蓋聶抓住被彈開的天明，二人有驚無險的將所有炸藥填裝完畢。班大師讓幾名秦兵聽自己的口令，同時點火。月兒在帳內把玩天明送的人偶，代表天明的那個人偶突然出現了異常，掉落在地攔腰折斷。月兒預感天明有難，喊著天明的名字，向子午嶺跑去。
通向其中一個支點的導火索突然熄滅，張良分析會導致炸不開山體，更糟糕的是重心改變，想要再勘測支點就會更難。為了成功炸毀山體，天明催動玉煞之力攀上山體，用火把直接引燃了炸藥。山體爆破，天明被炸開的石塊彈開。危急時刻，月兒的記憶瞬間恢復，想起了與天明一起經歷的所有事情。眾人四處尋找天明，被埋在土石下，失去了意識的天明，聽到月兒的呼喚，積蓄全身的力量一躍而出。天明正在為月兒恢復如初高興之際，月兒突然吐血暈倒。
蓉兒查看月兒的身體后，發現她的體內也有一股力量橫沖直撞，但玉珪與玉煞的力量完全相反，一直在侵蝕月兒的身體。天明不忍月兒受折磨，要去咸陽找羲氏一族救人，被蓋聶攔下，二人爭執中，月兒醒了過來。月兒讓天明發誓，永遠不要去找羲氏一族，天明答應下來。蓋聶和蓉兒也安慰天明一定會想出辦法來。
蒙恬將子午嶺工程提前完工的消息八百里加急傳給秦王，趙高將奏章念出，秦王大悅，擬旨賞賜蒙恬，卻對扶蘇只字不提。趙高看出秦王雖明著貶黜扶蘇，可實質上是在暗中栽培他，為他當儲君鋪路。趙高跟云中君說，再不動手就晚了。
蒙恬在慶功宴上向扶蘇、蓋聶等人敬酒賠罪，并對扶蘇大家夸贊。蓋聶推測秦王將扶蘇至于十萬大軍之中是為了歷練他，并非壞事。蒙恬也對扶蘇表出忠心，愿為他赴湯蹈火。
趙高假意關心秦王身體，從太醫口中套話，得知秦王如果經常煩悶和動怒，就會加速身體惡化，即使是太醫也回天乏術。趙高回到陰陽家，召集所有手下，部署眾人按計劃行事，并派大司命去完成第一件事。
大司命帶領手下在東郡制造異象，使村民發現寫有“始皇帝死而地分”的巨石。縣長見大事不妙，命人趕快上報朝廷。
太史令匯報說夜觀星象時發現熒惑守心的大兇之兆，趙高也趁機稟報巨石異象之事，秦王聽后大為震怒，身體立刻出現不適。秦王臥病在榻，趙高說有個博士做了首真仙人詩，可以讓天下人傳唱化解眼下的不吉之事。
計劃的第一階段完成，趙高十分高興，讓大司命和云中君分頭落實接下來的計劃。大司命在郊外截住了秦王的特使，讓他們把一塊玉璧帶給秦王，并在說出“今年祖龍死”后，大笑著消失無蹤。秦王聽完匯報，認為山神鬼怪不足為信，卻在查看玉璧時，發現是自己八年前巡游祭祀時沉入江中的那塊。秦王一時激動，倒仰過去，連呼“天要亡朕”。
眾臣來到秦王病榻前，請求他早立太子，秦王將臣子們趕出了屋子。秦王在榻上輾轉難眠，云中君說找到了辟除不祥的辦法，建議秦王東巡祈福。秦王命趙高去安排出巡事宜，并準許胡亥請求陪同照料。
月兒讓照顧自己的蓉兒幫忙把天明轟走，天明已經有很長一段時間沒有見到月兒，求蓉兒告訴自己實情，蓉兒說月兒是怕與天明相見，會讓彼此更難過。天明失落的離開，蓉兒不忍，讓他趁月兒睡著時進屋偷看一眼。天明見到熟睡中虛弱的月兒，用手捂住嘴巴，咬牙痛哭。
蓋聶和蓉兒找到了在柵欄邊哭泣的天明，蓉兒說月兒的病超出了醫術的治療范疇，天明不愿眼睜睜看著月兒死去，要去找羲氏一族救她。
蓋聶認為趙高陪秦王東巡祈福，咸陽城的羲氏一族正處在無主的狀態，只要單獨找到大司命或者月神并說服他們，救月兒的事情就會有轉機。蓉兒還是不放心，蓋聶交代天明遇到事情不要魯莽沖動，要記著月兒在等著他回來。天明囑咐蓋聶等人幫自己瞞著月兒后，策馬直奔咸陽。
東巡的路上，秦王身體一直不適，喚趙高給自己拿仙丹吃，并命令將服用次數提升為一日五次。
天明偷偷潛入趙高府中，四處探查下，發現了通往陰陽家的機關。守門的侍衛給素影（月神）送飯，天明跟蹤后掰斷門鎖進入停棺室，見到素影正在用手扒飯吃。天明讓素影告訴自己解救月兒的辦法，卻被精神失常的她當做碧華。見素影這條路行不通，天明踏上東巡之路，想要找到大司命。
蓉兒為月兒針灸，盡力延緩她的病情。
