時間過了兩年，德久準備行李，到濟州去看長今。長今專研醫術已經稍有成就，隨時可以獨自幫病患把脈開立藥方，但是因為曾經幫張德施針出過很大的差錯，因此對于施針遲遲不敢再度嘗試。德久因為暈船嚴重，被人背到官衙藥局，長今以熏療法治療德久，德久終于漸漸蘇醒，德久與長今兩人久別重逢，感慨萬千……當閔政浩與張德離開濟州到牛島去的時候，倭寇突襲濟州。倭寇主將生病急需大夫診療，長今被逼上陣施針，終于成功治愈倭將并且協助閔政浩擊退倭。
長今被義禁府的官員押送到京城，濟州牧使呈給皇上的奏折內容謊稱長今內通倭寇。因此，長今受到義禁府官員拷問，幸好閔政浩挺身而出說出真相，長今才得以脫離險境。當長今知道閔政浩不愿意留在京城，想要再度回到濟州去，長今勸閔政浩要留在宮內擔任京官職務為國效力，長今在回濟州的途中，到埋葬韓尚宮娘娘的地方拜別韓尚宮。因緣際會遇到一戶官宦子弟，并且替他根治久年不愈的陳疾得知宮廷即將舉行醫女選拔，立刻趕回宮去參加選拔，鄭云白為當時主考官之一，希望長今舍棄仇恨之心，以仁心仁術行醫。德久在得知長今高中金榜，欣喜若狂，長今也正式入宮接受醫女訓練……
長今正式開始接受醫女教育訓練，遇到一位嚴厲的醫學教授。對于長今在途中幫一位戶判大人的公子治病事情相當不滿，因此還沒開始正式上課，就被教授視為眼中釘，此后教授更是處處難為長今，雖然長今表現優異，不過申教授對于長今始終不假辭色，申教授的考試等級分為五等，如果得到三個不通就會被淘汰，長今已經被申教授記了兩個不通，萬一這次的考試再不通過就必須要被淘汰……