在哈迪斯死后，戈登在哈迪斯的塵土中找到了一塊殘留的水晶塊，眾人以為水晶都消失了，但是沒想到水晶依然存在，并且戈登還準備用這塊水晶來復活自己心愛的貝爾。
在虎克死而復生后，艾瑪非常開心，但是心里又很擔心，艾瑪擔心的是瑞金娜，瑞金娜的丈夫羅賓才剛死，但是卻沒能受到宙斯的復活，艾瑪害怕瑞金娜心里嫉妒，心里的黑皇后又再度出現，便想要去和瑞金娜好好說這件事情，突然這個時候，外婆家的店鋪一陣晃動，整個童話鎮都震動了起來，原來是戈登在奧林匹斯水晶收集整個童話鎮的魔法，才會引起騷動，這時虎克擔心艾瑪，沖了進來，被眾人看到，瑞金娜才知道艾瑪要說的是這件事。
眾人趕到了戈登施展魔法的地方，發現戈登早已經離開，但是知道了戈登要用魔法救活貝爾，于是想要去找到戈登阻止他拿童話鎮的魔法去做壞事，艾瑪擔心瑞金娜現在心情不穩定，不想讓瑞金娜去，但是瑞金娜現在心情已經非常激動，艾瑪和瑞金娜兩個人便吵了起來，被亨利聽到了兩位媽媽的吵架，心里非常難過。
亨利覺得這一切都是魔法惹的禍，他決定要用自己的能力消滅所有魔法，這樣大家就能回到從前開心的時候。亨利找來了自己的初戀紫羅蘭，想要紫羅蘭能夠支持自己，幫助自己，紫羅蘭很樂意幫助亨利。亨利利用自己手中的魔法筆將戈登手中的水晶送到了自己手上，兩個人就這樣離開了童話鎮，去尋找消滅魔法的方法。戈登找到了艾瑪和瑞金娜他們要他們去找到亨利，不然童話鎮這個由魔法構成的小鎮就要消失了，艾瑪和瑞金娜兩個人一起急忙去尋找亨利。同時，在童話鎮，瑟琳娜和其他英雄在使用傳送魔法送其他魔法森林的眾人回家，但是因為童話鎮的魔法被水晶吸收了，導致魔法不穩定，瑟琳娜眾人被卷入一個未知的區域。
在這個地方，瑟琳娜他們受到了襲擊和關押，而手中的魔法棒卻斷了，眾人正在發愁如何離開這個地方。另一方面，瑞金娜和艾瑪兩個人通過魔法知道了亨利在紐約便過去尋找了，戈登聽到兩個人的對話也趕過去了紐約。期間，瑞金娜和艾瑪兩個人的誤會也漸漸解開，不再吵架。
亨利和紫羅蘭去了圖書館查找當初自己父親的足跡，因為自己父親尼爾也曾來此找過消滅魔法的方法。瑟琳娜一伙在那個未知區域受到了威脅，不過卻有一個醫生過來要幫助英雄們逃出去，要求是要帶自己回童話鎮。在圖書館中，亨利看到了一部分自己不知道的童話故事，還找到了一個和圣杯一模一樣的黑暗圣杯，亨利覺得這個圣杯可以吸收魔法。當他們要出門的時候，被突然出現的戈登弄暈在地。醫生將瑟琳娜的魔法棒拿到實驗室修復，但是這個時候看管的人讓醫生喝下一管藥水，醫生瞬間變成了那個兇惡的典獄長，原來典獄長是醫生內心的黑暗面，喝下藥水后就會顯現出來，典獄長決定要在魔法棒上做手腳，讓自己也能去到童話鎮，自己在這個鬼地方已經呆煩了。
戈登從亨利手中拿到水晶后，準備用魔法將潘多拉魔盒中的貝爾救醒，不過在這時在另一個世界的典獄長用魔法棒召喚出了一個傳送陣，將魔盒帶走了，戈登心里很著急，他要趕緊找到魔盒。
