賽昂人不斷追擊卡拉狄加艦隊(duì)，艦隊(duì)不得不每33分鐘進(jìn)行一次超光速跳躍以逃避賽昂人的追擊，全船成員連續(xù)工作幾百小時(shí)。而艦隊(duì)在不斷遭受襲擊之后，艦隊(duì)幸存的人類銳減至不到五萬。但某次跳躍33分鐘之后，賽昂人的追擊沒有出現(xiàn)，反而之前在追擊中失蹤的奧林匹亞航母出現(xiàn)了，可最終卡拉狄加發(fā)現(xiàn)這是一艘載有核彈的民用船，并且正徑直沖向卡拉狄加……與此同時(shí)，流落卡布里卡的西洛卻被之前已經(jīng)離開的布瑪爾所救……
布瑪爾在自己的背包中發(fā)現(xiàn)了一枚G4炸彈，但在她檢查了輕武器庫之后發(fā)現(xiàn)，丟失的G4炸彈不止這一枚。羅斯琳總統(tǒng)前往卡拉狄加視察，了解資源貯備情況。然而此時(shí)，卡拉狄加的水罐卻發(fā)生爆裂，艦隊(duì)失去了百分之六十的水量，卡拉狄加開始尋找水源。卡拉狄加被懷疑有賽昂人潛伏，波爾塔博士受命制作賽昂人識(shí)別器。布瑪爾成功找到了水源，但卻在自己的猛禽座駕上發(fā)現(xiàn)了一枚G4炸彈。阿波羅在上次擊毀奧林匹亞航母之后，對(duì)當(dāng)初的行動(dòng)產(chǎn)生了質(zhì)疑，羅斯琳總統(tǒng)邀請他成為她的私人軍隊(duì)顧問。卡布里卡上，西洛正與莎倫逃亡，而西洛卻對(duì)這個(gè)莎倫的身份渾然不覺……
艦隊(duì)找到了水源，但取得水的工程卻需要大量人力。卡拉狄加決定從運(yùn)送罪犯的船上尋找志愿者，李·阿達(dá)瑪率隊(duì)登上“星際女皇”號(hào)。但當(dāng)李說出條件之后，一片沉默，最終只有一個(gè)人站了出來，并且代表罪犯拒絕了李。他就是湯姆·查萊克，政府認(rèn)定的“恐怖分子”。李找查萊克談話，這時(shí)船上的犯人卻發(fā)動(dòng)了起義，罪犯控制了飛船，查萊克作為領(lǐng)袖要求羅斯琳下臺(tái)并重選總統(tǒng)。阿達(dá)瑪指揮官下令出擊，同時(shí)李道破了查萊克心中真正的目的……此時(shí)的卡布里卡，西洛和賽昂人莎倫依然在逃亡，但莎倫已經(jīng)開始和其他賽昂人開始計(jì)劃之后與西洛有關(guān)的行動(dòng)……