歸隊，不巧的是白靈和高大鵬連長一起出根據地執行任務去了，鹿兆鵬決定等她回來，廖軍長對白靈大加贊賞，根據地的戰士們都在唱著白靈交給他們的歌。
鹿兆鵬來到白靈的房間，看到她給孩子做的小衣服，鹿兆鵬拿出她繡的白鹿手絹，心中感慨萬千。白靈和高連長一行四人順利完成任務，在返回根據地的路上，發現山坡上埋伏了土匪，高大鵬決定先不動聲色地繼續走。隨后，高大鵬向山上沖鋒，白靈負責掩護，他們與土匪們展開激戰，很快將他們擊敗。
廖軍長帶鹿兆鵬來見畢政委的時候，畢政委當面指出鹿兆鵬的弟弟鹿兆海在中央軍當營長，白靈的哥哥白孝文在保安團當營長，他不想新三十六軍再延續之前的悲劇。
畢政委得到情報，紅軍的主力正在向章坪鎮進發，眼看紅軍就要大會師了，廖軍長很開心。由于紅軍對這里人生地不熟，畢政委建議派一個人連夜去接應紅軍進入章坪鎮，鹿兆鵬主動要去執行這個任務。
白靈和高大鵬他們押著土匪俘虜得勝歸來，得知鹿兆鵬剛剛出發去迎接主力紅軍，白靈很失落，她急忙追出去，大聲喊鹿兆鵬，并把女兒出生的消息告訴他，鹿兆鵬讓她等自己回來。
鹿滿倉從賀家村的百姓口中聽到傳言，共產黨的部隊都打到章坪鎮了，他們要來報仇，他繪聲繪色地講給村民們聽，大家都議論紛紛。田福賢聽說這個消息，立刻召集各村的鄉約和族長開會，讓他們都回去制止謠言，鹿子霖按照田福賢的提示，聲明自己和共產黨勢不兩立，如果鹿兆鵬回來，他不但報官，還要把他捆到岳維山那里，田福賢讓白嘉軒也說兩句話，他嚴厲地拒絕。
白靈一邊幫戰士們縫補衣服，一邊向高大鵬描繪著他們一家三口團聚的幸福生活，高大鵬欲言又止，他實在不忍心破壞白靈的好心情。正好畢政委派戰士找他有緊急任務，高大鵬就匆匆離開了。
田福賢派保安團的兩個團兵端著槍守在白家門樓前面，白嘉軒不顧白孝文的反對，讓鹿三去后院拿出梭鏢，冷秋水把孩子交給白孝武，跟著白嘉軒一起出來，把團兵們罵跑了。田福賢聽到這些很氣憤，覺得白嘉軒讓他丟人，揚言要除掉他，鹿子霖好言相勸，不讓他和白嘉軒計較，田福賢聲明自己是為了保護白鹿兩家，才派人守著，可是白嘉軒卻不明白自己的良苦用心。
根據地正在召開支隊長以上的會議，白靈作為廖軍長的機要秘書，想進去做會議記錄，高大鵬勸她不要進去。原來，他們幾次出去執行任務，都遭到敵人的阻截，畢政委一直懷疑有內奸，決定對隊伍進行審查。
畢政委在全體戰士的大會上宣布，由于隊伍中混進奸細，造成根據地的一舉一動都暴露在敵人的眼前，以及同志們無謂的犧牲，隊伍受到沉重的打擊，今天開始清算。沒想到他們竟然對白靈羈押，還進行審查，并警告她不許居功自大，說清楚自己的問題，白靈問心無愧，并拒絕回答他們的問題。
廖軍長讓畢政委放了白靈，因為她是立過大功的人，而且堅信她和鹿兆鵬都是堅定的共產黨員，可是畢政委卻解釋，他之所以羈押白靈，只是為了禁絕右傾思潮的冒頭，并不是拿她當潛伏特務，廖軍長和畢政委據理力爭。
白靈得知他們竟然對付廖軍長，氣得火冒三丈，堅持要去找畢政委理論。高大鵬連夜救出白靈，要把她安全送出去。戰士發現白靈逃跑，急忙追出來，白靈讓高大鵬去自己的床底下拿出包袱和手槍，去找鹿兆鵬來自救她，她就等在原地被抓了回去。
