張副官和齊鐵嘴查出有關病毒和隕銅的線索，這一切答案都表示日本人就是始作俑者，而在洞庭湖附近的沉船，則可能是制造病毒和隕銅所在的關鍵位置。張啟山感覺日本人將會有對長沙不利的大行動，事不宜遲，他決定和張副官親自前往一探究竟。
兩人來至洞庭湖處打探消息，在一處客棧得知附近有一沉船被日本兵撈起，船上有十分貴重的東西，但是這船被轉移了，目前下落不明。客棧老板收了張啟山不少錢，心里一高興，便向他倆透露更多消息，更提出要帶他們到一個儲藏魚蝦的冰庫，因為很多人都在那里找到了寶貝。
張啟山和張副官跟客棧老板來到冰庫，在里面偶遇一位在冰庫玩耍的小女孩。小女孩大情大性，性格活潑，跟張啟山很是投緣。在小女孩向張啟山求水解渴之后，見其水瓶精致，于是掏出一精美耳環欲與其交換。張啟山一看之下，發現這耳環絕非便宜貨，于是便問小女孩怎么得來的。小女孩也不避忌，直接把張啟山帶到一販賣寶物的市集。
市集的商販口緊得很，張啟山問不出什么來，只好先把寶物買下再算。小女孩翠翠驚訝于張啟山出手大方，張啟山順勢掏出一袋銀兩，想收買翠翠，讓她透露這些寶物的來歷。翠翠知道這涉及到村民的生計，擔心會影響鄉親們，但見張啟山和張副官態度誠懇，于是告訴他，可以去村東頭的客棧問問。
張啟山根據翠翠的線索來到村東頭的客棧，在此處不僅看見之前失蹤的黑石，還有陳皮。張啟山偷聽他們的對話，得知陳皮跟一群日本人一起來，跟黑石匯合，似是有什么陰謀。張啟山從他們的對話得知黑石、陳皮還有日本人狼狽為奸，于是在他們摸黑出外活動時偷偷跟在背后，發現他們來至一洞。
張啟山暗中觀察他們，發現他們竟然在洞里頭暗中煉制病毒，原來一切的根源，都是日本人所為。為了阻止日本人的野心，張啟山打算出手阻止，不料在潛伏時被發現，于是以一敵眾，跟黑喬的人打了起來。張啟山武功高強，把黑石殺了，但自己卻不小心誤中陷阱，昏了過去。張副官則在另一邊廂逃避陳皮的追捕，隨后折返找張啟山，卻發現他在冰崖下昏迷不醒。張副官把張啟山救出打算離開，這時遇到翠翠，翠翠說他們的朋友在外面等著。原來二月紅擔心他們的安危，于是帶人前來支援。
二月紅和張副官談論時提到日本人，翠翠突然哭了起來。原來翠翠是個命苦的孩子，她的父親被日本人所殺，張副官和二月紅聽后，心里更是立下決心，要追隨佛爺，救老百姓于水深火熱之中。
張啟山被村民的土方法救治，終于蘇醒過來。張啟山、張副官和二月紅繼續在此地查探日本人的陰謀，無意中發現黑喬人在祭天，隨后在他們口中得知陳皮等人行進的方向。三人繼續前行，路上發現一處樹葬的地方，樹上的尸身死狀怪異，似是中毒身亡，讓人不禁推測他們被日本人拿來做實驗。三人繼續深入探究，天色開始入黑，他們來至一個村寨，在里面發現有兩個小棺材。張副官認出，這兩個棺材的形狀，應該是之前幫時懷嬋下葬世子時被盜走的棺材。眼下真相越來越近，他們繼續深入，不料此時被埋伏起來的黑喬人襲擊，張啟山和二月紅昏倒在地。
張啟山和二月紅中了埋伏后，便被黑喬人囚禁起來，同被黑喬人囚禁起來的還有附近漁村的村民。好不容易恢復清醒，卻看見陳皮出現在此，對他們奚落一番。待陳皮走后，張啟山和二月紅便施計逃離牢獄，順道把村民們一起救走。
陳皮從后追上他們，打算對他們痛下殺手。二月紅見自己教出來的徒弟竟然如此心狠手辣，感到痛心疾首，于是也不手下留情，和張啟山聯手把陳皮等人打個落花流水。
二月紅之前路過一荒廢小屋時，看見一些從沉船處打撈的寶物，打算先拿回去再慢慢研究，而這些寶物在二月紅與陳皮打斗時，不小心散落在地。陳皮從寶物堆里發現里面有一個簪子，跟之前自己送給師娘丫頭的一模一樣。陳皮質問二月紅這簪子為何出現在此，卻反遭張啟山的呵斥。原來這簪子有毒，想必當時丫頭病重，就是毒簪所致。
陳皮對自己也產生了懷疑，但是固執的他堅持把丫頭的死因歸咎于張啟山的見死不救，隨即繼續攻擊張、紅二人。就在千鈞一發之際，漁村村民們對兩人伸出援手，大伙兒合力趕走陳皮。
