劉伯溫之死讓馬皇后悲痛萬分，立命玉兒燃香送葬歸鄉，而淮西將領們點炮歡慶，只有呂昶和宋濂披孝跪送于城門。朱元璋為劉伯溫被陷害而傷感，并命立刻起程返京。朱元璋的返京讓胡惟庸揣測其用意，并立命各部清理政事避露馬腳，但當胡惟庸得知李進奉朱元璋之命每日一奏時頓感大難臨頭。
朱元璋頒布《詔示J黨錄》昭告天下，歸京的李善長見勢不妙急忙離開，可二虎已等其后，李善長被抄家關押原府，并剝奪爵位待審，期間宋濂也被逮捕關押。朱標為眾臣求情，并提及母后之意，可朱元璋卻以荊棘為訓，為扶植朱標煞費苦心，可朱標仍然無法理解朱之苦心，心中徒增恐懼，回宮途中朱標難忍壓力投河自盡幸被救起。
眾皇孫臣子跪于馬皇后床前悲哭，卻被朱元璋喝之門外，馬皇后的死讓他難以接受，他不斷呼喚著馬皇后，而馬皇后的寂靜讓他嚎啕大哭，朱元璋的哭聲叫聲震驚了眾人，朱標難以承受昏了過去。朱元璋因傷心欲絕而變得神志不清，他砍傷二虎不許其他人接近馬皇后的遺體，朱標的哭喊終于喚醒了朱元璋。