恐龍島發(fā)生危機(jī)在2015年侏羅紀(jì)公園發(fā)生大災(zāi)難的三年后，納布拉爾島再次成為世界媒體和輿論的焦點(diǎn)。三年里，島上的恐龍自給自足，與人類文明世界相安無(wú)事。最近該島長(zhǎng)期休眠的火山被重新歸為活躍，且有大規(guī)模噴發(fā)的跡象，地質(zhì)學(xué)家預(yù)測(cè)將會(huì)發(fā)生滅絕事件。關(guān)于是否要保護(hù)生活在納布拉爾島上的恐龍，引發(fā)了全球媒體大討論。美國(guó)國(guó)會(huì)為此召開聽證會(huì)，聽取各方述求。三年前大混亂讓很多人心有余悸，不采取任何預(yù)防措施，任由恐龍自生自滅的觀點(diǎn)逐漸占了上風(fēng)。很多動(dòng)物保護(hù)組織不希望恐龍滅絕事件再次上演，其中就包括了原侏羅紀(jì)主題公園的運(yùn)營(yíng)主管克萊爾。身為恐龍保護(hù)組織的負(fù)責(zé)人，克萊爾極力游說(shuō)議員。雖取得了一些成果，但大勢(shì)所趨，國(guó)會(huì)最終決定將恐龍的命運(yùn)交予上帝裁決。國(guó)會(huì)的決議無(wú)異于宣判那些存活在小島上的史前生物死刑。就在克萊爾失望之際，接到了一通電話，對(duì)方自稱米爾斯，是本杰明·洛克伍德遺產(chǎn)管理人。本杰明·洛克伍德是“侏羅紀(jì)公園”的兩位創(chuàng)始人之一，聽到這個(gè)名字，克萊爾心中又燃起了一絲希望之火。按照米爾斯所說(shuō)的地址，克萊爾應(yīng)邀來(lái)到了位于加州的洛克伍德莊園。一座上百年歷史的古城堡聳立在樹林掩映之間，克萊爾剛下車就被其氣勢(shì)所折服。就是在這里，約翰和本杰明共同從琥珀中提取出恐龍基因，讓滅絕的生物重現(xiàn)世間，開辟了生物學(xué)新篇章。納布拉爾島、侏羅紀(jì)公園，所有的一切都是起始于城堡下的實(shí)驗(yàn)室。步入大堂，墻壁上眾多人物油畫中，她一眼就認(rèn)出另一位創(chuàng)始人約翰·哈蒙德的畫像。克萊爾心生崇敬之情，正欣賞著，身后傳來(lái)米爾斯的聲音。七、八年前克萊爾和米爾斯有過一面之緣，當(dāng)時(shí)米爾斯剛剛大學(xué)畢業(yè)，就負(fù)責(zé)經(jīng)營(yíng)本杰明·洛克伍德的基金。二人邊說(shuō)邊穿過大堂里擺放的恐龍化石標(biāo)本，走向展示臺(tái)。展示臺(tái)上是一座環(huán)形島嶼的模型，那是米爾斯為納布拉爾島恐龍們找到的庇護(hù)所。四周有山脈形成天然屏障，其間水草豐美足夠恐龍?jiān)诖朔毖苌ⅰＤ暧饩攀谋窘苊髯喴蝸?lái)到克萊爾面前，尋找這個(gè)庇護(hù)所是他和約翰生前的最后愿望，讓那些史前恐龍能自由、不受人類打擾的繼續(xù)生存于地球上。這個(gè)老人的內(nèi)心始終充滿了愧疚，當(dāng)年意氣風(fēng)發(fā)的他們使用了基因技術(shù)，就如同還未學(xué)會(huì)走路就想著跑步的小孩。當(dāng)意識(shí)到危險(xiǎn)時(shí)，已為時(shí)太晚。這座庇護(hù)所建立，只能算是本杰明贖罪道路上的一站。
