狄仁杰禁不住藍綾的苦苦哀求，只能幫助她打通了生死玄關(guān)，所謂生死玄關(guān)，就像是人的回光返照一樣，把剩下的精氣神匯聚成一股力量，使病人能夠迅速恢復短暫的活力，但是，這只不過是暫時的，等到油盡燈枯，藍綾還是會死亡。
打通生死玄關(guān)后，藍綾終于能從病床上走下來，與紅巾等人愉快地說說笑笑，一起逛集市，但是狄仁杰卻悶悶不樂，他始終難以忘記，藍綾終有一日會凄慘而死。而就在這時，潛龍王在附近的竹林中現(xiàn)身，狄仁杰有些吃驚，他不明白，藍綾與潛龍王無冤無仇，為何不能救她一命？潛龍王倒是振振有詞，能醫(yī)不自醫(yī)是六絕之一，如果狄仁杰有本事，便自己來拿好了。這時，四周涌出來許多黑衣人，朝著狄仁杰包圍過來，墨雨及時趕到，與黑衣人廝殺成一團，但是也難以抵擋強大的攻勢，潛龍王不慌不忙，他請狄仁杰與自己共飲美酒，狄仁杰只好前往。
潛龍王開始對狄仁杰進行洗腦，只要潛龍王當上了皇帝，那狄仁杰就是一大功臣，何樂而不為呢？潛龍王雖然一心想著與狄仁杰開創(chuàng)千古盛世，但狄仁杰可沒這個興趣，他毅然決然地打翻了酒杯，憤怒地闡述了自己的立場。潛龍王見他敬酒不吃吃罰酒，不禁冷冰冰地告訴他，自己的計劃已經(jīng)開始實行了，所以狄仁杰還是三思而后行吧。說罷，潛龍王帶著手下離開，他還是希望狄仁杰能夠妥協(xié)，所以并沒有傷害狄仁杰和墨雨的性命。
狄仁杰不忍心見到藍綾死去，他想點燃那只煙花，與潛龍王交換能醫(yī)不自醫(yī)，藍綾察覺到狄仁杰的想法，她十分真誠地與其聊天，自己身為一個微不足道的女子，能夠認識狄仁杰，已經(jīng)是人生中的一大幸運，如今，自己絕對不愿以一人之身交換天下百姓的安危，藍綾寧愿身死，也不準狄仁杰與潛龍王做交易。
那么，藍綾所能選擇的便是快快樂樂度過余下的光陰，狄仁杰與墨雨等人帶著藍綾去放風箏，大家十分開心地蹦蹦跳跳，藍綾稍微覺得勞累，便幸福地依靠在狄仁杰懷中，可沒想到，就在這一瞬間，藍綾便香消玉殞了，永遠地閉上了眼睛，狄仁杰悲痛萬分，與紅巾和墨雨一起安葬了藍綾。
曾公公收到了一封信，是潛龍王所寫，命令曾公公在三個時辰內(nèi)殺死皇上，否則就讓他尸骨無存。就在當晚，曾公公竟然爆炸死掉了！皇上也見到了潛龍王寫的密信，他大吃一驚，文武百官里也有人收到了潛龍王的威脅恐嚇，比如吳大人就收到了殺死皇上的指示！為了保護吳大人，皇上特意命令大理寺好好保護，沒想到吳大人也爆炸身亡！
狄仁杰意識到，這就是潛龍王所說的行動，也就是殺人密告！這時，皇上緊急召見狄仁杰和閻立本，希望他們二人能夠抓住潛龍王，狄仁杰看見，皇上因為潛龍王一事已經(jīng)氣血攻心，甚至頭痛欲裂，慕容清打算為皇上下針醫(yī)治，狄仁杰十分質(zhì)疑她的用意。
慕容清正準備為皇上施針，沒想到王福突然闖入，皇上大吃一驚，不知王福為何要刺殺自己！只見王福一臉無可奈何，他拿出了潛龍王給自己寫的信，內(nèi)容如出一轍，逼迫王福在三個時辰內(nèi)殺死皇上！話音剛落，王福痛苦萬分地捂住腹部，然后一陣白煙從他的口中緩緩飄出，就在剎那間，王福竟然爆炸了，衣服和血肉都炸成了碎片，在場眾人十分驚恐。
經(jīng)過這幾次三番的驚嚇，皇上準備遠離皇宮，悄悄潛到宮外，因為他認為皇宮實在太危險了，可是究竟哪里才是安全的容身之所呢？慕容清在一旁建議皇上去芙蓉園，于是，皇上欣然采納了這個建議，在他看來，芙蓉園是濮王居住的地方，沒有任何人比自己的親兄弟更可靠。因為這是重要機密，容不得半點泄露，最后，皇上將瑣事都交給武媚娘處理，將這件人肉爆炸案交給狄仁杰調(diào)查，自己則趕緊出門。
皇上喬裝打扮來到芙蓉園，見到了濮王殿下，兩兄弟見面似乎分外友好，皇上對濮王也是推心置腹，并未有任何提防之心。另一邊，慕容清已經(jīng)被關(guān)回了監(jiān)獄中，狄仁杰好心前來探望，但慕容清卻神色冷淡，對狄仁杰的種種關(guān)心置若罔聞，狄仁杰十分不解，自己的一片真心為何會換來如此對待？于是，他失落地離開了。
