南京下令要將鄭翊發配到太原，太原早已陷入共黨的包圍中，明顯是個死地，南京此舉便意味著放棄了鄭翊。鄭翊雖已無法避免自己的死局，但她在最后的時間里仍不放棄揪出俞北平的身份。
鄭翊約姜平、孫德利等人一同吃飯，由于鄭翊的最終結局近在眼前，幾人都心情不佳。之后，鄭翊靠著姜平提供的情報推測出俞北平同林莎應為父女關系。
同時，鄭翊先前曾秘密派宋強去南京查探張瀚民的事情，宋強回來后將查到的結果告知鄭翊，原來張瀚民在上海、武漢等地收養了大量共黨高級干部的孤兒，并利用孤兒計劃資助共黨。通過推測和大量事實證據的驗證，鄭翊等人不難得出張瀚民曾收養過林沖和林莎的結論。
徐文正收到鄭翊收集到的證據后，找俞北平交談。在徐文正的逼問下，俞北平終于承認林莎便是自己女兒，同時也承認了他原名為林有發，在早年曾加入過共產黨，但俞北平也再三保證他同共黨早已毫無聯系。徐文正見他態度誠懇，便相信了他，最后對他做出了撤銷軍職的處罰。
同俞北平交談完后，徐文正找到鄭翊，告知她自己對于俞北平身份的判斷，鄭翊對此只能苦笑。隨后，徐文正告訴鄭翊南京方要對清城實行焦土政策，清城為華北華東交通樞紐，此政策能為國軍的長江防線贏得三個月的寶貴時間。徐文正知道誰簽署這份文件便是歷史的罪人，但為了黨國，他只能犧牲自己。
俞北平回到家中，徐詠儀得知了他和林莎的關系后，決定要和他把事情都說清楚。在隨后的交談里，徐詠儀直接挑明了俞北平的共黨身份，并提出到香港后便帶徐丹妮去美國。
共軍攻勢兇猛，已經突破了清城的最后防線，如今清城已到了最后關頭。特調局高層們召開會議，鄭翊在會議上提出要加緊實施撤離計劃，并通知各高層南京要對清城實行焦土政策的消息，毀城計劃勢在必行。
徐丹妮趁俞北平不在家中的時候，偷偷潛入俞北平書房搜查，不料正好遇到俞北平開完會議回來，慌亂下，她忙躲入一旁的衣柜。隨后，她看到俞北平正在通過收音機接收密電，心下震驚，不禁對俞北平的身份產生了懷疑。而俞北平此時接收的正是一個他早已完成不了的任務，共黨上層指示他利用清城特調局主任的身份阻止國民黨的毀城計劃。
當晚，俞北平一家人吃飯時，徐文正告知他們務必要在星期六那天離開清城，并果斷否決了俞北平想將離開的時間推遲到禮拜一離開的提議。與此同時，鄭翊等人正在商討毀城計劃的具體實施，最后他們決定采用通過將燃油灌進清城下水道的方法對清城實行爆破。由于鄭翊懷疑程忠義為俞北平的內應，便故意透露給程忠義他們要從五號油庫將燃油灌入的假情報，以此來看俞北平是否上鉤。而實際上，他們則準備用魚浦頭管道將燃油直接運輸至地下水道。
徐文正找俞北平到自己書房，再次強調要俞北平帶著徐詠儀和徐丹妮早日離開清城，定好的行程絕不能變。言語中，徐文正已透露出死志，俞北平見此知道自己無法再說動徐文正，只能放棄。
徐丹妮將俞北平接收密電的事告知遲又一，姜平等人聽到這話知道這信息肯定能坐實俞北平共黨的身份，便派人讓遲又一告訴徐丹妮俞北平是在接收黨國炸毀清城的指令，并讓她把俞北平的用來解密電的那本解密書帶來給他看。
共黨步伐逼近，清城的百姓紛紛出逃，清城一時間秩序大亂。林莎知道程忠義要第一批前往臺灣后，知道鄭翊不會放過他，便再次找程忠義勸他離開黨國，但程忠義卻依然無法被說動。在告訴林莎鄭翊要通過五號油庫用燃油炸毀清城的消息后，程忠義離開。見自己愛的人一心奔赴死局，林莎陷入深深的沮喪與絕望。
不久，鄭翊方便得知了林莎同程忠義分開后，便利用挪動物資的借口接近五號油庫的消息。見自己的計劃初見成效，鄭翊更是決定要充分利用這次機會將俞北平徹底打入萬劫不復之地。
林莎同俞北平在咖啡館接頭，由于俞北平要提前離開清城，便把這次任務交代林莎完成，并警告她做事要仔細。
同林莎分別后，俞北平回到家中書房，接收組織的信息。隨后，鄭翊打電話請俞北平出門，提出要給他餞行。而徐丹妮便趁這時來到俞北平的書房，拿到了那本解密書。
在飯桌上，鄭翊試探俞北平對于毀城計劃的態度，俞北平則強硬回應。兩人對話間你來我往，誰都占不了上風。俞北平內心也知道鄭翊根本不同意黨國對他的處置結果，這場飯局是鄭翊對他下的戰帖，鄭翊想利用最后一個機會，把他留在清城。
徐丹妮同往日一樣去見遲又一，卻發現他坐在椅子上，早已身亡，霎時只覺天昏地暗。隨后，徐丹妮在桌上看到了遲又一留給她的遺書，在遺書中，遲又一對徐丹妮道明了一切。
