杰森興奮地給肖戰打來了越洋電話，肖戰面向中小用戶的免費策略開始起作用了，公司的點擊量突然暴增，直接導致了公司服務器的癱瘓，他們長期的努力和堅持終于得到了回報。杰森讓肖戰立刻回美國解決公司未來市場和規劃調整等問題。肖戰和小青戀戀不舍地離開了家。
肖戰的公司雖然迎來了曙光，但目前廣告收入所得的款項遠遠支撐不了買服務器等的開銷。他和杰森正在發愁，突然接到了一個大客戶的電話，立刻轉悲為喜。肖戰興奮地送了小青一束鮮花并向她報喜，他們不但不用賣房子了，公司也逐漸走向正軌。
小青也有好消息，她和威廉教授聯合署名的研究期刊發表了，并且已經成功提取了益母草中有益的五種成分。不過這也意味著，他們再次推后了回國的時間。但直到幾年后，小青申請的課題研究經費還是一次次地被拒絕，威廉教授坦言小青研究的課題被認可的機會實在渺茫。小青的耐心已經消失殆盡，她再次萌生了去意。
肖戰和杰森的公司正面臨著新的難題。因為互相網企業的廝殺越來越激烈，公司籌措資金的難度比之前更大了，肖戰也在到處找錢。杰森建議肖戰賣掉公司，但公司就像肖戰的孩子一樣，他不可能在公司遇到難關時輕易選擇放棄。
李十一被合作美國的保健品公司告了，聲稱在他提供的原材料中檢測出了不明成分。李十一立刻找到小青，小青覺得此事似乎沒那么簡單，又叫回了肖戰一起想辦法。為了分析清楚原因所在，小青連夜跑到實驗室再次對產品進行檢測，用數據證明了李十一的原材料沒有問題，而是合作公司將原材料與其他材料配伍的過程中產生了化學反應所致。李十一這才如釋重負。
小青將檢測報告拿給了李十一高額聘請的律師泰勒。泰勒在確認了小青的身份和履歷都無問題后，立刻帶著兩人來到合作公司進行談判，用鐵一般的事實把對方說的啞口無言。正當李十一以為自己勝券在握，興奮地要和律師商量給對方索要多少賠償款時，律師卻提出了會盡可能將李十一支付的賠償款壓到最低的一團庭外和解方案。因為這個案子如果移交到法庭，要把中草藥的問題向身為西方人的法官和陪審團講清楚簡直難于登天。
果然如律師所料，當雙方再次坐下來談判時，對方公司以小青在美國多年的研究都未能講清楚中醫藥的作用基理為由，強硬地讓李十一接受他們的賠償方案。律師建議李十一接受庭外和解，并且有把握這家公司會繼續接受李十一的供貨，李十一這次蒙受的損失也會在以后的長期合作中獲得補償。這是目前為止對李十一最有利的解決方案。
李十一和小青卻都不明白，為何他們明明拿出了可以證明自己無辜的證據，卻還是賠錢給對方。李十一一氣之下解雇了律師，律師好意留下自己撰寫的和解方案后離開。肖戰隨后而至，在看了律師的方案后倒非常認可。
肖戰代表李十一和對方重新坐在了談判桌上。因為小青的檢測報告足以證明李十一的原材料毫無問題，肖戰很有信心地向對方公司提出了將李十一的賠償數額減，以及在今后五年的貨款中分期扣除的意見。對方公司經過權衡利弊，同意了肖戰提出的和解方案。李十一冷靜下來后，也認識到這樣的結果比打官司劃算多了，便也不再糾結。
不過小青還是很自責，就是因為中醫藥在美國得不到認可，他們才只能是明明占理的前提下還要主動求著對方和解、賠錢。加之自己關于中醫藥方面的研究一直不被接受和認可，小青一氣之下便決定回國，她要利用在美國所學的這些知識，從中醫藥出發做出一款能被西方人認可的藥，以證明中醫藥的巨大價值。李十一作為回國發展的受益者，非常支持小青的想法，但肖戰聽后卻沉默不語。
艾薇發現自己的學生琳琳有口吃的問題，便偷偷找到他的父親杜天詢問原因，得知琳琳是因為家庭破裂才導致口吃的。杜天為了感謝艾薇，還主動送了兩張熱門音樂會的票，引起了劉侃的警覺。劉侃把勞累了一天的艾薇接回家，還下廚給她做了好吃的飯菜。艾薇很感謝劉侃對自己無微不至的照顧，也知道他對自己的心意，只不過艾薇現在無心談感情，就直白地告之劉侃不要在自己身上浪費時間了。