秦王由于大量服用仙丹，導致身體越來越差，預感自己命不久矣，寫了一封詔書封入竹筒，命趙高八百里加急送往上郡。趙高當著秦王的面，念出詔書所寫“命公子扶蘇以兵屬蒙恬，與喪會咸陽而葬”。見趙高行事忤逆秦王大怒，卻發現自己突然失聲。趙高假傳旨意，命隊伍全速返回咸陽，詔書由自己保管。秦王抽出藏于王座下的寶劍，想要斬殺趙高，最終體力不支倒地而亡。
蒙恬將蓋聶與扶蘇請到帳中，說收到趙高的信函，得知秦王正在返回咸陽,扶蘇推測秦王病情嚴重。按照慣例，秦王應該發詔書讓扶蘇趕回咸陽，以備不測，可到現在什么動靜都沒有，蒙恬擔心發生變故。扶蘇要安排人手去探虛實，蓋聶想要幫忙，被扶蘇勸回。蒙恬告訴蓋聶，扶蘇從小就生活在對秦王的恐懼中，他們永遠都無法體會到他的感覺。
天明一路上風餐露宿快馬加鞭，終于找到了東巡的隊伍，發現營地的附近有陣陣惡臭。天明假扮士兵，混進了隊伍中，見到四處都在晾曬臭魚。天明潛入大司命帳中，用劍逼迫他告訴自己救月兒的方法。大司命告訴天明，玉珪的力量一旦被開啟，就不會被任何東西阻止，眼下玉珪只打開一部分，雖不足以喚醒玉煞之力，卻會要了高月的命，自己也是無能為力。天明失神，將劍丟在地上。想著少司命如果還活著，應該不愿見到天明傷心，大司命說自己有辦法讓月兒多活一段時間。
大司命正要說出自己的辦法，突然聽到有人進入，大司命將天明藏進柜子里。趙高揮退大司命，與丞相李斯談論秘不發喪后，下一步該怎么辦。李斯認為應該通知長公子扶蘇早點回咸陽主持大局，趙高告訴他自己將始皇立扶蘇為太子的遺詔扣押在手中，他認為由胡亥繼位更合適。李斯反對趙高擅作主張，不愿與他沆瀣一氣。趙高告訴他，自己在數日前已經派人傳詔上郡，告知立胡亥為太子，命扶蘇自盡謝罪。在趙高的威逼利誘下，李斯只得同意了他的安排。
趙高接見了扶蘇派來的使臣，想要用三言兩句將其打發走，使臣堅持要當面稟報始皇，趙高以皇帝臥病為由拒絕了他的請求。使臣決定當晚趕回上郡，李斯心虛，擔心他猜到皇帝駕崩之事，趙高贊李斯心思縝密，立刻派人前去追殺使者。
趙高和李斯離開后，大司命將天明從柜子里放出，并將少司命的混元珠交給他，告知讓高月貼胸佩戴，可以暫時抵御玉珪之力的侵蝕，但最多可以延長三年的壽命。
天明離開始皇的隊伍后，一路快馬加鞭追趕扶蘇的使臣，無奈追上時，使臣已經遇害。使臣拼盡最后一口氣，讓天明趕快將皇上駕崩的消息告訴扶蘇。
扶蘇和蒙恬接到趙高送來的假圣旨，圣旨上說公子扶蘇身為人子而不孝，刺劍以自裁；蒙恬身為人臣而不忠，一并刺死。蒙恬不信始皇會下如此命令，要求驗璽印。經驗證，璽印是真的，扶蘇不知趙高已經掌握了玉璽，只得跪地領旨。蒙恬仍然不信，與使臣拔刀相向，被扶蘇攔住。蒙恬要扣押使臣，率兵護送扶蘇回咸陽與始皇當面問個清楚。扶蘇悲觀的認為無論怎么做都是徒勞，蒙恬說自己愿揮師攻入咸陽，取下趙高的狗頭，以正國法。扶蘇不愿引起戰亂、骨肉相殘，決意領旨，蒙恬大嘆公子糊涂。蒙恬找到蓋聶等人商議，說自己要去咸陽面圣討說法，托蓋聶保護扶蘇的安全。
傳旨的特使被蒙恬的士兵拘押，大發雷霆，誰也沒有留意到有兩個趙高派來的殺手已經偷偷離開了營帳。其中一名殺手，趁扶蘇給始皇寫信之時潛入帳中，逼扶蘇自裁。危急時刻，蓋聶趕來將殺手擊斃，另一名殺手見到同伴被殺，四處大喊扶蘇殺人，意圖謀反。特使帶來的士兵與蒙恬的士兵呈劍拔弩張之勢，蓋聶要帶扶蘇離開，扶蘇執意不走，爭執中，扶蘇被趙高手下的弩箭射傷了肩膀。扶蘇不忍將士們自相殘殺，揮劍自殺，臨死前仍然囑咐蒙恬輔佐胡亥善待天下百姓。
天明一路奔襲，終于回到了子午嶺，卻得知扶蘇已死。天明將得到的情報告訴蓋聶，被一心想要為父報仇的子嬰聽到，子嬰不顧蓋聶的阻攔，執意回咸陽報仇。
蒙恬被趙高用奸計囚禁于陽周，失了兵權。東巡車隊回到咸陽，胡亥主持發喪，而后順理成章登基繼位。趙高任郎中令，自此權傾朝野。子嬰被送回咸陽，為了讓趙高放下戒心，不惜裝瘋賣傻，口吞碎碗。
扶蘇死后，墨家失去了輔佐的目標，蓋聶也因再失益友而整日借酒澆愁。劉季講了自己的故事，開導蓋聶可以反抗暴秦，挽救天下。
蓉兒見不得蓋聶再次消沉，說這個世界并不適合所有人，勸他跟自己隱居。