邀請(qǐng)歐文明白了本杰明的心意后，克萊爾全力以付要為老人實(shí)現(xiàn)愿望。小島上的每只恐龍都有可用于追蹤的ID晶片，如果能利用這點(diǎn)，米爾斯組織的抓捕小隊(duì)就可以更快速的捕獲恐龍，在火山爆發(fā)前將它們運(yùn)往庇護(hù)所。但三年前的混亂讓?shí)u上的控制中心停止了工作，需要克萊爾的掌紋重新登陸，激活追蹤系統(tǒng)。在這些恐龍里，米爾斯更關(guān)心的是一只藍(lán)色的迅猛龍。它有著僅次于人類的智慧，是世界上獨(dú)一無(wú)二的恐龍。
克萊爾知道米爾斯所說(shuō)的迅猛龍是指“小藍(lán)”，小藍(lán)能在一英里外就察覺到捕獵者的氣味，讓捕獵者永遠(yuǎn)找不到抓住它的機(jī)會(huì)。要想安全轉(zhuǎn)移小藍(lán)，就必須得到一個(gè)人的幫助，退伍軍人歐文。歐文曾在“侏羅紀(jì)公園”以軍方訓(xùn)練海豚的方法訓(xùn)練過迅猛龍，在那段時(shí)間里與小藍(lán)建立起能夠相互交流的方式。要想找到小藍(lán)，非他莫屬。克萊爾馬不停蹄的趕到西雅圖，找到正在雷尼爾雪山腳下，過著悠閑生活的歐文。兩人之間一段短暫的感情史，歐文至今耿耿于懷。而且米爾斯已經(jīng)聯(lián)系過歐文，被歐文回絕。既然話不投機(jī)，克萊爾也不勉強(qiáng)。感情的事就是這樣，心里越記恨，實(shí)際上越放不下。晚上，歐文獨(dú)自坐在電腦前，看著訓(xùn)練小藍(lán)時(shí)的錄影資料，想著與克萊爾一起從暴虐霸王龍利爪下死里逃生的經(jīng)歷，心中改變了主意。清晨時(shí)分，克萊爾來(lái)到機(jī)場(chǎng)，要搭乘輕型飛機(jī)前往納布拉爾島。坐上飛機(jī)，她不由自主的透過舷窗望向機(jī)場(chǎng)外，巴望著能在最后時(shí)刻看到歐文的身影。這時(shí)，歐文伸了個(gè)懶腰，從機(jī)艙最后排座位上坐了起來(lái)。克萊爾又驚又喜，臉上卻裝出毫不在乎的表情，簡(jiǎn)單的介紹了同行的系統(tǒng)分析師富蘭克林和古生物獸醫(yī)琪雅。飛機(jī)在朝陽(yáng)的照耀下起飛，經(jīng)過幾小時(shí)的海上飛行，終于平穩(wěn)的降落在納布拉爾島簡(jiǎn)易跑道上。故地重游，克萊爾和歐文的心里沒有多少激動(dòng)，更多的是緊張。前來(lái)迎接他們的是綽號(hào)“白人獵手”的肯·惠利特，他帶領(lǐng)著百來(lái)號(hào)人的遠(yuǎn)征隊(duì)，已在島上工作了幾個(gè)月，進(jìn)展并不理想。眾人分乘幾輛裝甲車進(jìn)入園地，遠(yuǎn)處的火山冒出滾滾濃煙，發(fā)出隆隆巨響。當(dāng)車隊(duì)抵達(dá)破敗的接待中心時(shí)，一只巨大的腕龍正在啃食著樹頂?shù)闹θ~。同樣是第一次見到恐龍的琪雅和富蘭克林態(tài)度迥異，琪雅迫不及待的沖出裝甲車，親眼看看這個(gè)大家伙。富蘭克林則躲在眾人身后，連大氣都不敢喘。
尋找小藍(lán)到達(dá)了本次行程的目的地控制中心，富蘭克林接通門禁系統(tǒng)，打開通往地下室的大門。大地在微微顫動(dòng)，必須加快速度。一行人進(jìn)入地下控制室，富蘭克林重啟系統(tǒng)，克萊爾登入后，大屏幕上立刻顯示出每只恐龍所在的方位。除了一部分被抓的恐龍集中在東碼頭，更多的散發(fā)在小島的各個(gè)地方。歐文最關(guān)心的還是小藍(lán)，通過定位得知小藍(lán)就在火山口附近。琪雅可不想錯(cuò)過一探恐龍世界的機(jī)會(huì)，執(zhí)意前往。見說(shuō)服不了琪雅，肯只得指揮手下保護(hù)歐文和琪雅進(jìn)入森林地區(qū)。