原來遲又一早已受不了良心的拷問，最后他選擇了自殺，來給徐丹妮最后的警告。正監聽遲又一的姜平知道遲又一用遺書把事實都透露了給徐丹妮，便將徐丹妮押入了綏靖總署，好讓她接受鄭翊的審問。鄭翊用遲又一妻子和兒子的死來威脅徐丹妮交出解密書，徐丹妮在死亡的陰影下不知所措，只能大聲嚎哭。
由于共黨推進迅速，南京對鄭翊下指示要求提前實行毀城計劃。鄭翊便下令清城的人員與物資必須晚上八點前撤退完畢，并抓緊讓俞北平上鉤。這時，她的下屬突然來告知她俞北平用清城局最高職權進入五號油庫的消息……
徐詠儀和俞北平在家收拾行李，準備隨時出發。在收拾行李的途中，俞北平卻發現徐丹妮不見人影，便前往遲又一家找徐丹妮。
而鄭翊正在面見徐文正，她將俞北平進入五號油庫警戒區的事告知徐文正，請求徐文正派人抓捕俞北平，但徐文正卻不同意。與此同時，徐丹妮正關在綏靖總署里，被宋強嚴刑拷問。在折磨下，徐丹妮始終不松口。
徐文正見鄭翊心意已決，只能放低姿態，請求鄭翊放過俞北平和他的家人。俞北平是徐文正女兒和孫女以后生活的保證，因此他極不希望俞北平出事。怎料鄭翊已先行一步直接向南京取得逮捕俞北平的許可，徐文正見此，只能把俞北平的責任都攬在自己身上，道明一切后果都由他承擔，以求得家人的平安。待鄭翊離開后，徐文正自殺于書桌前。
俞北平同林莎見面，林莎告知俞北平徐丹妮已落在了鄭翊的手里，同時，也將關于毀城計劃的探查結果俞北平，他們已經確定五號油庫只是鄭翊的煙霧彈，真正的運輸入口是魚浦頭倉庫。俞北平告訴林莎魚浦頭有兩條線路，一號線和二號線，并且在二號線上有盲點。原來鄭翊目前所依據的地下水道圖紙為日本人所繪，而清城最早的地下水道則為德國人所造，因此某些管道并未在日本人所繪的這張圖紙上呈現出來，二號線便是如此。經商討后，他們準備在二號線上做文章，通過改變二號線線路把燃油引到城南的一個廢棄油庫。
同俞北平告別后，林莎暗自潛入魚浦頭油庫，帶著炸彈試圖引爆油庫，不料鄭翊早已安排在魚浦頭旁的官兵捉住。與此同時，謝楠帶人到魚浦頭的二號路線，試圖改動二號線。
特調局內，正在同下屬開會的鄭翊，得知林莎被捕的消息后，很是得意。鄭翊知道林莎專門經受過訓練，普通的審訊對她毫無作用，便決定讓林莎見徐丹妮，以擊潰徐丹妮早已被折磨得痛苦不堪的心理防線。這一招果然湊效，徐丹妮終于扛不住壓力，道出解碼書就藏在遲又一書房的書柜中。
另一邊，徐文正的副官田昱為了讓俞北平和徐詠儀安心登上飛機，向他們隱瞞了徐文正的死訊，只告訴他們徐文正早已登上飛往臺灣的飛機。俞北平和徐詠儀雖對消息存有疑慮，但最后還是聽從了田昱的安排，準備登機。
通過解碼書，鄭翊等人分析出了共黨要對一號線進行行動，當即下令要實行二號線計劃。而被關押在監獄里的林莎正在安撫情緒瀕臨崩潰的徐丹妮，徐丹妮為自己屈從于鄭翊的威脅后悔不迭，林莎則告訴徐丹妮，情報不過是俞北平為鄭翊設下的一個局，目的便是要鄭翊實行二號線計劃，好成功利用二號線的盲點。隨后，林莎知道自己必死無疑，便鼓勵徐丹妮不要放棄活的希望，并讓徐丹妮幫忙傳遞情報給俞北平。
共軍分成三路已經攻入清城，清城已注定要被共產黨掌控，毀城計劃迫在眉睫。怎料本就該出油的二號管線卻至今沒見油，鄭翊聽到這消息，心下已涼了一半，如此一來，毀城計劃已來不及。?鄭翊故作鎮定，要下屬沿二號線反復排查。
正當這時，城南方向傳來了一聲巨響。鄭翊驚覺爆炸的方向不對，而她的下屬也正好前來告知鄭翊二號線路被共黨攔截，導入的燃油被分流到了城南的一個廢棄油庫的消息。毀城計劃崩盤，鄭翊聽著城南不斷響起的爆炸聲，整個人已然瘋魔。她將徐丹妮和林莎帶到綏靖總署二樓的陽臺上，準備讓她們看最后一眼清城。
而這時，俞北平和徐詠儀已經登上了飛往臺灣的飛機。在飛機上，徐詠儀由于擔心徐丹妮等人以及對前途的迷茫，忍不住失聲痛哭，俞北平輕聲安慰。
陽臺上的鄭翊指著正飛過頭頂的飛機，告訴徐丹妮和林莎，俞北平和徐詠儀便乘坐在這架飛機上，而這架飛機早被她裝上了炸彈，在飛行途中便爆炸，到時俞北平便會尸骨無存。林莎和徐丹妮聞言，皆是哀痛欲絕。在鄭翊朝林莎開槍的同時，林莎動用余生最后的力量，一個箭步沖上去，反手將鄭翊開出的第二槍打在了鄭翊身上，并拉著她一起從二樓墜下，最后，兩人竟同歸于盡了。在轉瞬間發生的這一切，讓徐丹妮很是難以置信。她望著林莎摔在樓底的身體以及其身后暈開的大灘血跡，痛不欲生。
不久，共產黨攻破了清城，徐丹妮也得以解救。從那天起，徐丹妮徹底喪失了她的父母俞北平和徐詠儀的音訊，而她則在多年后成為了清城大學一名教授，安然度過晚年。