小青經過慎重考慮后，向威廉教授提交了辭呈，并迅速整理好美國的一切，坐上了回國的飛機。她很想在臨走之前就這個問題和肖戰再深入地談一次，但肖戰正巧出差去見投資人，而且多年來關于這件事兩人始終沒有達成共識，小青左思右想后決定把這個問題交給時間去解決。
小青一下飛機就直接回了老家探望父親，并向父親詳細陳述了自己立志回國研究中醫藥的原因。因為只有在中國，小青才能更好地研究傳承了幾千年的中醫藥，才能施展自己多年的抱負。而且小青已提前聯系好了一位父親的學生王管生，不日將赴建寧參觀考察他負責的產業園區。
肖戰此行并沒有如愿拿到投資，在得知投資人把資金全部投給了一家中國的互聯網公司后，肖戰頭一次懷疑自己堅持留在美國的正確性。因為小青的手機打不通，肖戰一回公司便發起了網絡視頻通話，得知小青已經不告而別回到中國老家了，頓時坐立不安，立刻要來了小青在國內的地址。
小青在王管生的引薦下，來到他負責的產業園參觀考察，同時商討落戶實驗室的問題。誰知她剛到就遇見了緊隨而至的肖戰。肖戰除了放不下心愛的小青，也想借回來的機會了解一下國內的互聯網發展。
兩人經過對產業園全方位的了解，對國內日新月異的變化和產業園的設施和配套都很滿意，而且小青的實驗室還得到了高校的垂青和參與，形勢一片大好。
小青的實驗室因為得到了國內高校的合作入股，所以學校程校長和專攻此項研究的陳教授也一起陪同小青和肖戰參觀園區。事后，程校長單獨詢問了陳教授對小青的看法，他有些擔心一把年紀的陳教授不甘心做年輕后輩的副手。陳教授此前是通過小青發表在國際期刊上的文章知道她的，但至于是不是真本事，嚴謹的陳教授還要靜觀成效。
李十一言出必行，叫著孫建國和蘇麗娟兩口子給小青和肖戰接風洗塵。與孫建國和蘇麗娟終于修得正果不同，朋友們得知肖戰安頓好小青后就回美國后，紛紛對兩人即將開始的跨國異地戀唏噓不已。
杰森因為公司資金告急給肖戰打來了越洋電話，催促他及時回美國解決。小青知道杰森肯定遇到了很棘手的問題才催促肖戰回去的，便打算幫肖戰買第二天回美國的機票。肖戰卻因為舍不得小青，萌生了放下美國的一切回國與小青結婚的想法。小青雖然很感動，但她也最了解肖戰，她不想讓肖戰做會讓自己后悔的事。
肖戰飛回了美國，小青便請來了李十一協助實驗室裝修等問題。李十一果然是個很得力的幫手，不僅從裝修方案到材料選擇再到討價還價等等事必躬親，還不抓住一時機幫助小青籠絡、維護關系，讓小青感動不已，連連道謝。李十一還很認真地向小青提出要入股公司，因為他不僅看好小青的為人，更看好小青目前從事的事業和研究。
小青的創業之路并非一帆風順，剛開始便遭遇了從美國進口的實驗室器材在海關被扣的狀況，好在有王主任主動伸出援手，積極協調解決了此事。實驗室的裝修方面也是困難重重。因為小青對實驗室的裝修標準特別是通風系統要求極高，極少有公司能做到。兩人便拿上圖紙，主動上門挨家挨戶的詢問，終于功夫不負有心人，有一家公司愿意虧本為他們攻克難題，讓小青感激不盡。
肖戰孤身回到美國后，更加思念心愛的小青了，做什么都打不起精神。與此同時，他和杰森在公司未來發展方向上再次產生了分歧，迫于資金的壓力，肖戰采納了杰森的提議，開啟了公司的并購之路。
然而，在長達兩個月的并購談判后，肖戰和對方的并購方案依然沒有談妥。因為對方遲遲不肯在合同上明確CEO的名字，肖戰并非在意CEO的職位，而是擔心如果輕易將這個位置讓出，那么將來公司的發展方向可能會永遠地背離自己的初衷，這是他的底線，肖戰不愿放棄。
小青父親的老毛病又犯了。村長建議他盡早告知小青。小青父親卻不愿讓女兒擔心，選擇了隱瞞。幾個月后，正在裝修實驗室的小青接到了父親去世的電話。小青在李十一的陪伴下回到家中，抱著父親的遺照流下了傷心的淚水。