耿玉京終日以淚洗面，可又說不出話來，西門燕拼命哄他開心，要帶他去找鄭巧兒，耿玉京斷定鄭巧兒已經被刺死，他躺在床上暗自垂淚，西門燕決定給耿玉京下猛藥。
西門燕和牟一羽假扮成西域來的人，他們強行帶著耿玉京來荷月軒，主人荷月認為他們是來找最有名的歌姬苒苒，就派人送他們過去，苒苒飄飄而至，隔著紗簾自彈自唱“牡丹亭”，苒苒悠揚的歌聲加上曼妙的琴聲，牟一羽和西門燕深深被打動，耿玉京觸景生情，不由地想起死去的鄭巧兒，他傷心地淚流滿面。
鄭巧兒讓苒苒換一支歡快的曲子，牟一羽不想她破壞氣氛，強行把她拉出來。苒苒走出紗簾，對耿玉京好言相勸，耿玉京說不出話來，苒苒就陪他喝酒，耿玉京借著酒勁想起和鄭巧兒在一起的一幕幕往事，苒苒陪在他身邊，即興唱了一首小曲。荷月攔住西門燕和牟一羽，當面拆穿他們倆假冒西域人，懷疑他們和轟動京師的案子有關，西門燕百口莫辯。
西門燕和牟一羽擔心身份敗露，趕忙帶著耿玉京離開荷月軒。第二天一早，西門燕帶耿玉京去郊外放風箏，看著風箏越飛越高，耿玉京的心情豁然開朗，臉上露出久違的笑容，耿玉京從風箏的原理悟出了“道法自然”的真諦，他趕忙回去關起門來認真修煉，西門燕和牟一羽不便進去打擾。
戈振軍被蒙面黑衣人追殺，西門燕及時趕來為他解圍，掩護戈振軍順利逃離，原來，這是魏忠賢，許顯純和無量設的J計，想用戈振軍做誘餌，將耿玉京，鄭鐵崗和牟一羽等人一舉殲滅。西門燕把戈振軍救回來，耿玉京看到戈振軍，激動地熱淚盈眶，戈振軍聲稱無量投靠了魏忠賢，耿玉京向他打聽父母的情況，戈振軍不置可否。
牟一羽和鄭鐵崗都看出戈振軍不對勁，他的傷都是皮外傷，鄭鐵崗不想打草驚蛇，更不想耿玉京傷心，只能靜觀其變。耿玉京拿出母親給他做的小衣服，戈振軍睹物思人，就講起了何玉燕的事，戈振軍承認他深愛著何玉燕，可何玉燕和耿京士兩情相悅，之后，耿京士和何玉燕被人栽贓陷害，他輕信別人的讒言錯殺了耿京士，耿玉京根本不信，可戈振軍言之鑿鑿，他連連向耿玉京賠罪，耿玉京原諒了他，然后撲倒在他的懷里嚎啕大哭。
魏忠賢派許顯純帶人抓捕耿玉京和牟一羽等人，許顯純帶人把鄭鐵崗說得住處團團包圍，雙方展開激烈廝殺，鄭鐵崗死死擋住錦衣衛，掩護耿玉京，牟一羽和西門燕逃走。許顯純下令分頭去圍堵，耿玉京一行人逃至樹林，就被錦衣衛團團包圍。
耿玉京，牟一羽，鄭鐵崗和西門燕所向披靡，把錦衣衛打得落花流水，再加上戈振軍全力相助，錦衣衛傷亡殆盡，許顯純急忙跳出來還擊，無量偷偷使出兩記無極掌，把耿玉京打得五內俱焚，昏死過去，鄭鐵崗想去救耿玉京，被許顯純死死拖住。
無量想對耿玉京痛下殺手，戈振軍想起何玉燕臨終囑托，奮不顧身站出來擋住無量的無極掌，他被打翻在地，耿玉京見狀，他用無極心法恢復內力，飛身跳起來沖無量狠劈過去，耿玉京猶如神助，把無量當場打死，許顯純也身受重傷，他不敢戀戰，只能眼睜睜看著耿玉京一行人逃出樹林。
戈振軍受了重傷，他已經奄奄一息，拼盡最后一口氣向耿玉京說明真相，當年他是趁耿京士不防備把他殺死，戈振軍一直不敢承認，就是擔心耿玉京會離他而去，說完這番話，戈振軍就永遠閉上了雙眼，耿玉京傷心欲絕。