英雄們被困在未知地方后，醫生答應要救他們，早晨醫生清醒過來，還不知道昨晚發生了何事，但是他看見守門人熟睡了，便將鑰匙偷了過來，把英雄們都帶出去了監牢，英雄們出去后，發現自己身在一處陌生的國度，這里形形色色的人，像是各個國家的人都聚集到一起一樣，這里是各國被驅逐人的天堂，他們在這里安身立命，尋找避風港，也被稱為“未知故事之國”。
亨利和紫羅蘭以及瑞金娜和艾瑪四個人同時在尋找著戈登的去處，要戈登手上的水晶救回其他被困在未知故事之國的英雄們。戈登由于魔盒被搶走了，便想要去將魔盒搶回來，在酒店的上方出現了一大片烏云，四個人看見過也趕了過去。瑞金娜假裝要和戈登合作，以黑皇后身份示意，要和戈登合作救回大家。同時在故事之國里，醫生帶眾人去了自己的住所，去配置最后一劑藥劑，而這時看守人也趕了過來讓醫生喝下藥水，醫生又變身為黑暗典獄長。在酒店里，艾瑪和瑞金娜合作要去偷水晶但是被戈登識破，原來戈登是故意引瑞金娜進來要的是要和瑟琳娜有關的物品才能去到故事之國，正當戈登要殺死瑞金娜和艾瑪的時候，亨利出現了，他用圣杯將戈登的魔法已經水晶上的魔法都吸收到圣杯中，這下連黑暗使者都沒了魔法，但是這時亨利才聽說戴維他們被困在其他地方回不來，要魔法才能回來，亨利覺得自己做錯了事情，便跑了出去。
在故事之國，醫生打下了那劑新配置好的藥水，藥水的功效就是將自己內心的善惡分開，典獄長和醫生兩個人便由此分開，而英雄們這時候卻返回來救了醫生。
艾瑪去安慰亨利，覺得一切都還有救，要亨利不要自責，畢竟這一切他都不知曉。戈登帶著瑞金娜去了一個藥鋪，藥鋪老板是一名叫龍爺的老先生，這個老先生是現在唯一能找到擁有魔法的人了，他們想要龍爺幫助他們打開傳送門，龍爺因為瑞金娜內心與黑皇后斗爭決定要幫助他們。但是在使用魔法的時候卻發現龍爺一個人的能力并不夠，不能打開傳送門。龍爺說了身邊周圍都是魔法總會有辦法的，亨利在這個時候想到了，可能還有一個方法，就是公園許愿池，亨利和瑞金娜以及艾瑪和戈登還有紫羅蘭5個人分別拋硬幣許愿，果真水晶有了反應，這個方法確實能過收集魔法，亨利便讓路過的群眾一起來幫助他們許愿，這樣就能收集到足夠的魔法，救出英雄們，這個方法奏效了，水晶上面的魔法一點一點收到人們的影像，逐漸收集到了足夠的魔法，這時候在故事之國的英雄們正在和典獄長斗爭看到傳送門知道瑞金娜他們來救他們了便都跳了進去，英雄們紛紛出現在了水池之上。
戈登趁著這個間隙進去了未知故事之國，找到了典獄長，要典獄長交出魔盒，典獄長說有辦法可以救出他的妻子，要和戈登做交易。瑞金娜使用醫生的善惡分離藥劑，讓自己心里一直折磨自己的黑皇后從自己身體分離出來，并且瑞金娜自己親手殺死了黑皇后。亨利和紫羅蘭兩個人的感情越發親密。但是在童話鎮上卻出現了一個不該出現的人，就是典獄長。原來典獄長和戈登做的交易就是自己提供情報，戈登要幫助他去童話鎮。而同時，在龍爺的住所，被瑞金娜殺死的黑皇后卻又復活了，黑皇后向龍爺他們這群光明魔法發起戰爭，還奪取了龍爺的心臟。