薩姆和比利是孿生兄弟，倆人長得一模一樣。菲爾把黑暗戰書放在了比利那兒，因為他有將東西變沒的本事。結果，監察者將比利抓走了，跟比利在一起的薩姆特工急忙將這一消息通知了菲爾。菲爾知道事情又出在基地的內鬼身上。
監察者將比利帶進了行駛在大海中的一艘潛水艇上。他們故意將比利和博士關押在一起。博士跟他套近乎，自稱也為神盾局工作被抓，并向比利提起了黑暗戰書。比利并沒有吐露。行刑者走進來，當他要用碎玻璃瓶頸扎進比利眼中時，博士在一旁看不下去了。他解開繩索站了起來，制止了行刑者。他想用不那么血腥的辦法得知真相。
菲茲正在修復博士的生化替身，他將替身額頭被槍擊落的皮膚又粘了回去，對他重新編程。不過，情況并不樂觀，博士替身顯然比艾達更加高級，菲茲失敗了。他不甘放棄，一再地嘗試，博士替身聊天時無意中提到，博士認識菲茲的父親，他們是同學，他講述著他們的往事，這使菲茲深受刺激，盡管西蒙斯在旁邊提醒他說這可能只是博士從檔案當中提取過菲茲父親的資料，以用來使菲茲分手的招數，菲茲情緒還是受到了影響，最后，他拔掉了替身的電源，替身終于閉了嘴，菲茲走出了房間。
西蒙斯告訴邁克，菲茲的父親總是打擊幼小的菲茲，總是說他笨，不聰明，而且在菲茲10歲的時候就拋棄了他，不知去向。
博士將儀器戴到比利頭上，他想直接從比利的大腦中讀取黑暗戰書藏匿之處。讀取后發現，黑暗之書原來不在比利手上，他們抓錯了人。
菲爾和黛西正在詢問薩姆，黑暗之書到底在哪兒。薩姆說也不在他手上，他把它交給了LT。LT是他們特工家族的老大。菲爾聽了，覺得LT有了危險，帶著生化梅和黛西趕去尋找。最后，在一個音樂廳里，他們找到了。LT是個女人，和一個長得跟比利、薩德一模一樣的兄弟在一起。菲爾將他們請回了神盾局。LT告訴他們，她把黑暗戰書最后給了比利。
博士在繼續讀取著比利的記憶，發現他最終將書藏進了神盾局的一間密室里。他讓艾達把他讀取到的密碼一一記錄下來，然后讓人調轉潛水艇，前往神盾局。
菲茲在西蒙斯安慰下，情緒穩定下來并且受到啟發有了新思路。他打開替身的頭顱，發現了他的量子大腦。功能可以跟人腦媲美。在測試過程中，西蒙斯突然想到了曾測試過的梅的大腦，跟博士替身的大腦相同。她吃驚得叫了起來。
此刻，生化梅正跟菲爾站在密室門口，等著薩姆取出黑暗戰書。生化梅對菲爾說也許應該一起進密室，并且誘惑菲爾接吻。這時，LT跑過來，說有三個人押著比利要闖進神盾局，薩德這時也帶著黑暗戰書走出了密室，并順手將書交給了生化梅。菲爾讓生化梅將書交給他，生化梅卻突然將槍口對準了他。生化梅聽到菲爾說她不是真正的梅時，有點吃驚。黛西趕來用震波震翻了生化梅。
菲爾帶著黑暗戰書，用它交換了比利，干凈漂亮地干掉了三個闖入者。這時，另一個手持真正黑暗戰書的薩德經過，翻倒在地的梅打暈了他，搶過了書，這時，博士走了進來，將書拿到了，拋下受傷的生化梅離去。
LT和三個長得一模一樣的兄弟，菲爾黛西等人聚在了一起，商量著下一步的措施。第一個艾達、博士替身被焚燒掉了，現在，生化梅還躺在神盾局里，因為大家覺得找不到梅，這個生化梅跟她還有些關聯。
