恐怖分子在廁所里找到苗苗，就打開攝像機和常健安談判。黑日組織頭目德普威脅說，教學樓里安置了炸彈，如果特戰隊企圖進攻，他們就殺掉人質，同歸于盡。他們的條件是讓支隊長陸長風來談判。
德普放了其它人質，只留下苗苗，要陸長風進去談判。特戰隊布署新方案，聯系警犬隊的排爆犬來排爆。警犬隊派來排爆搜查能力最強的黑豹，而能指揮黑豹的人只有楊燦。
德普的條件是讓警方提供一架直升飛機，帶走陸長風來交換山貓，要不然就殺了苗苗。常健安指揮長一面和德普周旋，答應給他派直升飛機，另一面要楊燦帶黑豹趕緊找出炸彈的位置，拆除炸彈。德普只給他們十五分鐘的時間，要不然他就要殺害一名人質。
黑豹找到了第一枚炸彈，鐵豹卻發現這是一個子母起爆裝置，它和另一個炸彈連在一起，必須同時剪斷這兩個炸彈，否則會一起爆炸。黑豹找到第二個炸彈，楊燦的耳機卻摔壞了。情急之下，楊燦想起敲擊鋼管，用密語聯系鐵豹，在樓下的鐵豹聽懂了楊燦的密語，兩人同時剪斷引爆線。炸彈解除的同時，德普發現口袋里的起爆器停止顯示。這時特戰隊的突擊隊和狙擊手同時進攻。楊燦看到有人朝黑豹射擊，他一把撲倒在黑豹身上，自己的肩膀中彈。
那敏在醫院看護著楊燦。詩文也趕來醫院，聽見楊燦在夢里說，“謝謝那隊，謝謝你救了我，真想一直有你這么陪著。”詩文這才傷心地承認，楊燦心目中的女神是那敏，她一直是一廂情愿。黑豹受傷了，不能再回警犬隊，詩文決定把它接回家，自己來養。
楊愛萍開會介紹APR項目的進展計劃，會議解散后，楊指山堅持要楊愛萍收下他費了好大勁弄來的瑞士新藥，楊愛萍還是扔掉他給的藥。林指山的秘書藍雪在門外聽到屋內的爭吵聲，才知道楊指山和楊愛萍原來是夫妻，大吃一驚。
曉波代表厲劍峰隊長給病房的楊燦送花來。楊愛萍也來看楊燦，見楊燦這么離不開特戰隊，知道自己阻止楊燦是錯誤的決定。楊愛萍告訴楊燦調他去警犬隊都是她向常健安請求的，向楊燦道歉。
鳳琴收拾行李，和苗苗坐飛機回老家去生活。
根據反恐協議，中國決定把山貓引渡回國接受審判。押送山貓的重要任務由厲劍峰負責。
詩文決定出國，他給楊燦寫了一封告別信，就帶著行李和黑豹，去機場坐飛機。
特戰隊接到特級任務，在一架準備起飛的國際航班上，恐怖份子準備劫持剛剛結束對我國防問的阿巴斯部長。飛機上已經有一百四十八名乘客登上飛機。楊燦建議以檢修飛機為目的，疏散乘客，被陸支隊長否決。據了解，飛機上有八名恐怖份子，不能讓他們有絲毫查覺。
候機廳有一支球隊被陸長風攔下，特戰隊員換上運動員的衣服，準備混入飛機。楊燦和那敏另外裝扮成一對情侶先趕上飛機。柳詩文正坐在這趟飛機上，見楊燦和那敏一同進來，氣得發抖，誤會楊燦迫不及待地要和那敏甜蜜出游，生氣地沖到楊燦面前質問他。這時，劫機頭目看到有車運送運動員過來，警覺起來，命令劫匪開槍，劫持飛行員啟動飛機。陸長風只好宣布取消A計劃，執行B計劃，讓登上飛機的那敏和楊燦來保護人質安全。
飛機啟動，飛上天空。劫匪要在向楊燦哭鬧的詩文安靜，向她開槍，楊燦為了保護詩文用身體擋住子彈。劫匪把楊燦拖到飛機的洗手間里。
劫匪頭目用槍指著大使的頭，讓他打電話讓中國政府釋放山貓。如果不同意他們的條件，就每隔五分鐘殺死一個人。
陸長風指示厲劍鋒暫停押解任務。把山貓送到劫匪指定的地點。厲劍峰要曉波和塔西奔向埋伏地點，收到命令就立刻狙殺山貓。
楊燦出發前穿了防彈衣，子彈并沒有傷害到他。在洗手間楊燦發信號要那敏掩護自己。那敏故意和詩文吵打起來，說詩文害死了楊燦，一邊向詩文使眼色，告訴她楊燦沒有死。詩文明白了那敏的意思。