陳皮拿著毒簪回到自己的落腳點，隨后問同伙的黑喬人這毒簪從何而來。黑喬人見到毒簪后十分驚訝，說這毒簪是屬于那批最早從沉船處打撈出來的寶物，毒性十分強，之前曾經流入黑市。陳皮不禁想起，當時這簪子就是自己從黑市買來送給師娘的，當時還因自己光顧黑市而受到二月紅的責備，陳皮在被罰跪時氣上心頭把簪子砸爛了，師娘撿起簪子時不小心割了手，因此染上病毒。陳皮這么一想，才發現丫頭的死，竟然是自己所為，這讓他一時之間難以接受。
陳皮如今也因被毒簪所致染上病毒，身體漸漸吃不消。張啟山知道后，打算讓張副官把他帶回救治，但陳皮卻不領情，跳車逃跑了。張啟山擔心他會把病毒傳染給人，決定在城中進行戒嚴，并盡快抓到陳皮。
張啟山在尹新月和二月紅的建議下，問五爺借了狗來追蹤陳皮，但還是被陳皮逃脫了。陳皮來到手下們的住處暫時躲避追捕，稍稍休息幾天后，便繼續部署殺害張啟山的陰謀。
狡詐的陳皮十分難捉，張啟山和新月決定演一出戲引陳皮上鉤。張啟山先是讓人把“真正的鹿活草被新月藏于新月飯店”這一假消息散播出去，隨后新月故意跟張啟山為了當時不把鹿活草給丫頭一事吵了起來，更是說要回北平娘家，然后故意把吵架的內容讓八卦的下人聽見，使得這消息傳遍長沙。陳皮聽信謠言，認為新月才是始作俑者，于是根據傳言，截住要“回北平”的新月，打算為師娘報仇雪恨。陳皮中了張啟山和二月紅事先設下的圈套，來到一處荒冢里，被墓冢的機關關了起來。二月紅則把解藥投進密室，至于陳皮是死是活，則看他自己的造化了。
陳皮在密室里已經半死不活了，但他依舊向二月紅大喊，說自己死了沒關系，但二月紅一定要把找到隕銅救活師娘，這讓二月紅動了惻隱之心。張啟山擔心二月紅再次被隕銅制造的幻想所困，于是打探他心中所想，而二月紅則表示自己已經接受了丫頭已死的事實。陳皮命不該絕，但他與二月紅從此再無瓜葛。
張啟山把齊鐵嘴帶到白喬圣樹，把圣樹的秘密告訴他。原來圣樹可以讓尸體終年不腐，是因為樹下埋有隕銅所致。青烏子的卷宗里用古喬語書寫，也可能與此有關，卷宗上就記載著圣樹下埋有隕銅。
裘德考也得知第三塊隕銅就埋在白喬圣樹下，于是前來打算挖樹取物。裘德考徒手挖掘時，挖得一塊銅片，上面畫著一地圖，并寫著“鏢子嶺”，隨后裘德考便下落不明。而田中也被陳皮鏟除了，長沙暫時平靜了一段時間。但好景不長，過了幾年，日本人開始在全國各地進行襲擊，長沙也即將成為戰場。
心系國家和民眾的張啟山自然要和弟兄們站在最前線，但為了新月的安危，他忍痛暫別愛妻。新月看著張啟山的背影，她決定留在長沙等著他，不回北平避難。
二爺、三娘、八爺、九爺在戰前享受片刻的歡樂，聚在一起打麻將。日本人的飛機聲不斷傳來，但見慣大場面的九門中人十分淡定，似是安心地享受這暴風雨前的寧靜。
如今長沙不再太平，長沙民眾紛紛逃走躲避戰火，九門中人也只能暫時離開，待日后有緣再聚首。天下無不散之筵席，張啟山沒有阻撓大家的離去，但他希望大家在日后，可以幫忙照顧自己的夫人。佛爺的話語一出，似是做好以死一搏的準備。
張啟山在蕭條的長沙城獨自走著，回憶起很多往事。他想起當時南下逃難的自己，還有死去的父親，還有和九門中人的相遇情景。如今回想，一切都歷歷在目，可惜因為日本人的襲擊，讓這原本充滿歡聲笑語的長沙城物是人非。
日軍終于攻進城內，敵眾我寡，敵強我弱，張啟山和一眾兄弟血戰一番，依舊抵擋不住魔鬼的步伐。盡管張啟山引爆了事先埋伏的炸彈，殺了很多日寇，但對方兵力彪悍，不斷有新的日軍涌進長沙城。然而張啟山身邊只剩寥寥可數的親兵，他決定不退縮，跟大家死守長沙。就在此時，九門的各位出手相助。原來大家沒有離開長沙，都留了下來，幫張啟山一起抵抗日軍。
九門的傳奇一直在長沙城內傳頌著，多年后，大家還會記得在那一九三九年的秋天，有一位叫張啟山的人，帶領大家捍衛家園。（全劇終）