芙蕾對調職命令心感不服，穆也不甘愿地服從命令。支撐大天使號的船員被調走，船上軍心一陣動蕩。而更加雪上加霜的是，大天使號被從第八艦隊，調離到阿拉斯加總部的守備隊了。另一方面，衛星軌道上、地上基地、在海中行走的潛水艇等等，扎夫特軍幾乎已經完成了集結動作。薩拉最高評議會議長為了讓戰爭早點結束，發動了「割喉作戰」。當曉得了這個作戰的真正目標，不是巴拿馬而是地球軍總部時，在克萊因邸療養的煌，為了保護在阿拉斯加的大天使號船員，為了找出戰斗的意義，決定返回地球。臨行前，拉克絲將某樣東西送給了煌。
大天使號在阿拉斯加與MS部隊展開激戰。面對排山倒海而來的扎夫特軍MS部隊，主力軍已派去守護巴拿馬的的聯合軍，自然陷入了苦戰。這時候，穆知道了軍方上層是基于戰略因素故意棄守阿拉斯加基地，勉強找到戰斗機來開回大天使號。戰局中扎夫特軍占了上風，戰爭眼看似乎就要結束時，聯合軍引發了同歸于盡的陷阱。差不多在這時間，大天使號被扎夫特軍包圍起來，已喪失逃脫的機會。在金恩的圍堵下，正覺得萬事休矣的時候，眼前突然出現從未見過的鋼彈，展開雙翼站立在前。
割喉作戰計劃失敗的消息，讓扎夫特國防委員會陷入混亂。就在同時，薩拉知道了扎夫特軍機秘開發的自由鋼彈被偷走，而且拉克絲還是共犯之一的時候，便喚來阿斯蘭通知這個消息。得知拉克絲犯了叛國罪遭到通緝，兩人的婚約已經失效，阿斯蘭一陣錯愕。薩拉議長掩不住憤怒，命令殺掉拉克絲.克萊因與奪走自由鋼彈的所有相關人物。另一方面，在阿拉斯加發動了獨眼巨人之后，解除危機的大天使號船員們與煌快樂的重逢。然而，煌的內心，從在殖民地與拉克絲相會后，就不斷想找出在這場戰爭中戰斗的意義。同時，在哈啰引導下，阿斯蘭與拉克絲重逢，得知了煌還活著的消息。驚愕的他，遭到拉克絲的逼問「你是抱持什么信念而戰的?」