鹿兆海回到白鹿原，氣急敗壞地來找田福賢算賬，并威脅要崩了他，田福賢向他說明，白鹿兩家都出了這么大的共匪，還能平安無事，都是自己在保護著。隨后，鹿兆海來找白嘉軒，白嘉軒覺得田福賢還算有良心，否則他和鹿子霖早就挨整了。白嘉軒感謝鹿兆海平安送走白靈，他猜到孩子也該生下來了，得知鹿兆海也很難見到白靈，他很心痛，白嘉軒拿出白靈小時候穿戴的東西，讓鹿兆海設法轉交給她。
高大鵬等到鹿兆鵬，把包袱和手槍交給他，鹿兆鵬和高大鵬馬不停蹄地趕回根據地救白靈。這時候，敵人沖進了根據地，并把崗哨都破壞了，廖軍長下令將羈押的同志都放出來，并給他們發槍。鹿兆鵬和高大鵬看到根據地方向已經打起來了，可是他們沖不過去了，鹿兆鵬心急如焚。
橋山根據地的三十六軍戰士們被打得措手不及，他們拼命與國民黨的部隊展開激戰，白靈也和戰士們一起奮勇向前，與敵人浴血奮戰。鹿兆鵬冒著槍林彈雨不顧一切沖向陣地。
畢政委身受重傷，白靈要背他撤出陣地，眼看敵人在他們的四周瘋狂轟炸，畢政委懇求白靈一槍把他解決了，不能把他留給敵人，白靈拼命拖著他往外撤，鹿兆鵬趕到陣地，他聲嘶力竭地大聲喊白靈，白靈剛答應一聲，只見炮彈飛過來，白靈應聲倒地，被炸身亡，鹿兆鵬一下子驚呆了，他的眼前浮現出白靈小時候的天真快樂，以及青春叛逆的白靈為了去城里讀書，誓死與白嘉軒抗爭，還有經過鍛煉堅強的共產黨員白靈，后來為了執行任務和鹿兆鵬做假夫妻的白靈，往事一幕幕在鹿兆鵬的眼前閃現，他悲痛欲絕。
一早，白嘉軒冒著鵝毛大雪急匆匆來到白鹿書院，他把晚上夢到白鹿的事告訴朱先生，沒想到白靈的姑姑也在夜里夢到一頭白鹿鉆進地縫里，他們不知道，因為白靈犧牲了，白鹿也就隨之消失了。
1937年，抗日戰爭全面爆發，日軍的戰機從白鹿原上空呼嘯而過，村里的老人聽說日本人見村子就燒，見男人就殺，見女人就糟蹋，再加上山西和河北的百姓都到原上逃荒，村民們都惶惶不可終日。
白嘉軒把族里的壯勞力都召集到祠堂，和他們商議組建民團，白孝文從保安團調來幾桿槍，白嘉軒讓他們在下地之余和白孝文學習打槍，隨時準備自衛。白孝文知道中央軍和日軍交過幾次手，都傷亡慘重，他勸白孝武對白嘉軒的話就聽聽算了，如果日軍真的打下陜西，那國家也就沒了。
國民黨命茹師長和鹿兆海的十一師出潼關，死守中條山。臨行前，鹿兆海特意來找朱先生替茹軍長求一幅墨寶，他以為鹿兆海他們是閑得無事把玩一下，態度很不屑，當他得知鹿兆海他們馬上出潼關趕往中條山去打日本人，還要把他的字掛在軍帳里面，朱先生很慚愧自己對鹿兆海的誤解，他很清楚中條山是潼關最后的大門，鹿兆海聲明會不顧一切堅守中條山，否則無顏回來見朱先生以及關中父老。
朱先生深受感動，立刻揮筆寫下蒼勁有力的“砥柱人間是此峰”，并咬破手指在條幅的下面按下血印，鹿兆海跪謝朱先生，并發誓要用日本人的一桶血來賠償朱先生，他意味深長地告訴鹿兆海“王師北定中原日，家祭無忘告先生”。
鹿兆海不想父母擔心，就不再回白鹿原，鹿兆海拜托朱先生把那枚銅元交給白靈，銅元他們倆一人一半，誰拿著就欠對方半個，朱先生也不想讓白靈欠他的，鹿兆海擔心銅元落在日本人手里就污臟了，朱先生只好答應幫他保存，并讓他再回來的時候帶一撮鬼子的毛發，而且是他親手打死的鬼子的毛發。