已完成任務(wù)的克萊爾和富蘭克林留在控制室，監(jiān)視小藍(lán)的動(dòng)向。距離小藍(lán)還有一英里，歐文便離開車隊(duì)徒步前進(jìn)，留下其他人等待消息。找到小藍(lán)的剛開始，小藍(lán)似乎已經(jīng)忘記了歐文，對(duì)他投過來(lái)的培根完全沒有興趣。慢慢的，小藍(lán)從進(jìn)攻狀態(tài)中平靜下來(lái)。還沒等歐文采取進(jìn)一步行動(dòng)，本應(yīng)等待信號(hào)的肯卻率領(lǐng)著小隊(duì)包抄而來(lái)，發(fā)射了兩枚麻醉彈。小藍(lán)兇性大發(fā)，撕咬起武裝人員。慌亂中有人開槍，小藍(lán)哀嚎一聲轟然倒地。這顯然不是歐文的計(jì)劃，當(dāng)歐文憤怒的沖向肯時(shí)，被麻醉彈擊中，搖搖晃晃倒在了地上。琪雅急忙撲上去，拔下麻醉彈，怒斥肯的行為。
歐文兇像畢露，他只要能抓到小藍(lán)就行，其他人的傷亡不在他的考慮范圍內(nèi)。琪雅也在滅口之列，但小藍(lán)在麻藥的作用下昏迷不醒，傷口又在不停流血，肯需要她保證小藍(lán)平安無(wú)事。于是，肯命人將小藍(lán)裝上車，帶著琪雅向東碼頭駛?cè)ィ瑏G下沒有知覺的歐文躺在火山腳下的泥水里。火山開始噴發(fā)，大地劇烈震動(dòng)，控制室的水泥墻出現(xiàn)開裂，進(jìn)出通道的大門自動(dòng)關(guān)閉。富蘭克林想方設(shè)法重設(shè)門禁，打開大門，可屏幕上卻顯示有只恐龍進(jìn)入了通道內(nèi)。是只重爪龍，那對(duì)捕食魚類的長(zhǎng)爪足以抓斷人的筋骨。哪知禍不單行，墻壁裂縫延伸到了頭頂，巖漿從縫隙中流入控制室，就像一道燃燒的水簾。還好這道水簾擋在了二人與重爪龍之間，克萊爾急中生智，爬進(jìn)豎井打開緊急出口閥門。逃過了重爪龍的利爪，克萊爾和富蘭克林隨即要面對(duì)更大的麻煩，巖漿如火海般從火山口涌出，噴發(fā)出萬(wàn)噸的火山灰遮天蔽日，還有燃燒的巖石從天而降。遠(yuǎn)處山坡上傳來(lái)歐文的呼喊聲，原來(lái)就在剛才眼看著巖漿流到他面前，求生的強(qiáng)烈欲望讓他支撐著麻木的身體狂奔回來(lái)。如果不是琪雅拔出了麻醉彈，只怕他已在昏睡中被燒成灰燼。歐文的身后就是鋪天蓋地的火山灰，還有同樣在逃命的恐龍。不用歐文出聲，克萊爾和富蘭克林拔腿就跑，向著山坡下奔去。此時(shí)再兇猛的恐龍也懼怕大自然爆發(fā)出來(lái)的威力，顧不上眼前的三個(gè)人，只顧著向前奔跑，不要被火山灰吞噬。逃離海島一只被遺棄的陀螺球就在前面，這種被設(shè)計(jì)成球體的雙人觀賞車用來(lái)躲避火山灰再好不過。克萊爾和富蘭克林一頭鉆進(jìn)去，歐文剛想擠進(jìn)去占個(gè)地方，就透過陀螺球的玻璃罩看到一只食肉牛龍沖了過來(lái)。對(duì)肉的貪婪居然讓它無(wú)視即將到來(lái)的危險(xiǎn)，盯著歐文不放。很快，另一只體型更大的三角龍引開了食肉牛龍的注意。兩只恐龍相互攻擊，將陀螺球彈到了一邊。歐文再想進(jìn)去，這才發(fā)現(xiàn)陀螺球的艙門已自動(dòng)關(guān)閉。一只霸王龍終結(jié)了食肉牛龍和三角龍的搏殺，可霸王龍對(duì)戰(zhàn)利品沒有興趣，丟下兩具尸體向山下奔去。火山徹底噴發(fā)，火球似雨點(diǎn)砸下。陀螺球在前面行駛，歐文緊跟其后。各種恐龍從他們身邊狂奔而過，無(wú)睱顧及其他。