耿玉京給戈振軍收尸，然后按照武當的規矩把他火化，耿玉京想把戈振軍的骨灰帶回武當。鄭鐵崗收到郭璞的飛鏢傳書，他不敢耽擱，立刻來到約定的城隍廟，可郭璞沒有獻身，引著鄭鐵崗來到河邊，鄭鐵崗才發現來人是錦衣衛百戶宋平。
宋平明確講明郭璞在七年前就已經身故，鄭鐵崗半信半疑，宋平自稱和郭璞是舊交，他透露了熊廷弼被關在錦衣衛的密牢，生命危在旦夕，魏忠賢給他扣上通敵叛國的罪名，宋平求鄭鐵崗出面救熊廷弼，答應和他里應外合救人，鄭鐵崗還是不敢相信他，宋平最后才承認他是皇上安排在魏忠賢身邊的密探，還把密牢的地圖交給鄭鐵崗，鄭鐵崗和宋平商量好救人計劃。
自從戈振軍死后，耿玉京就一心想報仇，可不知道仇人是誰，他只能每日借酒澆愁，鄭鐵崗對他好言相勸，想和他一起把熊廷弼救出來，耿玉京只想救鄭巧兒，鄭鐵崗看他頹廢的樣子，就想起了無相臨終囑托，他看中耿玉京能做武當掌門，耿玉京對此不感興趣，只想救鄭巧兒，鄭鐵崗對他大失所望，決定叫上牟一羽和西門燕去救熊廷弼，臨走把密牢的地圖扔給耿玉京。
深夜時分，鄭鐵崗帶西門燕和牟一羽闖進密牢，他們打暈侍衛，四處尋找熊廷弼。魏忠賢得知鄭鐵崗等人來劫獄，不由地暗自得意，他已經布下天羅地網，就等著他們上鉤，魏忠賢派許顯純去抓人，宋平主動請纓去密牢抓劫獄的人，魏忠賢早就發現他是皇帝的密探，故意讓他去報信，想把他們一網打盡，魏忠賢一聲令下，許顯純當場把宋平掐死。
鄭鐵崗，西門燕和牟一羽一路尋找，最后在密牢深處找到熊廷弼，耿玉京及時趕來增援，熊廷弼想以死明志，他寫了一本“遼東策”，拜托鄭鐵崗交給袁崇煥，催他們趕快走，鄭鐵崗只好帶耿玉京他們逃離密牢。
鄭鐵崗一行四人匆匆走出密牢，被錦衣衛團團包圍，許顯純派人把宋平的尸體從城樓扔下來，他下令把鄭鐵崗等人生擒活捉，雙方展開激烈廝殺，耿玉京飛身跳上城樓，揮劍把錦衣衛殺傷殆盡，鄭鐵崗不敢戀戰，招呼耿玉京，牟一羽和西門燕盡快撤離，許顯純帶人緊追不舍，鄭鐵崗讓耿玉京他們分頭逃跑，約定最后在城隍廟匯合。
鄭鐵崗站在屋頂，大罵許顯純，把錦衣衛全部吸引到他身邊，掩護耿玉京和牟一羽他們安全撤離。西門燕和牟一羽費盡周折終于擺脫追蹤，他們一路小跑趕往城隍廟，鄭鐵崗一路把許顯純引到樹林，許顯純下令把鄭鐵崗抓起來，鄭鐵崗不費吹灰之力把錦衣衛全部殺死，許顯純趁機從背后偷襲鄭鐵崗，兩個人大打出手，有兩個錦衣衛隨后跟來，他們和許顯純聯手對付鄭鐵崗，鄭鐵崗被一劍穿心，他拼盡全力把許顯純打死。
耿玉京聞訊趕來，鄭鐵崗因為傷勢太重已經無力回天，他把熊廷弼的“遼東策”拿出來，讓耿玉京交給袁崇煥，叮囑他務必找到鄭巧兒。說完這些話，鄭鐵崗就撒手人寰了。張公公奉命押送熊廷弼去法場，不明真相的百姓網熊廷弼身上扔雞蛋和爛菜葉，大罵他是賣國賊。
行刑時刻一到，劊子手剛想把熊廷弼斬首，天上突然雷電交加下起了大雨，熊廷弼仰天大叫，慷慨赴死。
鄭鐵崗死后，耿玉京再次陷入迷茫，不知道該何去何從，有一個蒙面黑衣人突然來找耿玉京，帶他來到郭璞的墓前，黑衣人使出七星劍法，自稱他叫郭璞，是郭東來的兒子，耿玉京把郭璞當年寫給父親耿京士的信拿出來，郭璞把鄭巧兒叫出來，耿玉京和鄭巧兒久別重逢，兩個人抱頭痛哭，郭璞見狀趕忙躲開。
