慕容清見狄仁杰十分袒護武媚娘，心中醋意大發，耍起了女孩家的小性子，拽著侍女獨自離開，兩人逛到街上，看見長安城已經成了戒嚴狀態，小商販們不知何時才能安心做生意，民不聊生。慕容清與侍女兜兜轉轉，最后在城中租下了一家藥房，準備在此查找毒藥來源。而另一邊，蔣昊辰特意宴請狄仁杰與墨雨，他滿含深意地笑著，告訴狄仁杰一個驚人消息，朝廷四處偵查，最后認為慕容清最有嫌疑，所以將在兩個時辰后拘捕慕容清！但是，狄仁杰聞聽此訊卻面不改色，依舊安穩地吃吃喝喝，因為他相信自己有能力，去證明慕容清的清白。
常振風此時正在積極尋找恩人狄仁杰，當他們在街上相遇時，狄仁杰沒有推辭，而是讓墨雨當上了長樂幫的代理幫主，準備利用長樂幫的人手調查破案。在普世殿內，禁衛隊的高手們正在搜集證據，他們步伐輕盈，身姿凌厲，在不破壞現場的條件下，將案發情況一一繪畫存檔在紙上。蔣昊辰把所有資料都交給狄仁杰，另外給了他一把小錘，這是從王浩德身上搜出來的。狄仁杰看著小錘，仔細深思，王浩德為何要隨身帶著它呢？
墨雨和常振風一起在街上行走，談論著慕容清世家醫術高超，行俠仗義，若是有人膽敢對慕容清不利，江湖人士一定不會坐視不管的。果然，慕容清租下的藥房門口已經聚集了許多江湖人士，大家都絕對不會讓朝廷拘捕慕容清。另一邊，狄仁杰在普世殿內敲敲打打，尋找線索，蔣昊辰則一直跟在他身后。
很快，狄仁杰發現殿內的一扇門有些古怪，他明白了，王浩德隨身帶著小錘，就是為了尋找神秘門的。果然，狄仁杰與蔣昊辰發現了殿內的密室，地上有腳印，說明王浩德曾經與兇手在此處見面，那他為何要獨自見兇手呢？狄仁杰陷入沉思，這背后一定有一條能把所有線索串起來的線，只是現在還沒有找到。
蔣昊辰得知江湖人士在守護著慕容清，驚訝之余也有些忌憚，狄仁杰明白，朝廷不會魯莽和武林人士動手，這也等同于保護了慕容清萬全。狄仁杰來見武媚娘，發現她不禁沒有驚慌失措，反而在悠哉地畫著庭院里的牡丹花。武媚娘輕笑著，不是自己手巧，只是自己心靜。另一邊，慕容清和侍女在藥房里費力地研磨藥材，門外則是來勢洶洶的官兵和當仁不讓的武林人士。
狄仁杰一篇篇翻著資料，腦海中回憶著現場的每一個細小物品，他努力想找出隱藏在幕后的那條線索，突然，他靈光乍現，仿佛想到了什么。另一邊，在藥房門口，墨雨帶著長樂幫與蔣昊辰的人馬相持不下，就在雙方劍拔弩張的時候，狄仁杰及時趕到，他終于想明白了，王浩德為何要拼盡全力將殿內的書架撞倒，把現場弄得一塌糊涂，目的就是為了讓兇手盡快逃脫，而這個兇手就是對他來說最重要的人——王昭燕。
于是，狄仁杰拿出了一只耳環，那是在普世殿內找到的，王昭燕的耳環！這時，藥房的窗戶不知何時悄悄打開了，從里面飄出來淡黃色的煙霧，門外的眾人沒有察覺，開始只是有些輕咳，隨后就劇烈痛苦起來，用雙手死死卡住脖子。正當大家性命攸關時，慕容清帶著侍女緩緩走出來，她們戴著面紗，所以安然無恙，迅速給大家解毒。慕容清告訴眾人，這是一種新研制出來的奇毒，名字叫做“捏死我的溫柔”。
普世殿內，閻立本、狄仁杰、墨雨、蔣昊辰與慕容清商討著破案事宜。狄仁杰手里拿著王昭燕的耳環，詢問慕容清，王昭燕的死到底是怎么回事？慕容清此時終于說出了事情的原委，就在一個月前，王昭燕來到山莊尋找自己，她口口聲聲稱不愿意嫁到天威堂，一切都是哥哥逼迫的，懇請好姐妹慕容清救救自己。原來，王昭燕希望慕容清幫助自己假死，然后和心愛之人逃到大漠，慕容清無法推辭，只好幫忙，她當時將“死亡”的王昭燕運到后院時，就讓她離開了，然后尋找一具尸體冒名頂替，在這之后的事情，慕容清就一概不知了。
案情發展到此處，仍是謎點重重，慕容清告訴大家，傳說在幾十年前，有一位奇匠叫做洛紅塵，他精通各項工藝以及天文地理，洛紅塵一生最偉大的成就就是紅塵六絕，沒有人真的知道這六絕代表什么，隨著此人去世，六絕也消失了，但慕容清曾經聽姑姑說過，六絕中有一絕便叫做“捏死我的溫柔”，這種奇毒遇風就化為無形無味的氣體，可以令喉嚨如火燒般痛苦，又可以令雙手肌肉突然收縮，造成自己掐死自己的現象。
