賽昂人不斷追擊卡拉狄加艦隊,艦隊不得不每33分鐘進行一次超光速跳躍以逃避賽昂人的追擊,全船成員連續工作幾百小時。而艦隊在不斷遭受襲擊之后,艦隊幸存的人類銳減至不到五萬。但某次跳躍33分鐘之后,賽昂人的追擊沒有出現,反而之前在追擊中失蹤的奧林匹亞航母出現了,可最終卡拉狄加發現這是一艘載有核彈的民用船,并且正徑直沖向卡拉狄加……與此同時,流落卡布里卡的西洛卻被之前已經離開的布瑪爾所救……
布瑪爾在自己的背包中發現了一枚G4炸彈,但在她檢查了輕武器庫之后發現,丟失的G4炸彈不止這一枚。羅斯琳總統前往卡拉狄加視察,了解資源貯備情況。然而此時,卡拉狄加的水罐卻發生爆裂,艦隊失去了百分之六十的水量,卡拉狄加開始尋找水源。卡拉狄加被懷疑有賽昂人潛伏,波爾塔博士受命制作賽昂人識別器。布瑪爾成功找到了水源,但卻在自己的猛禽座駕上發現了一枚G4炸彈。阿波羅在上次擊毀奧林匹亞航母之后,對當初的行動產生了質疑,羅斯琳總統邀請他成為她的私人軍隊顧問。卡布里卡上,西洛正與莎倫逃亡,而西洛卻對這個莎倫的身份渾然不覺……
艦隊找到了水源,但取得水的工程卻需要大量人力。卡拉狄加決定從運送罪犯的船上尋找志愿者,李·阿達瑪率隊登上“星際女皇”號。但當李說出條件之后,一片沉默,最終只有一個人站了出來,并且代表罪犯拒絕了李。他就是湯姆·查萊克,政府認定的“恐怖分子”。李找查萊克談話,這時船上的犯人卻發動了起義,罪犯控制了飛船,查萊克作為領袖要求羅斯琳下臺并重選總統。阿達瑪指揮官下令出擊,同時李道破了查萊克心中真正的目的……此時的卡布里卡,西洛和賽昂人莎倫依然在逃亡,但莎倫已經開始和其他賽昂人開始計劃之后與西洛有關的行動……