時(shí)不時(shí)有恐龍被從天而降的火球砸中，讓克萊爾不由得加快了速度。等看到前方懸崖，已來(lái)不及停下，筆直墜入海中。剛才還能提供保護(hù)的陀螺球，現(xiàn)在卻成了棺材。水很快就從縫隙中滲了進(jìn)來(lái)，克萊爾和富蘭克林拼命拍打玻璃罩卻無(wú)濟(jì)于事，陀螺球慢慢覺入漆黑的海底。跟著跳下懸崖的歐文看到了被困的克萊爾。他游向陀螺球，掏出手槍連開兩槍。可玻璃沒有碎裂，反而多出兩個(gè)漏水點(diǎn)，加速下沉速度。眼見著海水注滿了整個(gè)陀螺球，歐文靈機(jī)一動(dòng)。他游回海面換了口氣，然后潛入水中，從后腰刀鞘中拔出軍刀插入陀螺球艙門密封條中。內(nèi)外壓力一致，沒費(fèi)多大功夫就撬開了艙門。克萊爾和富蘭克林急急忙忙游出海面，深深呼吸了一口混著火山灰的空氣，發(fā)青的臉總算有了些血色。三個(gè)人筋疲力盡的躺在海岸上，好一會(huì)才恢復(fù)點(diǎn)精神。克萊爾此時(shí)才知道，挽救恐龍根本是個(gè)騙局，米爾斯的目標(biāo)就是小藍(lán)。但富蘭克林的平板電腦已浸了水，再想追蹤小藍(lán)和琪雅已不可能。這時(shí)，一架奇努克直升機(jī)沖破滿天火山灰飛向遠(yuǎn)處碼頭上的大型渡船，直升機(jī)下的鐵籠里還關(guān)著一只發(fā)出怒吼的霸王龍。更多的直升機(jī)從天空掠過，一定是肯的遠(yuǎn)征隊(duì)準(zhǔn)備撤離。三人立刻起身，向碼頭方向跑去。肯在碼頭上指揮著遠(yuǎn)征隊(duì)將抓到的恐龍運(yùn)上渡船，在火山灰到達(dá)前，盡快離開碼頭。歐文、克萊爾和富蘭克林躲在碼頭外，遠(yuǎn)遠(yuǎn)看到渡船里一排排擺放著結(jié)實(shí)的牢籠，關(guān)著不同的恐龍。牢籠不夠，連貨車都成了臨時(shí)監(jiān)獄。既然肯早就捕捉了那么多恐龍，卻還要?dú)W文提供支援，更讓歐文確信這是場(chǎng)騙局，肯或者說(shuō)是米爾斯為得到小藍(lán)不擇手段。可他們的目的是什么，歐文和克萊爾就猜不出來(lái)了。遠(yuǎn)遠(yuǎn)看到肯硬生生從一只劍龍嘴里拔下一顆牙齒，讓克萊爾著實(shí)心痛。再觀察了一會(huì)，就看到仍處于昏迷之中的小藍(lán)和嘴里不停怒罵著的琪雅被押上了船。火山灰和熔巖越來(lái)越近，遠(yuǎn)征隊(duì)丟下輜重，急忙上船。趁著混亂，三人跑出藏身處跳上一輛卡車向碼頭疾駛。渡船正在駛離碼頭，開車的克萊爾不及細(xì)想，緊踩油門沖進(jìn)了渡船的卸貨艙。
驚魂未定的遠(yuǎn)征軍沒人發(fā)現(xiàn)這輛最后上船的卡車，他們都注視著遠(yuǎn)處如同煉獄的海島。那些無(wú)處可去的恐龍?jiān)诖a頭上、海岸邊悲鳴，似乎知道即將到來(lái)的命運(yùn)。它們的聲音在濃霧般的火山灰中越來(lái)越輕，高大的身影消失在了陣陣火光之中。
米爾斯的計(jì)劃
運(yùn)載著恐龍的渡船安全離開了納布拉爾島，讓米爾斯長(zhǎng)舒了一口氣。他處心積慮要得到小藍(lán)，是有他不可告人的目的。米爾斯從大學(xué)畢業(yè)后就管理著洛克伍德家族的基金，三年前那場(chǎng)禍?zhǔn)伦尰饡?huì)不得不支付巨額賠償以平息受害民眾的集體訴訟。為了挽回?fù)p失，他絞盡腦汁。在看到暴虐霸王龍的威力和歐文訓(xùn)練小藍(lán)的視頻后，他有了靈感......