狄仁杰沉思了一會兒，忽然注意到地上有桐油的痕跡，這說明有人曾經有殿內放毒。狄仁杰關上了普世殿的大門，把煙霧彈放在殿內，帶領大家站在外面，只消片刻功夫，紅色的煙霧就從門縫里飄出，說明殿內有通風的密道。狄仁杰大驚失色，既然此毒藥隨風飄散，如果有人站在高處往京城內放藥，長安城就會變成一片鬼域。蔣昊辰決定增援天機堂的力量，來抓獲兇手。
狄仁杰知道，所有的玄機都在普世殿內，而王家兄妹很有可能是知情者，當務之急是趕緊找到王昭燕。
蔣昊辰與閻立本一起來到大理寺，閻立本對高深莫測的大理寺感到十分驚奇，可蔣昊辰微笑著表示，這不過是天機堂的一部分而已。身居樞密要職的申大人日理萬機，一直在此辦案，閻立本不得不對他表示佩服和尊敬。申大人詢問案情進展，蔣昊辰的表情變得嚴肅起來，這起案子很有可能與洛紅塵的后人有關。申大人聞聽此言，馬上變得緊張，洛紅塵是他最不想聽到的一個名字。
而狄仁杰在常振風的引導下，與墨雨來到了一處破破舊舊的城隍廟，據常振風所說，這個城隍廟的功能與天機堂如出一轍，只要能花得起錢，就能從這里打聽出所有想知道的機密。墨雨不屑一顧，認為眼前的破廟很不起眼，狄仁杰倒是很感興趣，準備在此求上一簽，提個問題，常振風趕緊叮囑他，提問題是需要花錢的。
狄仁杰命令墨雨給了香油錢，然后，他先提出了第一個問題，王昭燕現在身在何處？沒想到，竟然掉出了一個下下簽。常振風有些不好意思，下下簽代表城隍爺也不知道此事。于是，狄仁杰接著提第二個問題，洛紅塵有什么樣的過往歷史呢？這次，城隍爺終于顯靈了，一個低沉威嚴的聲音緩緩飄出：洛紅塵早已于幾十年前去世，他的后人也無影無蹤，而在紅塵六絕中隱藏著恩能夠稱霸天下的秘密，所以很多人一直在找洛紅塵的后人。
狄仁杰還想知道，到底什么是紅塵六絕？他再次加了香油錢，城隍爺告訴他，見過紅塵六絕的人寥寥無幾，除了他的后人，沒有人知道六絕的詳細資料，第一絕是毒藥，也就是“捏死我的溫柔”，第二絕是易容裝備，女為悅己者容，第三絕是一件天下最可怕的衣服，叫做“解鈴還須系鈴人”第四絕是大慈大悲普世殿，剩下的兩絕便無人知曉了?？磥?，普世殿是王昭燕的祖先所建造的。
另一邊，蔣昊辰也深知紅塵六絕的厲害，僅憑一招“捏死我的溫柔”，就能毒死長安城全部百姓，說不定它真的能夠改朝換代。據說，洛紅塵的后人有兩個，一個是洛秋山，但早已死去，另一個是洛秋燕，也下落不明。而王浩德的妹妹是收養的，年齡與洛秋燕正好相仿，說明王昭燕很有可能就是洛紅塵的后人！
而此時的王昭燕在睡眠中開始做夢，那是埋藏她內心深處的事情，在兒時，哥哥洛秋山把“捏死我的溫柔”交給自己，然后卻被幾個黑衣人殘忍殺死，黑衣人的目的就是想知道紅塵六絕的下落，但哥哥誓死保衛六絕的秘密，從那時起，自己就發誓為哥哥報仇。王昭燕從噩夢中驚醒，一個蒙面男子來到床邊，他是王昭燕的秘密情人，聲稱愿意為洛秋山報仇，只要拿到紅塵六絕，就陪著王昭燕去大漠遠走高飛。王昭燕告訴情人，自己在普世殿內找到了“解鈴還須系鈴人”，她要讓仇人穿上這件全天下最毒的衣服。
另一邊，狄仁杰希望慕容清能幫助王浩德醒來，這就需要藥王姑姑的幫忙，于是，狄仁杰和慕容清快馬加鞭離開長安城，準備前往藥王山莊。就在兩人駕車時，王昭燕突然從后面趕來，將兩人逼下了馬車，然后自己揚長而去。當狄仁杰和慕容清趕到山莊時，藥王姑姑看起來安然無恙，但是她拒絕幫忙救醒王浩德。這時，后院發生了怪事，有人偷走了所有鴿子，姑姑沒有將此事放在心上，而狄仁杰卻拉著慕容清去后院查看丟失的鴿子。
當他們離開后，姑姑偷偷拿出了一個大箱子，原來，藥王姑姑就是當時殺害洛秋山的兇手之一。狄仁杰發現被偷走的鴿子都放了回來，他和慕容清左思右想，卻不知道這個小偷要做什么，這時，山莊突然發生爆炸，在一片煙霧中，王昭燕出現在姑姑面前，將她打傷。