善妒的皇后對(duì)于乾隆長(zhǎng)期以來(lái)的風(fēng)流韻事早有不滿(mǎn)，此回乾隆居然平白無(wú)故冒出了個(gè)來(lái)自民間的女兒，又被令妃所照料著，更是使她心有芥蒂，強(qiáng)烈排斥著小燕子。但乾隆的整顆心早己沈溺在當(dāng)年和夏雨荷間山盟海誓的往事中，因此即使小燕子在對(duì)質(zhì)的過(guò)程中有許多敘述不清的地方，乾隆仍舊認(rèn)定了小燕子就是他失散多年的女兒。再加上由小燕子口中得知夏雨荷已過(guò)世的消息，更令他想藉著這個(gè)時(shí)機(jī)，好好的補(bǔ)償小燕子多年來(lái)所欠缺父愛(ài)。?在大臣紀(jì)曉嵐的建議下，小燕子以義女的名義，被乾隆封為“還珠格格”，并準(zhǔn)備在祭天大典時(shí)，召告天下世人。紫薇于祭天大典時(shí)發(fā)覺(jué)小燕子竟成了格格，這使她驚訝不已，直覺(jué)認(rèn)定小燕子背叛了自己，因而在街上情緒失控的大吼，卻換來(lái)了官兵們的一陣毒打。?爾康發(fā)覺(jué)事有蹊蹺，將紫薇帶回家中療養(yǎng)，加上紫薇對(duì)于夏雨荷之事的詳盡敘述，使得眾人對(duì)于小燕子的身份，開(kāi)始起了懷疑。
小燕子為求能見(jiàn)紫薇一面，居然將自己化妝成了小太監(jiān)，并打算趁深夜里偷溜出宮，但皇宮禁備深嚴(yán)，豈會(huì)讓她如此輕易地就離開(kāi)。乾隆得知此事后，雖然原諒了小燕子，卻也堅(jiān)定了乾隆要好好教導(dǎo)小燕子禮數(shù)的決心。?紫薇得知了小燕子偽裝出宮欲見(jiàn)自已之事而感動(dòng)不已。在爾康及爾泰的建議下，眾人決議將事實(shí)告知永琪，透過(guò)永琪的里應(yīng)外合，盡快讓紫薇及小燕子見(jiàn)面，好讓事情及早水落石出。?小燕子在永琪和爾泰的面前，竟然沒(méi)推托的便將事實(shí)全招了，而當(dāng)她得知紫薇如今在福家之時(shí)，更是雀躍不已，不分由說(shuō)的就要立即去見(jiàn)紫薇。?永琪適時(shí)向小燕子分析了事情的嚴(yán)重性，小燕子這才知道自己犯下了欺君大罪。此時(shí)，正巧皇后來(lái)探，小燕子不慎冒犯皇后，而被容嬤嬤打了一耳光。永琪見(jiàn)情勢(shì)危急，急忙請(qǐng)出了乾隆。
小燕子和皇后間的風(fēng)波在乾隆的出面后終告平息，但皇后對(duì)小燕子的敵意卻是更加的濃厚了。小燕子漏夜寫(xiě)了封信托永琪帶給紫薇，原來(lái)大字不識(shí)幾個(gè)的小燕子托人帶來(lái)的是畫(huà)不是信，正當(dāng)眾人猜不透小燕子畫(huà)中之意時(shí)，紫薇竟將小燕子的畫(huà)用詩(shī)表達(dá)出來(lái)，令眾人對(duì)紫薇的才情佩服不已，尤其是爾康。?紫薇從畫(huà)中得知小燕子乃是身受重傷才得以入宮，又知道乾隆仍未忘了自己的母親。在深思之下，紫薇決定放棄認(rèn)親之事，將此秘密永藏心中。正當(dāng)紫薇打算離開(kāi)的同時(shí)，爾康為留住紫薇，忍不住地向紫薇告白了，爾康此舉令紫薇震懾不已，居然點(diǎn)頭答應(yīng)留下，也不再掩藏彼此之間早已滋長(zhǎng)的情愫。?乾隆為調(diào)教小燕子，命令小燕子和眾阿哥等人一同上課，幸得永琪和爾泰的幫忙，才讓小燕子安然渡過(guò)此難關(guān)，也為平靜的課堂帶來(lái)了笑聲及活力。?不料，皇后此時(shí)卻降低姿態(tài)向乾隆示好，終于由乾隆口中取得了教養(yǎng)小燕子的權(quán)力。