玉林秀厲責行森，說勸誘皇帝出家，必將引起宮廷震怒，殃及佛門，但行森力辯，死不改意。順治有意禪位玄燁，問玄燁敢不敢做皇帝，玄燁態度堅決。順治令魏承謨擬“罪己詔”，魏承謨無奈之中只好從命。玉林秀見行森頑固到底，只好搬用佛門法規火燒行森。順治令人給他剃度，奴才均不敢應承，蘇麻喇姑站了出來，替他剃了頭發。索尼等眾大臣在旁監督火燒行森。行森面無懼色，一意孤行。順治趕到現場，意欲救行森，眾大臣卻跪下請皇帝下旨。順治無奈之中，只好眼睜睜看著行森被燒死。魏承謨宣讀由他筆錄的順治退位的《罪己書》，眾大臣力主不應該將其公之于眾，孝莊太后卻令加上三條罪己條文，明示天下，并公告清始祖順治皇帝龍御歸天。順治遁入空門以后，法名行癡。玄燁即位，是為康熙皇帝。
康熙即位儀式，本由帝師魏承謨司儀。但鰲拜等權臣以魏承謨是漢人為由，提議應由滿人吳良輔即鰲拜的干兒子執掌，孝莊皇太后為了穩定政權局勢，只好妥協，改由良輔主持皇位登基，并封鰲拜、索尼、遏必隆、蘇克沙哈等四人為侯爵，主持朝政。公元1661年，八歲康熙正式登基。鰲拜大肆圈占土地，魏承謨上奏訴清查，康熙令索尼徹底清查，索尼則提議應以蘇克沙哈主持此事。鰲拜與遏必隆等開始結黨，索尼則居中觀斗。鰲拜派人捕走康熙侍衛，康熙大怒。康熙命魏東亭免去陪讀之職，管帶鰲拜派來的新的侍衛。在朝政上，鰲拜、遏必隆等權臣借口不愿意與奸黨同朝，站在大殿外拒絕入內，威逼康熙，而索尼又稱病不朝，魏承謨只好稱疾請退出朝政，康熙無奈準請。魏承謨退出朝政之后，鰲拜方才進入大殿，稱捕走侍衛乃是因為他們在后花園內舞弄刀棒拳腳有違祖規，并已斬決。康熙震怒，鰲拜又稱此等人在宮廷內散布先帝未死而是去當和尚等謠言，罪當斬殺，康熙只好憤然宣布退朝。
鰲拜得寸進尺，向孝莊皇太后提議改換帝師，稱魏承謨告他圈地乃是誣陷，孝莊皇太后為大局計，準鰲拜所請，同意鰲拜提議的帝師人選，但同時又要鰲拜提議魏承謨出任外省巡撫。康熙將鰲拜捕殺侍衛之事記恨在心，魏東亭終于為他尋得一個報復的機會。吳良輔為了給義父鰲拜的生日送賀禮，偷竊宮廷寶物，被康熙抓住，并以監守自盜為名，棒責吳良輔。鰲拜領來新任帝師濟世拜見孝莊皇太后，卻被告吳良輔被棒打，火速趕往，吳良輔已死。濟世跪地請命，康熙只好稱師，但對他教學不滿，濟世卻以先帝之師要挾。孝莊提醒康熙，濟世并非等閑之輩，要把他當作磨刀石，磨練自己。