1948年底，東北全境解放，西南區成為了國民黨在大陸最后的依托基地，西南長官總署是西南區的特務機構，這里的每個人都做著反共復國的美夢。為了全力確保西南四省的局勢，一夜間，各路人才被秘密調入西南區，西南長官總署也迎來了由上峰欽點的機要秘書-陳少杰，他自稱父母死難于1937年日軍的轟炸。
陳少杰，代號青松，其實是我黨長期潛伏在國民黨內部的“超級特工”。因為“阿三事件”被緊急喚醒的他，三年來多次為我黨力挽狂瀾。因為西南區的交通站接連受到國民黨的重創，陳少杰憑著自己的經驗與智慧通過了情報處長邵文光最后的生死考驗，陳少杰在跳舞時并沒放松對邵文光的觀察，他的舞蹈贏得一片掌聲。邵文光一張張地查看著從記者那里搜來的照片，他在眾多照片中發現了需要的，而所張最熟悉的身影也是他不想看到的。
陳少杰見邵文光沒回來就十分擔憂，他必須采取非常手段以防止情況惡化。陳少杰拿起邵文光桌上的照片時被邵文光拿槍從后面指住，三年來沒有陳少杰看不到的情報，邵文光沒有當場擊斃陳少杰，而正是這個機會給了陳少杰反盤的機會，他趁機用李輝的槍打死邵文光，李輝在毫無嫌疑的情況下將李輝嫁禍成臥底。陳少杰前往西南區，繼續著自己的潛伏任務，陳少杰這個名字并不是他的真名，從潛伏那天起他扮演著一個死人。陳少杰提前一天到達西南地區到藥店見到接頭人何掌柜，接頭過程中胡大夫的緊張表現讓陳少杰有所留意，胡大夫通知了梁海棠，何掌柜告訴陳少杰那個備用聯絡地點。
西南長官總署，這個神秘的特務機構匯聚了國民黨內的一流人才—?“書生殺手”譚一波，“情報專家”曾誠以及“美式特工”余漢群，還有和國民黨高層師出同門，老謀深算的處長周方淮，和這個機構緊密聯系在一起的江湖富商喻仲深……官場規則，權錢交易，江湖道義，爾虞我詐等等復雜形勢接踵而至，而更為兇險的是，等待他的還有三年前的幾乎至自己于死地的老對手“傳奇特工”梁海棠。陳少杰到達西南區伊始，便面臨著巨大考驗，提前一天秘密到達的他，剛剛與組織接頭就險象環生：因為地下黨聯絡員胡大夫的叛變，使得交通站被梁海棠擊破，負責人老魁被殺，何掌柜被梁海棠抓獲，陳少杰自己也險些被抓。陳少杰趕到淮陰路28號，他看到那里已被特務監視，看到挑糞工后他心生一計，陳少杰扮成挑糞工去了接頭地點，進屋后他將窗戶和窗簾拉開，這才讓地下黨同志們安全轉移，等國軍趕到時他已經安全離開。
陳少杰在江城站被西南總署的曾誠接上車，到西南總署后陳少杰見到了處長周淮方，周淮方二十年前和陳少杰父親一同念書，兩人后來分別從軍和經商。梁海棠見到陳少杰后很意外，陳少杰從她的眼神中看出敵意，他知道遇上了老對手，梁海棠對他記憶猶新。1945年，軍統的“傳奇女特工”梁海棠利用潛伏的特務阿三，幾乎要一舉擊破我黨在東北的地下組織。關鍵時刻，突然趕到的國民黨聯合公署情報處秘書陳少杰卻以抓捕共黨為名擊斃了阿三，布置了半年的計劃就這樣功虧一簣。惱羞成怒的梁海棠正準備著手調查陳少杰，卻因為一紙調令，被迫離開東北，這也成了她心中深埋的一根刺。梁海棠從沒有停止過對陳少杰的懷疑，究竟是出于女人的直覺還是職業本能，梁海棠自己也難以分辨，她望著陳少杰離開的背影想起了昨天從現場逃走的人，還向周淮方說起當時的情況。
梁海棠懷疑陳少杰是共產黨，還猜想他可能提前到達，梁海棠想讓陳少杰自證清白。陳少杰跟著曾誠來到住所，曾誠向他問起1940年參加培訓班的事情，曾誠當年培訓沒結束就離開了，他對陳少杰有些面生，曾誠想看當時的照片時陳少杰假稱把它弄丟，陳少杰沒想到曾誠也參加了那年的培訓班，而且曾誠還保留當年的合照，陳少杰必須做出行動。
