阿部寬被拖往刑場，正要伏法之際，曲冀斐突然傳來康熙圣旨，不但拖延了阿部寬的刑期，還將譚振英貶為師爺，由包道德暫代順天府尹之職…一時之間包道德狂喜不已，譚氏兄妹則是無語問蒼天。
「刀下留人」、「罷官」二味心藥奏效，鐵札爾、香里寶二人無喜反憂，因為他倆個性正直，心里都清楚譚振英是位難得的清官，但是為了救阿部寬，鐵札爾、香里寶，只好對不起自己的良心了。
另一方面，譚振英意外遇見昔日情人徐雪吟，雪吟想逃避，不慎扭傷了腳，振英好心扶持，不料卻陰錯陽差的被香里寶撞見；里寶早就對振英懷有成見，這一次，他懷疑妻子雪吟必定是和譚振英舊情復發，倆人之間必有奸情，于是對振英更加痛恨。從此，更加深了里寶、振英彼此之間的心結，里寶更篤定了對付振英的決心。
譚振英的陰影，破壞了香氏夫妻原本恩愛的生活，雪吟極力澄清自己與振英向來清白，然而里寶醋海生波，硬是不信妻子所言，倆人爭吵不斷，都把怒氣發泄到香瓜身上，香瓜不禁大呼倒霉，一時之間惹出笑話連連。
時值邊關戰事越來越吃緊，喀爾丹叛軍燒殺擄掠，為禍甚烈，大批難民涌進了順天府，振英雖被貶為師爺，但不忍見百姓疾苦，于是背著包道德，開倉派糧賑災，如此善舉，令百姓們更加愛戴譚振英…
里寶亦得知振英賑救災民的義舉，他心里不禁矛盾掙扎，然而深陷于忌妒和仇恨漩渦中的他無法自拔。
難民大舉涌進皇城京師，驚動了朝中上下，文武百官齊呼要求康熙皇帝立刻派遣鐵札爾出兵平亂，康熙在眾臣輿論的壓力之下，忍痛下令，御賜婚配，命令小玉嫁給鐵札爾為續弦。
振英不忍妹妹就此葬送了一生幸福，趁夜命小玉潛逃他鄉，從此隱姓埋名。兄妹生離死別，令人唏噓。
小玉毀婚潛逃，所犯乃是「違抗皇命」、「株連九族」的重罪，包道德為求自保，特意前往提督府請罪，冀能藉由此舉，和譚氏兄妹撇清關系，不受牽連，并哀聲乞請義父鐵札爾。對他網開一面；就在同時，振英前來負荊請罪，坦言愿以一人承擔所有罪名，并求鐵札爾放過順天府上下。
至此，鐵札爾矛盾不已，因為他根本不想真的娶小玉為妾，也從來視譚振英為自己最得意的門生，毫無加害之意，但是為了救義子阿部寬，他只好把心一橫，佯裝無情。
譚振英被判欺君之罪，押入大牢候審，全城百姓、群情激憤，抗議朝廷陷害忠良，并遷怒里寶害慘了譚振英。某日百姓沖進香家，痛毆香氏夫妻，大罵里寶是非不明，這一次，里寶終于清醒了，他痛恨以往所作所為，持刀劈破了「刀筆傳香」那塊招牌。
小玉逃婚，遠走了他鄉，卻意外得知哥哥振英被關入大牢的消息。夜里，小玉潛入提督府，刺殺鐵札爾泄恨，不幸失手被捕，然鐵札爾卻未予私刑加害，反將小玉送入牢中，等候公平審判。
譚氏兄妹牢里重逢，不禁感傷，事情發展至此，已無人能再施援手。另一方面，里寶發誓封筆，不再為人訴訟，雪吟百般求他營救譚氏兄妹，里寶亦不改初衷；香瓜不忍再看見師傅、師娘為了譚振英而起了爭吵，于是決定離家出走，里寶好言慰留香瓜，終于在香瓜、雪吟的軟硬兼施下，里寶同意必定想出一個良策，不但能保住譚家兄妹性命，還能救出阿部寬，讓他隨鐵札爾出兵征戰。
公堂上，曲冀斐、包道德連袂審理譚氏兄妹欺君一案，過程中，振英、小玉爭相認罪，冀斐、道德為難，不忍定判，關鍵時刻，里寶翩然出現，并直言表示，唯有小玉答應下嫁鐵札爾，方可化解所有危機。幾經波折，小玉為了營救哥哥振英，決定犧牲自己，含淚答應出閣，委身于九門提督鐵札爾；振英自責痛心，道德、冀斐無奈的替小玉抱屈，里寶臉上更是難掩一份復雜的表情。
振英含淚送小玉上了花轎，康熙微服，亦在送嫁人群中，默默的隨行著，來到提督府門口，不料，鐵札爾竟已換上戰袍，出示一份休書，并要求譚振英放了阿部寬出獄，這門親事便可一比勾銷。振英為難，無法在情與法之間，立刻做出決定，康熙這時赫然出現，并答應讓阿部寬戴罪立功，隨鐵札爾揮兵平亂，終于平息了所有的風波。原來，這一連串發生的事，皆在香里寶的算計之中。城門外，大軍出關，鐵札爾赫見義子阿部寬，擋在路中等候，父子二人偕同踏上了征途。
風波結束后，里寶、振英亦化解了過往的心結，變成了一對莫逆的好友…