長今因皇后娘娘的密令得以延續性命，不過必須要找出中宗的病因，在這之前要先到多栽軒隱居研究中宗病情。能夠讓長今在瞬間轉危為安是因為閔政浩在緊急時分想出來的好法子，閔政浩又請來張德陪同長今一起治療傷寒病患，也希望長今從治療這些病患當中，得到一些可以治療中宗的啟示。中宗再次昏倒，鄭允壽用過去同樣的方法，陷害是膳食方面出了問題，這次輪到今英和崔尚宮等人被關進義禁府，長今終于研究出可以治療疑似傷寒病癥的妙方，如果將這妙方公諸出來，就可以讓崔尚宮和今英脫離險境，此時，長今心中猶豫，不知道該如何下定決心……
鄭允壽翻遍醫書找尋中宗的病因，申主簿與鄭主簿也認真查詢中宗病因，當內醫院得知長今回到宮廷來，莫不驚訝！尤其當長今說出中宗的病狀，卻不知病名為何，鄭允壽斷定這就是西漢張仲景金匱要略書中所提及的狐惑病，并且說出處方，卻與長今的處方大相徑庭，皇后正在猶豫不決之時，吳兼護等人力挺鄭允壽，因此決定用鄭允壽的處方治療中宗，未料中宗腹痛難耐長今所預言的病癥一一出現，因此皇后決定信任長今，讓長今放手一博治療中宗，但是中宗又出現了失明的癥狀，皇后又急又氣下令將長今與閔政浩抓起來予以嚴厲懲處……
長今治好了中宗的眼疾，皇后喜出望外，中宗對長今也是另眼相看，從此皇后對于長今更是信任依賴，而內醫正內心愧疚，難以平復終至自盡崔尚宮等人因內醫正自盡，認為事情總算告一段落，未料長今告知手中握有內醫正死前寫給長今的遺書，希望崔尚宮等人自己說出真相，誠心向韓尚宮和母親請求原諒，不過崔尚宮等人對于長今握有內醫正遺書半信半疑，并且積極安排令路離開宮廷，以絕后患，吳兼護終于查出崔尚宮家族和長今之間長久以來的恩怨是非，不愿意牽涉其中，準備勸說令路到義禁府將事實真相揭曉，以定崔尚宮等人罪行……