大唐盛世，兩個異域裝扮的胡人抬著一頂上鎖的箱子跑進胡人的地盤，卸鎖后，里面走出一位公子裝扮的女子。只見她鎮定自若地走向一旁蒙了白布的尸體，掀開白布略微碰觸幾下，便得知了死者的死因。見女子判斷出了死因，暗室的門打開，幕后主使讓女子說出真相。但女子卻不慌不忙地坐下擦手，原來她是一名法醫，被這伙人綁來驗尸。她戲謔地要求先談攏酬金，還猜到了這伙人會拿師傅來威脅自己的把戲，原來師傅是個好賭的賭徒，這次又輸給了別人五百文，這才生出了今天的事端。
為了解救師傅，女子只得答應這群人的要求，她稱尸體渾身紫斑，胸骨軟弱無力，是由于肋骨斷裂，而腹部鼓脹是由于淤血堆積，由此可見，死者是因五臟俱損而死。但說出死因后，這群人卻變卦了，他們認得女法醫是蘇州城冉家大小姐，但冉姑娘卻稱自己和父親沒關系，可那伙人還是咄咄逼人，要求還錢。幸好冉姑娘機靈，使詐用銀針刺向守衛，帶師傅跑了出來，但那伙人不肯善罷甘休，一路追來，竟把師徒兩人逼到江邊。
師傅跳水，但冉姑娘水性不好，獨自被留在江邊，幸好此時出現一黑衣人，用一把劍將這伙人全部收拾，還逼問首領隋侯之珠的下落，原來他就是殺害那具尸體之人，在首領吐露珠子在柳粲手上，于今晚酉時清酈館街頭。
而此時朝廷上，皇帝也在尋找這隋侯之珠，也剛得知這珠子現在在柳粲手中，他賜予蕭侍郎先皇賜予的匕首，代表著絕對的忠誠與信任，派其去追尋隋侯之珠。
江邊胡人將領被殺死，冉姑娘不慎墜江，此時追兵也趕來，黑衣人將追兵打落水中，便也跳入水中。黑衣劍客在水中將追兵解決后，本欲不管女子，獨自上來，卻碰巧看到繡著“冉顏”閨名的絲巾，于是將其救起。
蕭侍郎已趕到了蘇州城，等待柳粲的出現。
冉頌被送回家，蘇醒了過來，卻不記得是誰救了自己。這時丫鬟晚綠帶來了后娘逼婚讓其嫁給蘇家庶子的消息，冉頌還想像之前一樣拖著，但晚綠卻說蘇家過幾天就來迎親。冉頌立馬反應過來想逃，卻發現這次戒備森嚴，但冉頌并不慌張，直奔后門聯通的糧倉。進了糧倉，冉頌將面粉潑灑得到處都是，然后拿來火折子投了進去，炸前來尋看的后娘和妹妹滿身面粉，而其也趁亂逃跑了。
蕭侍郎派出自己的手下飛揚跟蹤目標任務柳粲，卻被柳粲發現擊昏。但蕭侍郎還是憑借推理推斷出柳粲晚上大概率會出現在清酈館，提前去蹲守。而冉頌一路擺脫追來的家奴，竟闖入蕭侍郎沐浴的房間，一頭扎進池中。冉頌聞出蕭侍郎正在沐浴藥湯，推斷其有頭疼之癥，還用手指為其按摩了片刻，然后趁蕭侍郎反應不過便又一次奪門而出。
白天的黑衣人也來到了清酈館蹲守，而冉頌的妹妹聽聞冉頌藏身此處，也來攪局。柳粲果然出現在此，但周圍皆是各方耳目，于是柳粲三言兩語打發了依約前來交易的對象。而冉頌尋來了一身青樓中的衣裙，慌張地躲避搜尋，亂跑之間撞到了白天的黑衣人，便恰巧目睹了有人趁著奪人眼球的表演，殺了柳粲，而白天的黑衣人第一時間趕到尸體旁拿走了珠子。而蕭頌晚了一步，只得下令封鎖清酈館，緝拿搶走珠子之人。
而冉顏被妹妹發現，關回了自家馬車，而白天的黑衣人正藏在馬車中，他以劍威脅冉顏不得出聲，而正巧蕭頌下令徹查馬車，冉顏與蕭頌再次相見，為保車中人不被發現，冉顏指出柳粲真正死因，轉移中人注意力，而車中的人也趁機從馬車后窗逃跑，最終只給蕭頌留下一個空盒。
