大結局：夜曇舍生救四界雙生花重生
有琴進入歸墟中，即使他有十重金身，面對這傾巢而出的混沌之力，應付得也十分勉強，他甚至被歸墟逼得都不能接近夜曇。后來夜曇跌進了雙花記憶中，得知地脈紫芝并不是滅世之花，正相反，地脈紫芝是上古上神賜下給東丘，用來澄清歸墟的。地脈紫芝以混沌為壤，這才生出了雙花花靈。青葵的花靈為夜曇點亮了上神神諭，她這才知道滅世之花的最終使命。與此同時，少典有琴也將她從歸墟深處中救出，看到他為了自己拼盡全力的樣子，夜曇最終決定將他推開，與眾人說了最后的告別之言。
夜曇與青葵的花靈合二為一，吸食混沌之力，四界重歸平安。和夜曇告別的少典有琴，哭得像個孩子。暾帝得知夜曇為了對她從來就不公的四界眾生，犧牲了自己，他為夜曇的大義之舉而感到驕傲。嘲風在古籍上尋找復活雙生花的方法，雪妃問嘲風要不要去天界看看少典有琴，嘲風認為讓少典有琴自己靜靜便好。烏玳過來看嘲風，兄弟倆化解矛盾，嘲風幫助烏玳登上厲王之位。霓虹從霞族回來看玄商，他雖在歸墟中受傷，但有三位仙師幫他療傷，外傷愈合，可失去心愛之人的心傷卻難以愈合。
少典宵衣得知夜曇的救世之舉，回想當初自己的所作所為，實在自愧不如，他提議讓清衡繼任天帝之位，少典有琴和其他人均無異議。少典宵衣有一個辦法，那就是重建東丘故地，讓草木一族下東丘播撒草木，或許能感召地脈紫芝重生。少典有琴立即吩咐飛池和翰墨留在天界好好輔助清衡，他則和紫蕪去東丘。嘲風十分興奮地將這個好消息告知谷海潮，他要去東丘定居，懷著耐心與期待等待青葵和夜曇的重生。在四界的合力之下，東丘快速重建，恢復往日花團錦簇的盛況，眾人期待雙花復生的那一天。
一年后，雙花的故事在四界流傳甚廣，民眾都知當年是錯怪了雙花花靈。紫蕪嫁給了帝嵐絕，懷有身孕數月有余。烏玳為厲王，而迦樓羅成為了厲王后，陪伴在烏玳身邊，素水和谷海潮終成眷屬。東丘被仙尊照顧得井井有條，宛如四界的后花園，閑暇時，暾帝和獸王獸后都會來此跟三位仙師一起玩。一年多來，嘲風和少典有琴等待著雙花重生，兩人在一起久了，有一種相看兩相厭的感覺，整日斗嘴，給仙尊他們帶來不少的歡樂。在眾人的見證下，雙花重生，各自飛到了少典有琴和嘲風的手上。
雙花雖重生了，但花蕊仍舊緊閉，仙師說這雙花需要至純的清濁之物澆灌，而嘲風和少典有琴的心頭血就是至清之物，嘲風的心頭血就是至濁之物。兩人立即施以各自的心頭血給雙花花靈，雙生花結合，歸于地脈紫芝上，從此以后自發汲取清氣和濁氣，等待重生那天。