一路跋山涉水過后，眾人總算來到云南地界，也趁此之際，孟無染作為一家之主，率先代表孟家發表感慨，同時拿出一份名冊，逐一進行點名，其中包括李冬來李冬來，而他流浪多年，終于有了歸宿。
孟海棠獨自來到山上栽種樹苗，幸得她精心呵護，才能繼續得以生長。恰巧身后傳來腳步聲，孟海棠急忙回頭望去，隱約看到穿著空軍軍裝的人影，起初誤以為是張啟，定睛一看才發現是曾念喬。
在面對孟海棠的追問，曾念喬沒有透露張啟的下落，只是代為轉交張啟開之前寫好的書信，亦是一封遺書。當孟海棠坐上火車的那一刻，忍不住淚流滿面，而在信的內容里，全都是表達著張啟對于赴死報國的決心。
盡管沒有等來夢想的和平，但是張啟相信遲早有一天會打贏這場仗，也幸好自己能在活著的時候，保護百姓們安然無恙，只希望帶著戰火、災難，以及一切的黑暗而去，只留下最美好的送給孟海棠。
當天夜里，孟海棠坐在窗前給張啟回信，永不忘記他在海棠樹下笑容，也慶幸遇到對方，從此愛上天空和飛行。隨后的日子里，復華大學等多所學校落戶云南，大批南遷的學者在這短暫的歷史中，放射出耀眼的光芒，他們踏實做事，低頭做人，潛心學問，靜心育生，在此期間所產生的的各種思想文化，也可以算作是文化精神上的抗戰。
張啟和曾念喬為丁母尋得一處院落，可讓她在這邊安心居住，同時認拜對方為義母，代替丁煥生為其養老送終。凌問岳夫婦在收拾文物時，品鑒了猿人頭骨化石，怎知當地村民看到后，不由大驚失色，顯然是將他們當作吃人的怪物。
村里的小孩巖泰失蹤，大家懷疑起復華大學的老師，集結眾人前去算賬。凌問岳攔住情緒激動的村民，為他們耐心解答頭骨化石的出處，幾個特務趁機溜進學校里，康攬杉和孟海棠立馬用木箱堵住房門。
張啟得知復華大學出事，匆忙趕了過去，看到特務用石頭砸窗，于是開槍喝令他們停手。孟海棠疑似聽到張啟的聲音，可又不敢開門瞧個究竟，反倒是槍聲吸引了白督辦的民兵團，此時張啟早已離去。
許媛茵帶著李冬來沿跡尋來，看到面色蒼白的張啟，并且發現他似乎不想讓孟海棠知道自己還活著的消息。而在另一邊，巖泰因為溜進學校偷吃，以至于睡過頭沒有回家，如今水落石出，白督辦斥責大家對老師的無理，同時告誡他們以后不許鬧事。
考慮到學校之后的安全問題，孟無染希望白督辦派兵剿匪，順便讓人手保護學校，以免附近山匪過來鬧事，畢竟里面保存許多珍貴文物以及古籍善本。白督辦故作為難，表示此需從長計議，還得先寫信向蔣介石匯報，一層一層復核，等到批準方可。
孟無染看出白督辦是故意找借口，實則想要在復華大學開辦師資班，于是當場答應了下來，也允許他將自己的兒子送來學校。與此同時，陸子儀讓徐特聯系白督辦的手下，咬死是村民鬧事，以免查到自己頭上。
李冬來攙扶張啟回到住處，意外與母親重逢相認。到了第二天早上，丁母為張啟下廚煲湯，引起李冬來的不滿，認為她對張啟勝過親生兒子。但是丁母知道張啟與丁煥生是過命交情，況且這段時間對自己多有照顧。至于孟海棠通過許媛茵得知張啟還活著，急忙下床去找她，怎知還沒出門，曾念喬已將她攔下。
李冬蘭并不待見張啟，也不認同他這位義兄，反倒得知孟海棠日思夜想的戀人正是對方。曾念喬從外面進來，期間透露自己已經見過孟海棠，阻止她來找張啟。而李冬來為孟海棠抱打不平，意外了解到大哥的死與張啟有關，于是追問前因后果。
張啟沒有閃爍其詞，如實承認自己將丁煥山丟給日本人，果然此話一出，李冬來怒不可遏，丁母急忙上前勸阻。考慮到丁母在旁邊，張啟提議去外面單獨交談，曾念喬實在是不放心，所以跟著來到樹林里。為了平息李冬來的憤怒，張啟拿出一枚紀念幣，決定效仿丁煥山的方式，倘若出現“航空救國”的字樣，便由李冬來結束自己的生命。
而接下來的結果毫無懸念，李冬來一怒之下拔槍對準張啟，奈何遲遲下不去手。反觀張啟正大光明地直面槍口，講述了丁煥山犧牲的過程，臨死之前只有一個要求，就是希望李冬來以后能成為像丁煥生這樣的男人，行得正坐得端，無愧于天和地。
最終李冬來抬手朝空中開槍，痛恨自己無能，在他發泄過后，平息了內心的仇恨，與張啟冰釋前嫌。孟海棠暫時無法與張啟見面，唯有將懷念寄托于風鈴，可父親居然考慮要給她安排親事，孟海棠為此果斷反對，獨自來到山上對著樹苗傾訴心事。張啟跟著曾念喬回部隊，途徑山下看到孟海棠，不由深受觸動，急急忙忙跑了過去，聽見孟海棠祈禱自己平安的話語。