而冉顏等人因此事被扣清酈館，蕭頌讓其幫忙驗尸，就不追究之前馬車藏人之過，冉顏提出驗完尸后馬上放自己走并收取驗尸費一百文的要求后，便熟練地開始準備。而蕭頌這邊也查到了冉顏的基本信息：其為冉家滴女，卻獨自住在別院，通曉醫術卻不愿做鈴醫，甘愿以驗尸為生，十分奇怪。而冉顏的驗尸手法也很獨特，她并未直接選擇開膛破肚，而是引來螞蟻置于尸體之上，通過螞蟻的走向得知死者死于頭頂插針。
冉顏對死因的分析讓蕭頌對其刮目相看，但冉顏卻對這個高高在上的官大人沒什么好感，不禁出言譏諷，蕭頌也不是個吃素的，你來我往幾句話間竟把債賴掉了，冉顏氣不過，決心一定把債要回來。
得知了柳粲的真正死因，蕭頌派人搜尋兇器銀針的出處，屬下則稟明一則新線索：柳粲每次來杭州都會住在故人臨客棧，于是一行人立馬趕到柳粲下榻處，而當初藏在冉顏馬車里的黑衣人也跟著來到了客棧。蕭頌在柳粲住房內發現了有人偷偷入侵的痕跡。
冉顏賭氣也自行查起了案件，她威脅清酈館的媽媽，想要摸清神似死者被殺時在臺上跳舞的舞女凝香的底細；而另一邊蕭頌提審了幾個清酈館藝JI，得知柳粲住的房間擺設很像凝香的房間，而在臺上跳舞的舞女身型也極像凝香，于是蕭頌也把注意力放在了凝香身上。原來凝香人美擅舞，心地善良，柳粲每次來都會打賞凝香，清酈館眾人都為凝香傾倒，連雜役王倫也對其情有獨鐘，還多次在凝香危險時及時搭救于他，但是凝香于一年前被砍得血肉模糊，王倫拿所有積蓄后葬凝香，而后也離開了此地，而凝香也被葬于山下的千年香樟樹下。
冉顏認為如果自己能找出凝香真正死因，定與此案相關，說不定就能從蕭頌處拿回剖尸的報酬。冉顏來到凝香死時的房間，根據墻上暗藏的血跡，發現凝香并非死于此處。而蕭頌勘查出現場后，發現現場沒有打斗痕跡，貴重物品也沒有遺失，證明凝香并非如同官府所說被土匪入室而殺，而是另有隱情，而此人怕是想要借助這次的案件讓凝香案能被重新徹查。
蕭頌忙趕到凝香葬身之處，不料冉顏已經搶先一步，開始驗尸。蕭頌對冉顏的驗尸技術十分贊賞，但屬下卻覺得她狡猾異常。冉顏發現凝香并不是如官府預判的被勒死，而是被匕首捅死的，蕭頌看時機差不多成熟，便現身把尸體和冉顏一起帶回了衙門。
在蕭頌的假意威逼下，冉顏沒出息地慫了，乖乖驗尸并把結果告訴蕭頌：凝香是被人用匕首從背部插入胸腔而死，而頸部的勒痕僅表明凝香被勒暈過去，但并不致命，而凝香房內墻上的血跡則表明凝香是在床尾處被人捅死，然后才搬回床上勒住了脖子。聞此，柳粲認定是讓有人故意將柳粲所住的房間改成凝香被殺處的擺設，然后又假扮凝香將柳粲殺死，就為了讓人把注意力放回這陳年舊案上，此人到底和殺害凝香的兇手之間有何關系，這讓蕭頌十分困惑。
結束了驗尸，蕭頌出錢引誘冉顏做其私人仵作，但冉顏卻不愿意受到其的欺壓，果斷地拒絕了這個提議。蕭頌在柳粲的房間壁畫上看出了“殺人預告”，那指向一家波斯布料店，蕭頌依據布店管家的提示一路追尋掌柜，卻目睹掌柜被銀針刺殺，而黑衣人也照例跟隨蕭頌，被蕭頌發現后吩咐屬下拿下，卻反而將追兵全部打敗，只不過自己的腰部也受了傷。
蕭頌回頭質問布店管家，管家表示老板出門時行色慌張、似有心事，而其生前很喜歡去清酈館，與凝香相識；但管家是一年前才來到蘇州，不認識凝香。蕭頌問管家拿布店賬本，意外發現其手上老繭很厚，這是使用兵器的象征。