梁海棠對何掌柜進行嚴刑拷問，還拿出陳少杰的照片讓他看，何掌柜一口咬定沒見過。陳少杰趁曾誠上班時來到他家，他伺機將那張合照偷走，曾誠突然歸來，陳少杰慌忙躲在門后藏起來。梁海棠和陳少杰舉槍相向，曾誠將他們分開，周方淮將何掌柜交給陳少杰審問，還給他一把槍，陳少杰看到何掌柜受傷的身軀來到眼前時知道這是他們對自己的考驗，兩人用唇語對話后陳少杰假裝審問，他們的談話都在監聽之中。
何掌柜和陳少杰在審訊室里發生爭吵，何掌柜選擇了犧牲自己來保全陳少杰，梁海棠和周方淮聽到槍聲后趕去審訊室，陳少杰留下槍后離開，這一槍可以證明了陳少杰的清白，梁海棠擔心這是他們的苦肉計，但周方淮確認就是陳少杰開槍的。陳少杰開車去了郊外，他失聲大叫起來，他需要和組織上取得聯系。陳少杰帶著東西來到周方淮家中，周夫人看到那副翡翠麻將后十分高興，他還把八大山人花鳥圖送給周方淮。
富商喻仲深突然來到周方淮家中，言談間陳少杰看出周方淮是想把他培養成和喻仲深之間的紐帶，周方淮幫喻仲深追回一棟房產的房契，喻仲深表示感謝。曾誠來到周方淮家中說起有密電要他查看，周文淮將他叫到房間里，譚一波還沒看到上面內容，周方淮讓曾誠通知人員按預計時間行動，周夫人想把梁海棠介紹給陳少杰。
梁海棠得知周方淮要介紹陳少杰時讓她很意外，她堅決不同意。曾誠對譚不波不滿，他找陳少杰傾訴，曾誠因酒喝多而趴在桌上睡著了。陳少杰很清楚，他此時做的唯一一件事情是要除掉邵文光，他扮成醫生來到邵文光房間查房，梁海棠趕到時看到徐醫生在檢查邵文光的身體，陳少杰趁機藏在床下，梁海堂命人給邵文光換房間，當她得知還有一名醫生進入病房后就四處查找，陳少杰沒能得手，他趁機逃走。
譚一波將保護邵文光的方案交給周方淮，梁海棠聽到陳少杰背地里罵她時出門爭吵起來，曾誠一直打著梁海棠的主意。梁海棠命人調查了西南局幾名軍官那天晚上的去向，唯有曾誠和陳少杰值得懷疑，梁海棠找到曾誠問起昨晚去向，他將和陳少杰喝酒的情況講出。陳少杰想到何掌柜受傷時給他說的話，他通過電波和老魁取得聯系。
組織上讓老魁全力配合陳少杰，是梁海棠策反了胡英全，陳少杰將何掌柜為掩護他才自殺的情況說明。陳少杰將棘手之事告訴老魁，老魁準備派人執行刺殺任務。在醫院的邵文光突然手開始動起來，但還處于昏迷之中。周方淮安排陳少杰和梁海棠吃飯，飯后梁海棠讓他送自己去醫院，在路上陳少杰看到招工的牌子，他知道老魁要行動了，陳少杰決定將計就計，他帶梁海棠去了高級餐廳。
梁海棠點了最貴的菜和陳少杰一起吃，吃飯時陳少杰見到了喬燕和余漢群，陳少杰和喬燕目光相視之時雙方都認出對方，陳少杰在餐廳里故意拖延時間，梁海棠稱邵文光已被轉移，醫院里只是為共產黨準備的陷阱，梁海棠要等著共產黨自投羅網，陳少杰想去營救他們。老魁帶人去了醫院里行動，遇害到盤問時他們將看守殺死，但他們來到邵文光病房時遇到伏擊。陳少杰故意氣走梁海棠，他之后騎摩托車去接應老魁等人。
梁海堂到后追趕老魁和陳少杰，陳少杰帶著老鬼慌忙逃走。逃跑途中陳少杰和梁海棠交手，幸好陳少杰蒙面，陳少杰趁機和老魁逃走。陳少杰打斗之中胳膊負傷，他將老魁帶回家中。曾誠喝多酒后來到陳少杰家中，老魁聽到有人進門后急忙躲藏起來，曾誠倒在床上就睡起來，他聞到了房間的味道。