亞連所彈奏的旋律帶來奇跡，使得方舟再生了。而亞連等人也平安與分散各處的神田、柯洛利重逢，心中充滿了喜悅。可是，高興的不是只有亞連他們而已，在遠方祈禱大家平安的亞洲分部跟總部的同伴們也十分開心！
黑教團總部因亞連等人平安歸來而歡欣鼓舞。但這種氣氛，卻被中央廳派來的特別監察－－瑪耳歌姆．C．魯貝里亞給澆了盆冷水。魯貝里亞來到此處召開克勞斯的質詢會議，會上提出了許多克勞斯至金所犯下的惡行，但克勞斯卻始終不放在眼里。
中央已經開始了對庫洛斯與亞連的監視，教團里的人們對于亞連的事情都開始議論紛紛，而亞連對于自己與“第十四人”的關聯也十分困惑。黑布拉斯卡對于李娜莉神之結晶的檢查有了結論，和AKUMA一樣神之結晶也有了進化的跡象，科學班的成員正在加緊對于“卵”的調查，而露露貝爾帶領著數目眾多的AKUMA已經侵入了教團。