由于被炸藥炸傷，英格瑪神父沒辦法再站立，他只能坐在輪椅上讓法比推著他到處走。蘇菲等人問法比如果下水道挖通，英格瑪神父是否會跟他們一起離開，法比表示教堂不能沒有神父，神父只能留在這里。蘇菲接著問他是否會跟大家走，法比堅持他得留下來照顧神父。
怕日軍發現關根死在教堂的事情，李全有與楊柔淇趁天黑把關根的尸體挖了出來，存放在教堂后院的棺材里。
隔天楊柔淇與李全有在以前二人藏著的棺材里拿東西準備離開教堂，由于動作慢，日軍已經開始往埋尸坑里埋土，棺材也被埋了進去，楊柔淇拿出李全有隨身的利刃本打算在被日軍抓到前自殺，李全有勸她先別輕舉妄動，棺材被徹底埋進埋尸坑里，楊柔淇與李全有就這樣被活埋了。
黑巖久治同意費馳接走英格瑪神父，以英格瑪神父年邁身體差為由，他想看看美國人的教堂沒有了美國人還要怎么繼續。法比挖地道時突然暈倒，蘇菲等人誤以為他猝死，都哭著叫法比醒過來，玉墨湊近一看發現法比只是太累而睡著了。
日軍們在教堂門前來回推著坐在輪椅上的神父玩，英格瑪神父被推得暈頭轉向，他們卻以此為樂。法比出來制止他們，他們一次次地踹開法比，不許他護著神父。
玉墨幫法比照看神父，她與神父聊起天來，神父告訴她法比被拋棄過兩次，一次是親身父母，一次是神父的朋友，他的朋友把法比托付給他，神父就獨自把法比拉扯大。玉墨表示她被賣到藏玉樓前也曾來到過教堂，沒過多久她就被繼父賣掉了。
為了處理尸體，黑巖久治讓手下往下水道里倒骨灰。南京淪陷的第四十天，大家依舊堅持不懈地挖著地道，法比挖著挖著挖出一條十字架項鏈，他想起來那正是阿顧的項鏈，接著他看到了阿顧的手，法比被嚇得尖叫出聲。
黑巖久治派人送信給費馳，讓費馳去教堂接走英格瑪神父。法比叮囑神父到了安全區也要好好吃藥，二人離別時神父告訴法比天堂見。
法比改變了想法，他希望j女們能代替女學生們去參加日軍的慶祝晚宴，除了玉墨外，j女們的反應都很大，春池大喊道她們要活著，憑什么她們要替女學生去，法比自知理虧，他原地不動站在那里任春池與玉簫對他又打又踹。本以為來到教堂只要乖乖地躲著就能活下去，她們也為教堂付出過，現在卻攤上這樣的事，玉簫與春池甚至站上了鐘樓頂打算跳樓自盡也不要去晚宴。
玉墨的反應很平靜，即使被紅綾等人斥責，她也擺出一副無所謂的表情。女學生們商量后表示只要法比讓她們干啥她們就去做，就算去赴晚宴都無所謂。
紅綾不肯老實地呆在地窖，她哭著告訴喬治她想活下去，春池等人都無依無靠無牽無掛，可是紅綾不想與喬治分開，更不想死，早知道在教堂躲著也難逃一難，她就不該跟玉墨來教堂。
黑巖久治要求與孟司長繼續合作，已經看清形勢的孟司長知道再這樣下去也是繼續為日軍效命，他不肯答應黑巖久治的要求。
黑巖久治對孟司長的態度很不滿意，他掏出槍指著孟司長的頭，要求他下跪。孟司長被迫下跪，但他不肯向黑巖久治低頭。
黑巖久治要求孟司長把孟書娟手里的膠卷要出來，孟司長不肯并表示消滅膠卷又怎樣，日軍別奢望他們犯下的罪行不會被人知道，現在掩埋尸體不過是掩耳盜鈴，黑巖久治生氣地拿槍射向他。
奸計得逞黑巖久治便帶著手下來到教堂，他把給女學生們準備的衣服拿給法比并讓她們準時去赴晚宴，法比雖接過衣服，但他不打算讓女學生們赴宴。黑巖久治臨走前讓手下把教堂院子里的坑挖大一些，好埋更多的尸體。
紅綾喊著不想跟她們去送死便跑到教堂后院，喬治在后面追著她跑，兩人誤打誤撞地跳進了下水道，一開始兩人以為找到了新通道便開心地在里面大叫玉墨等人的名字，想讓大家從這個下水道里一同逃出去。兩人在下水道里探路，結果沒走多久就遇到了被鎖上的鐵門。
晚上法比與玉墨為大家準備了豐盛的晚餐，法比甚至為每個女學生都倒了一杯紅酒，讓她們品嘗一下紅酒的滋味。好似最后的晚餐，玉墨勸大家吃好喝好，晚上就能做個美夢，最好夢到戰爭結束。玉墨讓法比抱住她，這是他倆相識的第49天。
紅綾與喬治繼續在陰冷的下水道里前行，兩人的體力都幾乎透支，可四處依舊是鐵柵欄，喬治把頭伸了進去，紅綾想為他把門打開，但倆人用盡了辦法依舊拽不開鐵門。
玉墨為孟書娟梳頭，孟書娟問玉墨愛情是什么，玉墨告訴她自己見到第一個愛上的男人，他在玉墨面前所有動作都慌慌張張的，玉墨喜歡這樣的人，愛她愛到癡，但這不是真正的愛情，真正的是愛她愛到死，玉墨想起了戴濤并流下了熱淚。
黑巖久治帶著手下包圍了教堂，他打算過一會兒就讓手下沖進教堂進行掃射。法比預料到黑巖久治不會輕易放過他們，他把壓箱底的地雷、炸藥和槍都拿了出來，門脅以為法比要殺了他，法比把槍銷毀隨后給門脅松綁讓他逃出去，門脅逃出教堂告訴日軍同伴們快跑，法比拿地雷與炸藥把教堂炸毀，門脅明白法比放走他，是不想他一起陪葬。
黑巖久治本想拿走孟書娟手里的膠卷，再把教堂里的人滅口，沒想到法比用了這樣的方法，這倒也省得他去找膠卷。黑巖久治看著熊熊烈火中的教堂，讓手下收拾好槍支彈藥回總部，教堂被毀，他的任務也算完成了。