趙雅琴、林玉仙和中村被押至刑場，開槍令下后，槍中卻沒有子彈，原來這是老板為了驚嚇他們而故意安排的。老板再次要求趙雅琴制造炸彈，雅琴竟然答應了。原來雅琴心中已經有了逃走的計劃，炸彈是這個計劃中的重要工具。
莎莉開船抵達重慶的九號碼頭，燕雙鷹趕她回家，莎莉欲留不得，一氣之下離開了燕雙鷹。莎莉與父親久別重逢，一時間委屈辛酸涌上心頭，傷心痛哭。吳玉霞見到莎莉后，詢問了燕雙鷹的情況，并告訴莎莉燕雙鷹趕走她其實是為了保護她。考慮到燕雙鷹的傷勢和危險處境，吳玉霞決定盡快找到燕雙鷹，莎莉堅持同去，并向家人表達了自己對于燕雙鷹熱烈的愛。
趙雅琴三人使計逼迫守衛離開他們的房間，以便偷偷制造逃跑用的炸藥。老板讓雅琴制造的炸彈非常特殊，它的上部留出了一定空隙，中村解釋說這是為了植入病毒而特意設計的，這種炸彈能使病毒在空氣中迅速傳播，致使人畜大面積感染。
負傷的燕雙鷹東躲西藏，最后藏身于江邊一間小屋中，他仔細回憶了風雷行動實施以來的重要細節，一個驚人的答案逐漸浮出水面……
吳玉霞找到錦玉，并詢問她燕雙鷹的下落，錦玉認為吳玉霞是來抓捕燕雙鷹的，因此拒絕協助他們。錦玉和如常在江邊小屋找到了燕雙鷹，三人見面分外高興。如常童言無忌，透露出錦玉對雙鷹的思念之情。錦玉協助燕雙鷹來到高進所在的雜貨店，在如常的指引下，燕雙鷹與高進終于久別重逢。
燕雙鷹向高進交待了押送老板的天風號被襲以來的大概情況，指出吳玉霞就是J細，并告訴他自己的藏身之處，請他送來武器和藥品。告別時，燕雙鷹暗中塞給高進一張紙條，高進看后驚詫萬分。
此時，趙雅琴三人已經做好炸藥，準備趁夜一舉逃出防空洞。傍晚，高進乘著小船如約來到被蘆葦所圍繞的江邊小屋，燕雙鷹將其迎進屋。搜索隊駐扎在九號碼頭，錦玉突然出現并要求面見吳玉霞，這令吳玉霞和莎莉頗感意外。
深夜時分，雷雨將至，幾條小船緩緩靠近小屋。燕雙鷹被突如其來的拜訪驚醒，他發現來者竟是李延平！J細不是別人，正是第二野戰軍情報處處長、風雷行動策劃者和組織者之一的李延平！早在幾個月前，李延平和王主任兩人就被老板擒獲，老板用生死相逼、利益誘惑的方式成功收服兩人，讓他們與自己一起設計挖出情報員五號。
正當李延平頗為得意時，卻發現吳玉霞率領部隊將小屋重重包圍。原來燕雙鷹已經思考出真相并策劃了“請君入甕”的好戲。
燕雙鷹放心不下趙雅琴，因為李延平身份的確認也就意味著林玉仙并沒有棄暗投明，她一直是老板忠實的走狗，雅琴和中村處境堪憂。李延平被捕后，燕雙鷹立刻趕往防空洞與老板和黑狼進行最后的戰斗，他牽掛雅琴的安危，也擔憂病毒炸彈可能造成的毀滅性后果。
最終，燕雙鷹銷毀了病毒、擊斃了黑狼和林玉仙，抓獲了老板，然而趙雅琴和中村卻為此獻出了自己的生命。