當?shù)胰式茏叱隼为z，一眼就看到了蔣昊辰，他告知狄仁杰，所有被害者的特點都是曾經(jīng)患過風寒，狄仁杰靈機一動，莫非問題出在太醫(yī)署開的藥方上？于是，狄仁杰火速來到太醫(yī)署，仔細查看了醫(yī)生們開的驅(qū)風丹，還讓墨雨認真地聞了聞，但是沒查出個所以然，倒是太醫(yī)劉大人直冒冷汗，看起來慌慌張張，原來，劉大人這幾天患了風寒，也為自己服食了丹藥！話音剛落沒多久，劉大人就表情扭曲，繼而口吐白煙，蔣昊辰喊了一聲快跑，隨即將劉大人一把推倒在案臺邊，劉大人的腹部撞擊后馬上爆炸了，所幸大家跑的及時，這才沒有受傷。
為了找出線索，狄仁杰一絲不茍地研究著丹藥，可是它明明只是普通成分制作而成，怎么會有如此大的威力，服下就會在人的肚子里爆炸呢？整個朝堂如今人心惶惶，這可如何是好。自從皇上離宮后，這宮中一切都是由武媚娘說了算，大臣們便紛紛向武媚娘靠攏，狄仁杰見此情景，不由得怒氣沖沖地質(zhì)問武媚娘，為何今日變得如此渴求權(quán)勢，這還是當初那個單純善良的武媚娘嗎？
武媚娘穿著華貴的衣衫，她再也不想過那種飽受欺辱的日子，所以必須強大起來。兩人言歸正傳，討論起爆炸案的始末，武媚娘認為，最可怕的便是禍起蕭墻，所以當務(wù)之急是千萬不能泄露皇上的行蹤，否則就會讓潛龍王如愿以償了。但是以長孫無忌為首的大臣們可不買賬，他們懷疑武媚娘把皇上關(guān)在了寢殿，囚禁了皇上的自由。關(guān)鍵時刻，還是狄仁杰出來作證，稱皇上是因為煩心案情，才不見任何人。長孫無忌咄咄逼人，就算皇上不理朝政，那攝政之人也應(yīng)該是太子，說罷，長孫無忌揚長而去，顯然，他并沒有善罷甘休。
紅巾和墨雨見到狄仁杰忙于破案，也為他焦慮不已，這時，幾人忽然從正在煮著的水餃中找到了靈感，那些爆炸而死的人就如同沸水中的水餃，當煮到一定溫度時，自然就破了皮兒。狄仁杰忽然想到，有一種礦物質(zhì)就有爆炸的特性，他們趕緊拿來實驗，卻沒有一種能夠正好符合要求。蔣昊辰自告奮勇提起一位善于煉制丹藥炸藥的術(shù)士方昭，狄仁杰雖然之前對蔣昊辰的立場有所懷疑，但見他態(tài)度誠懇，便暫且相信。
于是，狄仁杰與蔣昊辰來求見方昭，希望知道何種火藥能夠遇水而爆炸，方昭仔細看了看藥丸，他也束手無策，方昭唯一知道的烈性火藥便是黑火藥，但這種火藥需要點燃，藥丸進入人體后如何能點燃呢？蔣昊辰在一旁聽著，提出異議，這藥丸中可能混有白磷。狄仁杰否決了蔣昊辰的推測，白磷是見光才燃燒，而人體內(nèi)并沒有光線。
調(diào)查沒有頭緒，武媚娘卻突然傳召狄仁杰，她拿出一封奏章，上面寫著奏請?zhí)影殉殖砷L孫無忌輔佐朝政！狄仁杰大吃一驚，難道長孫無忌等人已經(jīng)知曉，皇上并不在宮中嗎？武媚娘未置可否，狄仁杰接著告訴她，太醫(yī)署開的藥丸中可能含有火藥，這才導致服用的人紛紛爆炸。
另一邊，在芙蓉園內(nèi)，皇上與濮王殿下悠然自得地下著棋，武媚娘與狄仁杰來訪，他們告訴皇上，宮中又出事了，然后便把那封奏章遞給了皇上。武媚娘本來對濮王有所防備，但皇上卻對其深信不疑，允許他在一旁聽著。當皇上知道長孫無忌逼迫自己將政權(quán)交給太子時，不免也有些擔心，武媚娘趕緊好言相勸，但皇上何嘗不明白，長孫無忌已經(jīng)有了逼宮退位的心思！
武媚娘給皇上出謀劃策，建議皇上將寫奏章的大臣貶去外地，這樣就能削弱長孫無忌的勢力，皇上依計行事，當場便頒了一道圣旨，長孫無忌聽聞圣旨內(nèi)容，臉上的表情十分扭曲，頹然地跌坐在地上。武媚娘得知此事，心中洋洋得意，可狄仁杰卻心中郁悶，他覺得自己不過是一顆棋子，被人反復利用，玩弄于權(quán)勢之間，實在可悲！而潛龍王和蔣昊辰則秘密謀劃著一切，他們不禁感慨，以前只把狄仁杰當做對手，卻忽略了武媚娘，只認為她是個弱女子，如今看來太輕敵了，武媚娘的實力不可小覷，令人堪憂！