而之前受傷的黑衣人與準備回家的冉顏撞上，他手中握著之前在水中救冉顏留下的手帕，冉顏得知其就是救自己的人，于是偷偷把他帶回家醫治。這人身上新傷舊傷加在一起數不勝數，冉顏不禁有些好奇，而這人即使昏迷，手中仍緊握匕首，冉顏不慎碰到，本來昏迷的人卻突然驚醒，還反壓制冉顏，以刀挾之，但冉顏并不害怕，只讓其不能恩將仇報。
蕭頌發現自己派去緝拿黑衣人的手下全部一刀斃命，懷疑是火棋社排名第一的殺手離也為隋侯之珠而來，于是吩咐下屬搜尋所有店鋪客棧。待搜尋至冉府時，蕭頌想起那日冉顏在火車上藏人的舉動，頓起疑心。
冉顏見有人上門搜尋，忙將神秘人藏進了衣柜，自己出來與蕭頌周旋，不料蕭頌直接讓白義進屋搜索，隨后自己也跟了進去。但當蕭頌打開衣櫥時，卻并沒有發現他人身影，只拾得一塊玉佩，冉顏忙上前爭搶，口口聲聲說那是娘留給自己的遺物。但蕭頌卻提出冉顏答應做自己的私人仵作，便將玉佩物歸原主。冉顏不愿，蕭頌便拿著玉佩離開，還囑咐其想反悔就明日酉時來清酈館找自己。
第二日，冉顏醒來，發現昨晚消失的神秘人出現了，他對冉顏說自己從不讓女人相救，為報昨日之恩，他給了冉顏一個信號桶，讓其有危險就拉響。
而說來也巧，當天居然真有一群黑衣人找上門，逼迫冉顏說出柳粲的真實死因，冉顏拉響了信號桶，神秘人很快出現，將那群黑衣人全部殺死。冉顏心懷感激，但神秘人卻說今后與其兩不相欠，冉顏如若對其不利也絕不會手下留情，十分冷血。
冉顏吩咐回來的丫鬟前去報官，神秘人一路追尋剛才打斗的落網之魚，卻目睹其行了宮中之禮后便被殺死。
冉顏在師父住處大肆辱罵蕭頌的惡行，但師傅卻勸導其不妨一試。冉顏沉迷驗尸，實則因為自幼母親去世，自己卻被后母控制，不知母親身葬何處，于是便有了執念。
冉顏還是去清酈館赴了約，蕭頌讓人假扮兇手匿于所有犯罪嫌疑人中，讓冉顏指出真正的兇手。冉顏根據昨日下雨的積水準確找到了兇手，蕭頌十分滿意，并說出來自己的判斷，認為兇手射死柳粲后，便趁大家注意力都在柳粲身上時，伺機從水中逃脫，所以最可疑的便是當天外出還感染力風寒的樂師翠梅。
冉顏前來赴約，表明她答應了蕭頌的提議，做其的私人仵作。但不肯吃虧的她，為了不受蕭頌的欺壓，擬了一份協議，把自己的要求條條框框全部羅列好，兩人唇槍舌劍爭執一番后，終于達成協議。冉顏可以自由出入府衙，也擁有了自己的驗尸房。
蕭頌讓冉顏驗布料店老板的尸體，冉顏認出了死者，稱柳粲死時他很慌張。冉顏驗尸發現尸體勒痕和柳粲一模一樣，且背部有大量紫斑，曾痛苦掙扎，結合蕭頌那天看到的，他死前曾一人突然痙攣，判斷其可能是服用了阿芙蓉膏。而死者死后，蕭頌曾立刻前往，卻發現本在橋下河中的瓔魂卻消散無蹤。由此，蕭頌判斷兇手應有兩個，一個扮作瓔魂舞者，一個在高處以銀針殺人。
而冉顏拔出尸體頭上的銀針，發現上面印有“大東家”三字，看來這是兇手的又一次“殺人預告”，而經過白義調查，“大東家”是販賣阿芙蓉有名的大毒商，今日會有也一名叫“六爺”的人在南門與人接頭，販賣阿芙蓉。蕭頌立馬帶人蹲守，發現接頭帶來信物的正是布衣店管家，于是緊隨其后，幸運撿漏，假裝是買家，被蒙眼帶著前去見“大東家”。蕭頌的一眾屬下連忙跟上，卻還是跟丟了。
蕭頌獨自一人來到毒梟窩，被那幫毒販當作是六爺，幸好他精通江湖行話，將計就計扮作“六爺”。