久別重逢后的二人，格外珍惜當下，張啟也不再有任何隱瞞，款款深情地表達著對于孟海棠的愛意。當初在他見到孟海棠第一面，便已愛上對方，只不過礙于面子，所以謊稱是飛行員意外拍下的照片都放在飛機里，事實上是他個人的私心。陸子儀派人扮作黃包車夫，直接將蕭鴻恩拉到郊外。
徐特作為陸子儀的傳聲筒，命令蕭鴻恩從此之后負責監視凌問岳的一舉一動，并且要極力阻止他編寫考古論文。本來蕭鴻恩沒有答應，甚至認為考古論文利于國家豐富歷史文化，沒有任何壞處，可陸子儀出面回答了蕭鴻恩的疑惑。
因為在日本人看來，凌問岳的論文是否定日本文化關鍵之證，隨時都會激怒日軍政府，使得中日關系越發緊張，戰爭沖突明顯。陸子儀早已查到蕭鴻恩曾在日本留學，甚至加入日本軍國特務組織盤龍社。其實蕭鴻恩早年根本不知道盤龍社的性質，以為是純粹的革命組織，可即便如此，還是難以為其洗白，一旦曝光就極有可能背負漢奸的名聲。
蕭鴻恩不希望龍珍珠知道這件事情，被迫同意為陸子儀賣命，幫助他尋找武丁甲。這天張啟等人重聚，結伴去山里散心，曾破山趁著大家都在，于是當眾向許媛茵求婚，令在場所有人羨慕不已。如今曾破山已升為機長，至于張啟還在養傷階段，旁人都不知具體情況，唯有孟海棠通過曾念喬知道張啟體內的子彈。
孟海棠也宣布自己繼續深造學業，決定要用畢生精力推動以及普及女性學識教育，這一想法得到大家的支持，張啟更是為之驕傲。在這亂世之下，能夠再次相聚已是不易，大家站在鏡頭前，合影一張。待所有人結伴返回時，發現黎教官已在復華大學門口等候多時，原來是想邀請曾念喬一同去看電影。
凌淺櫻看到這一幕，心里醋意翻騰，而其他人也都覺得氣氛尷尬微妙，曾念喬找了個借口先離開。孟海棠帶著張啟回家，同時將風鈴下的從軍姓名牌交給他，表示自己之前在杭州灣撿到，現在也算是物歸原主。
張啟并沒有收下，而是讓孟海棠繼續留著，承諾之后會繼續給她做風鈴。此時凌淺櫻過來通知張啟，代替父親邀請他過門一聚，張啟告別孟海棠之后，便獨自來到凌家，主動向凌問岳詢問武丁甲的下落，從而得知武丁甲丟失之事。
通過凌問岳的講述，張啟知道陸子儀在暗中追查武丁甲下落，如今陸子儀正為日本人做事，所以張啟和曾念喬決定要率先一步尋回武丁甲。正當張啟和曾念喬交談此事，忽然察覺到有人藏在樹后，怎知對方竟是李冬來，一臉自豪地表示自己做了件大事，緊接將武丁甲交到張啟手里。
幸好武丁甲失而復得，張啟批評李冬來以后不許再有行竊之事，但是考慮到金至烈藏起武丁甲，故意給所有人設下一個大局，意味著武丁甲的重要性，所以決定先由他來保管，暫且不還給凌問岳。
龍珍珠來到昆明，第一時間去見了蕭鴻恩，透露自己將要上大學讀書。蕭鴻恩笑著應和，并未完全放在心里，殊不知她真實身份乃是白督辦的親生女兒，本名叫做白珍珠，這次也是按照黨組織命令，表面是進入復華大學，實則暗中保護凌問岳。
孟海棠陪著曾破山選購結婚的布料，未曾察覺樓上有何異樣，反倒是龍珍珠站在二樓窗戶，等著店老板忙完才與其交接情報。曾穆長途跋涉總算是來到昆明，奈何他衣衫破爛，像極了乞丐，慘遭當地小伙子欺負。
曾穆眼看著隨身攜帶瓦罐都被小伙子搶走，這一路在后面追趕，碰巧遇到許媛茵和凌淺櫻，便向二人求助，再三強調絕不可打開瓦罐。盡管凌淺櫻初到云南沒多久，卻很清楚當地的民風，于是計上心來，故意透露里面有令人喪命的蠱毒，果然大家聽到后轉身就跑。
雖已拿回了瓦罐，曾穆依舊是心有余悸，從未想過云南民風猶如強盜，光天化日之下搶東西。待曾穆安頓好住處，與張啟等人討論飛機改造，提升其性能，而張啟也從中得到了啟發，最終決定西山號成為曾破山的座機，叮囑他銘記無論戰況如何，該返航時必須返航。
舉辦婚禮的前夕，曾破山親自為許媛茵做好秋千，和她憧憬著未來，許媛茵也希望此刻不變，親朋好友能永遠在一起。曾家父子們圍桌把酒言歡，過往恩怨消失殆盡，曾穆催促大兒子曾念喬盡快操心自己的婚姻大事。
奈何曾念喬在感情方面太過木訥，根本不懂得主動，反倒是他在弟弟和父親的提醒下，才意識到黎教官對自己有意。而在另一邊，凌淺櫻和孟海棠為許媛茵布置婚房，談話間提及孟海棠應該盡快跟張啟考慮婚事，不過孟海棠覺得只要彼此心里有對方，無所謂何時結婚，況且她還要在學業上深造。
看著孟海棠一臉幸福的模樣，兩人忍不住八卦她和張啟之間的感情，追問她是從何時喜歡上對方。孟海棠仔細回想，覺得應該是在日軍轟炸醫院當天，她第一時間想到張啟的安危，于是跑到海棠樹邊祈禱張啟能夠平安歸來，沒想到居然應驗，內心說不出的喜悅。凌淺櫻依稀記得之前曾有大師算出孟海棠的未來丈夫身上有海棠花，這讓孟海棠篤定自己與張啟是命中注定。