在燕子精神和強大的意念下，李三挺過了難關，為自己爭取營救的生理時間。東方玉和馬小宛找到解藥，救下李三，李三確定將計就計，命小七等人在城中大肆購買花圈冥紙，為燕子俠之死造勢。果真，燕子李三的死傳到了日本商會，菊村命山木趁機將搗毀燕子門，將其連根拔起。渡邊擔心山木越權，派陳宇尾隨。
陳宇嗅到了一絲不對勁，借口讓山木打前陣，沒想到卻被燕子門里早已埋伏好大炮轟成了碎片，陳宇等人趁亂逃離。李三利用山木等人搗毀燕子門的時間差，救出了大牢里的方俊生，又從方俊生口中得知了菊村來濟南城的目的，李三和東方玉一同想到了李云飛的寶藏，李三決定再探一次師父留下的寶藏。
果真如李三等人所料，菊村來中國的目的確實是李云飛的寶藏。菊村在警察署的井里發現了寶藏的秘密，得意忘形之時，死于重生的燕子俠李三手下。李三將菊村的尸體放在了日本商會大牢外，混淆視聽，菊村的死令渡邊和陳宇大為震驚。唯一知道寶藏秘密的菊村已死，于是李三等人開始計劃運輸寶藏一事。
陳宇根據菊村尸體的推斷，來到了警署，在井口發現了菊村的血跡，印證了他的推理。隨后，陳宇和王峰來到了井下，發現了真正的寶藏。為了不遭到來自東京的壓力，渡邊打算讓陳宇背這個黑鍋。
陳宇本想利用寶藏的事情來牟利，卻被渡邊迫害。王峰不得不將寶藏的秘密告知渡邊，卻也難逃一死。為了能夠順利將寶物全部運出城，李三事先將寶物分給老百姓，然后自己做誘餌吸引了日軍的注意力。為了抓住李三，渡邊派出了菊村調來的狙擊手小隊，沒想到狙擊手并沒有殺死李三，反倒被李三各個擊敗。
渡邊利用李三和狙擊手對抗的時間差，迅速調集好火力，一頓炮火，將李三擊倒捕獲。渡邊抓到李三后，嚴刑拷打，決定將燕子李三吊在城門上示眾。在城門前，渡邊將李三的生死交給全城的百姓，只要他們同意李三死，百姓們就能活下來，反之，如果要李三活著，百姓們就不得不死。
令渡邊意想不到的是百姓們寧可自己去死也要讓心目中的燕子俠活著。這時，渡邊心愛的養女美子居然在城墻上用中國話大喊打倒日本鬼子。一旁的日本士兵將美子打死，渡邊受刺激分神，被李三趁機脫身并將其殺死。
方俊生的部隊趕到，和東方玉帶領下的燕子門一起奮力抗擊日本鬼子。這場持續了三天三夜的戰爭之后，誰也沒有見到過燕子俠，誰也不知道燕子俠身處何處，但是燕子門的弟子越來越多，他們懲惡揚善，抗擊敵寇，活躍在整個山東地區。