耿玉京一直堅信鄭巧兒還活著，可是始終杳無音信，沒想到鄭巧兒除了養腿傷，就是盼著耿玉京來找她，鄭巧兒發誓再也不和耿玉京分開，迫不及待想去找爺爺，耿玉京只好承認鄭鐵崗已經死了，鄭巧兒傷心地痛不欲生。
耿玉京帶鄭巧兒冒雨來墳前祭拜鄭鐵崗，鄭巧兒跪地不起，哭得撕心裂肺，后悔把鄭鐵崗一個人留下來，耿玉京只能對她好言相勸，鄭巧兒端起酒壺一飲而盡，想和鄭鐵崗最后醉一回。牟一羽和西門燕來到城隍廟，西門燕不放心耿玉京，牟一羽堅信耿玉京能安全逃出來。耿玉京帶鄭巧兒來祭拜戈振軍，發誓要把戈振軍的骨灰帶回武當，耿玉京越想越傷心，凡是和他親近的人，一個個相繼都死了，他不想再連累鄭巧兒，想讓鄭巧兒遠離他，鄭巧兒心甘情愿和耿玉京在一起。
耿玉京想再完成兩件大事，就帶鄭巧兒去沒人認識的地方，過男耕女織的安穩日子，鄭巧兒同意嫁給他，兩個人深情相擁，發誓這輩子再也不分開。金鼎和得知熊廷弼被斬首示眾，他才放下心來，終于除掉了心腹大患。
耿玉京向郭璞打聽外公何其武被殺真相，得知戴面具的黑衣人殺了何其武，郭璞曾經和黑衣人交過手，他在黑衣人的胸前留下來七個劍痕，耿玉京不由地想起他和??一起在河里游泳的時候，看到他的胸前有七點傷痕，可是他很快就否定了。
耿玉京想刺殺魏忠賢，郭璞隱姓埋名二十年都對他束手無策，即使耿玉京殺了一個魏忠賢，還會有其他人來禍國殃民，耿玉京只好作罷，他不甘心，決定教訓一下魏忠賢。郭璞連夜帶耿玉京來青樓踩點，這是魏忠賢一黨的新窩點。耿玉京闖進青樓，很快找到在喝酒做樂的魏忠賢，當場拔劍對準他，魏忠賢嚇得連連求饒，耿玉京削掉他一塊頭皮就揚長而去。
魏忠賢被耿玉京羞辱，他氣得大發雷霆，無量趁機說了牟滄浪很多壞話，魏忠賢派無量帶錦衣衛和東廠蕩平武當，答應事成之后讓無量做武當掌門，無量不敢耽擱，立刻帶隊前往武當。郭璞打聽到無量帶隊去武當圍剿，他趕忙來向耿玉京等人報信，耿玉京當即決定去武當增援，郭璞和他一同前往。
戴面具黑衣人給努爾哈赤飛鴿傳書，努爾哈赤得知魏忠賢派人去蕩平武當，他欣喜若狂，只要除掉武當這個心腹大患，統一中原就指日可待，努爾哈赤立刻讓金鼎和召集凌雪閣高手前往武當。
藍水靈下定決心去道觀出家，她特意來和東方亮辭行，東方亮一心只想程瑋天下第一劍，他對藍水靈無動于衷。牟滄浪逼不悔把藍水靈和耿玉京召回來，不悔斷然拒絕，牟滄浪就下令殺死了不悔的兩個弟子相威脅，當他得知藍水靈回到武當，立刻下令把她抓起來。
牟滄浪逼不悔五天之內把耿玉京找回來，否則就把藍水靈殺死，藍水靈誓死不屈，牟滄浪威脅要把東方亮一起找回來，讓他們倆一起死。東方亮功力大增，他再次來武當挑戰，他進門遇到力大無窮的大盜磐石，兩個人展開激戰，東方亮不小心受傷，他手起劍落就把大盜磐石打死。牟滄浪得知此事，派陸寒和軒北去迎戰。
東方亮在河邊清洗傷口，恍惚間看到藍水靈，他抖擻精神再去武當挑戰，常五娘看到這一幕，心里五味雜陳，遺憾沒有人對她如此癡情。東方亮來到武當，陸寒和軒北早已經等候多時，東方亮不費吹灰之力就把他們倆打翻在地，牟滄浪隨后站出來，東方亮逼他交出藍水靈。