白嘉軒來和鹿子霖都老了，也不再劍拔弩張，他們倆的關系也緩和了，白嘉軒來到戲臺上找鹿子霖，他正無聊地看景，白嘉軒聽說前幾天有個貨郎去他家了，就猜到一定是幫鹿兆鵬送信的，鹿子霖深深地嘆了一口氣，說鹿兆鵬又跑到山西去跟小鬼子干仗了。白嘉軒很羨慕他，兩個兒子都扛著槍和日本人干仗，盛贊他是滿門忠義，鹿子霖猜到鹿兆海曾經回來過，他很生氣鹿兆海不來告訴自己，白嘉軒意識到自己失言。鹿子霖仰天長嘆道，鹿家沒人了，絕后了，白嘉軒提議讓白孝文和白孝武認他當干爹。
鹿兆海的十一師在中條山和日本鬼子展開浴血奮戰，鹿兆海牢記朱先生的囑托，每打死一個鬼子，他就揪下一撮毛收起來，戰士們越戰越勇，很快打退了日軍幾十次的進攻，成功地堅守住中條山。
山寨的兄弟們和黑娃都向大拇指強烈要求下山和鬼子轟轟烈烈地開戰，大拇指把兄弟們打發走，推心置腹地和黑娃說起，他年輕的時候也以為家國天下，他現在只想帶著兄弟們踏踏實實過日子，黑娃笑話他慫。大拇指認為黑娃無論跟著共產黨還是國民黨，都會樹敵，黑娃要組建自己的隊伍，大拇指卻擔心黑娃這一腔熱血早晚會害了他自己。
由于鹿兆海的十一師不是國民黨的嫡系部隊，把他們派往中條山的時候，配得只是漢陽造，而國民黨的中央軍都是美式裝備，蔣介石根本沒想到他們能堅守住中條山，就擅自斷了他們的軍餉，還冠冕堂皇地聲稱是讓他們撤回來休整。戰士們都氣不過，他們不怕流血犧牲，就怕有人在背后捅刀子，紛紛扔掉軍帽，脫掉軍服要離開。鹿兆海擔心他們會被扣上臨陣脫逃和妖言惑眾的罪名，受到軍法處的嚴懲，命令他們把軍裝都穿好，他懇求茹師長向上面求情，茹師長也無可奈何，他很清楚，上面之所以斷了他們的軍餉，就是為了調他們回去和共軍開戰，鹿兆海氣得咬牙切齒。
廖軍長決定派鹿兆鵬去延安匯報工作，并特批他去龍灣村看女兒，高大鵬和他一同前往延安，他們來到龍灣村的時候，鹿兆鵬緊張地不敢進們，他是怕鹿天明長得太像白靈了，他心里難受，可是大娘帶著鹿天明躲進山里了，他沒有見到。突然，遠處傳來一陣密集的槍聲，原來是國民黨部隊來襲擊龍灣村。
日軍戰機轟炸白鹿原，村民們都嚇得驚慌失措，落荒而逃，他們一窩蜂擠進祠堂，白嘉軒讓他們一個一個給祖宗上香。白孝文看到村民們都聚在一起，擔心炸彈來了把大家全炸死，白嘉軒卻覺得大家在一起還可以壯膽，白孝文堅持要把村民疏散。
突然，一顆炸彈掉落在祠堂里，白孝文和白嘉軒馬上疏散村民們離開，可是過了很久，炸彈也沒有炸響，白孝文和村民們都百思不得其解，白嘉軒卻覺得是先人在保佑大家，日本人炸不了他們，村民們全部跪下來拜謝先人。
田福賢和白孝文商量，想找一個明白人把炸彈弄出來。正在這時候，原上來了一輛軍車，他們都以為是來拆炸彈的，沒想到那個軍人送來的卻是鹿兆海陣亡訃告。田福賢不敢交給鹿子霖，就先拿給了白嘉軒，鹿子霖湊過來看到兒子陣亡的消息，他一下子癱軟在地，白嘉軒趕忙扶住他，鹿子霖傷心欲絕，哭得死去活來，他掙扎著要和日本人拼命，田福賢和白嘉軒死死拉住他。突然，祠堂里的炸彈炸響了，村民們來不及躲避，都被炸暈，等他們醒來的時候，眼看濃煙滾滾，祠堂被炸成了廢墟，村民們哭喊聲響徹白鹿原。