趁劫匪被那敏她們吸引，楊燦躲進電子艙，制造發動機故障，迫使飛機降落。劫匪以為是剛才特戰隊的掃射打壞了飛機部件。只得同意讓飛機先降落，他們警告陸長風，飛機上有炸彈，如果他不放了山貓，他們會引爆炸彈。
楊燦收到命令，潛入行李艙尋找炸彈，這時他聽到黑豹的嗚咽聲，原來小文把它也帶上了飛機。
劫匪發現剛才打死的年輕人不見了。他們在那敏包里搜出一把槍，知道有特戰隊員混入飛機，匪首親自帶人去找楊燦。黑豺找到炸彈，楊燦剪斷炸彈控制線。
山貓跑向接應他的車輛。曉波塔西正好趕到狙擊地點，待命射擊。眼看著他們即將穿越國際控制線，曉波收到炸彈已拆除的消息，馬上射擊，山貓被擊斃。
得知炸彈已拆除，那敏在機倉反擊，控制了劫匪。在行李倉，楊燦和黑豹配合默契，一起擊敗了匪首和他的手下。楊燦利用玩游戲時駕駛飛機在航母上降落的經驗，在塔臺的指揮下，成功操作飛機降落到指定機場。機倉乘客發出勝利的歡呼聲。
乘客中，有個一直沒有暴露身份的恐怖分子假裝暈倒，混入人群。
那敏知道楊燦和詩文之間出問題了，給楊燦放了兩天假。
“老總”派人把飛機上逃脫的黑日組織成員送去南方出境。
反劫機行動取得勝利，那敏、楊燦、趙曉波三人榮獲個人二等功一次。
詩文回來后總是做惡夢，夢見楊燦在飛機上被槍擊中的場景。楊愛萍找詩文談心，她知道詩文對楊燦的感情，要詩文不要放棄他們之間九年的情份，說楊燦對那敏可能只是崇敬。詩文要楊愛萍別去做楊燦的工作，她覺得自己的事應該自己解決。
楊指山找到楊愛萍家樓下，再次向楊愛萍表達歉意。他查到了楊愛萍修改了楊燦的生日，從時間上推斷楊燦是自己的兒子，向楊愛萍請求見見楊燦。楊愛萍聽了非常生氣。要他滾遠點，不要來打攪自己的生活。楊指山走的時候，正好楊燦回家，倆人擦肩而過。
楊燦回家告訴媽媽自己立了二等功，楊愛萍看著楊燦的軍功章，感到非常驕傲。她故意提醒楊燦，象歌里唱的，軍功章里也有詩文的一半，然后把他們倆的手放在一起。楊燦卻找了個借口把手抽了回來。
楊燦感謝詩文一直在照顧媽媽。親歷這次恐怖事件，詩文決定不走了。她想留下來照顧楊阿姨，支持楊燦。楊燦在飛機上不顧一切地保護了自己，說明在他心目中自己也是非常重要的人。他們不能做情侶，也可以做朋友或者兄妹。
曉波從入伍那天起就在收集瑪瑙，他把它們串起來，準備親手送給女友方若霞。楊燦為曉波做好索降，曉波準備給女朋友來個從天而降的驚喜。曉波嘴里叼著一朵玫瑰花，從樓頂放下繩索滑到方若霞的窗前，祝她生日快樂。這時，從房間的衛生間走出來一個穿著睡衣的男人。曉波傷心地走了。
失戀的打擊讓曉波訓練時狀況不斷，隊長厲劍峰找曉波談話。曉波告訴厲隊，昨天本來想告訴女友自己立了二等功，讓她感到驕傲，沒想到她卻和別的男人在一起，說著痛哭越來。厲隊鼓勵曉波，你是我見過的最有天賦的狙擊手，不管發生什么事情，一定不要被自己打跨了。
楊燦決定幫曉波出氣，把方若霞劈腿的男友陳子杰教訓一頓。
為了取得競標項目，陳子杰在卡拉OK廳宴請項目工程負責人劉總，還在現場送給他一份厚禮。楊燦扮作服務員，用貓眼攝像頭，拍下陳子杰送禮物的鏡頭。電腦高手小川把陳子杰車上筆記本電腦里的競標文件，換成剛剛拍下的送禮鏡頭。陳子杰提早從卡拉OK廳里出來，楊燦要黑豹去追趕陳子杰，拖延時間。
第二天在競標現場，陳子杰放送的競標文件竟是前晚在卡拉OK現場送禮的錄像。陳子杰本以為穩操勝券的項目泡湯了。