連續兩屆總大理大臣上任半年就下臺，民政黨支持率落入歷史最低點，陷入戰后第三次政權交替危機。在這樣的危機時刻，總裁候選人武藤泰山借助黨內元老城山和彥的力量，終于登上總理寶座。在赤坂高級俱樂部，泰山和多年盟友狩屋孝司、公派第一秘書貝原茂平舉杯慶祝，貝原叮囑泰山千萬別被兒子翔的事拖了后腿。
武藤翔對于地位、權力沒有興趣，討厭不顧家庭的泰山，自從上了大學后就不再回家，而是借住在開在魚龍混雜之地的餐館暗云屋廚房。泰山前往探視，卻看到翔和半裸的女人手拉手。翔對于父親成為總理一事無動于衷，泰山叮囑他別惹事后離開。第二天早上，泰山就接到了產經大臣江見失言的報告。
城山要讓江見辭職，泰山很為難,時他本來就疼的臼齒越發疼起來。另一方面，翔在暗云廚房與兩個黑道對峙。原來，店主暗云渡借了錢卻不能償還。正在這時，翔暗戀的前輩南真衣與后輩村野繪理香來到店里，翔本想打發走追債人，卻意外被平底鍋砸到，感到一陣劇痛。清醒過來的翔發現自己站在預算委員會大廳正中間，環顧周圍全是表情嚴肅的大叔。
翔不明所以，而在周圍的人眼中，他就是總理泰山。感到事有蹊蹺的委員長宣布休息。翔趁此機會向總理私邸跑去。這時，本應在預算委員會的泰山卻在暗云廚房醒了過來，被真衣、繪理香等陌生人圍在當中。思考回路完全停止工作的泰山慌忙跑到鏡子前，鏡中映出的卻是兒子的面容。
泰山大驚失色，沖向私邸，卻遇到了以自己的身體出現的翔。原來兩人發生的靈魂互換。泰山和翔成功地讓狩屋和貝原相信了此事，但是，為什么會互換、該不該去醫院、要不要讓國防大臣了解這件國家頭等大事，面對這一連串問題，不知如何才能恢復原狀的泰山父子首先為應付明天的局面開始練習。
第二天，貝原陪泰山到暗云廚房，幫暗云解決財務問題。與此同時，在辦公室與精神崩潰的江見大臣談過話后，翔面對記者做了出人意料的發言。而在銀行面試上，泰山侃侃而談，把面試官和銀行高層教訓了一番后揚長而去。
靈魂互換后,沒正經好好學習過的翔剛一履行總理大臣的職務,就因為連連念字而招致議員們的嘲笑，藏本和政治評論家小中壽太郎在電視節目中大肆抨擊武藤總理，民間則管武藤總理叫“無能總理”。
武藤內閣才成立18天便面臨解散的危機。就在武藤陣營陷入背水一戰的境地時，烏茲拉斯克斯坦總統加德納造訪日本。為了談成某金屬的進口合同以扭轉敗局，武藤內閣要以VIP的規格招待加德納。雖然很厭惡這種政治把戲，翔仍不得不加緊學習外交技巧，以便與加德納談判。
但是，雙方剛一見面，翔把“How?are?you”錯說成了“Who?are?you”，造成重大外交失誤，國民支持率急劇下降。飽受泰山等人指責的翔越發討厭當總理了，干脆躲進房間不出來。
為了提高翔的士氣，茂平提出讓南真衣來當實習秘書。果然，翔中了茂平的巧計，只好心不甘情不愿地參與“招待烏茲拉斯克斯坦總統”的計劃，泰山也以隨員的身份合程陪同。
在偶像演唱會、相撲道場，翔三番兩次出錯，令加德納對他的印象越來越差。然而談判之前，在壽司店，翔所拿的有卡通人物“蓬蓬菌”圖案的手帕勾起了加德納對童年往事的回憶，形勢出現逆轉。
就在泰山、茂平、狩屋慶祝金屬進口合同順利達成時，警視總監小峰義郎派來的新田報告了一個重要情報，令眾人大吃一驚。
公安部門傳來情報，有人利用世界最尖端的科學技術武器制造了泰山和翔的“靈魂”互換事件。防衛省的技術本部檢查的結果是，二人體內被植入了能操控腦電波的芯片。而泰山和翔一周前曾在同一間牙科診所拔過智齒。很快對丸山田齒科的情況調查表明，這間診所已經關門，丸山田院長家也是人去樓空。
同時，丸山田償還了巨額賭債，令人不禁懷疑有某個大組織在幕后操縱此事。而由于一旦強行拔取芯片可能引起爆炸，所以泰山和翔只能暫時維持現狀。這時，泰山(靈魂是翔)收到參加某人氣辯論節目的邀請。一聽說辯論的對手就是憲民黨的藏本志郎，泰山立刻懷疑一系列怪異事件的幕后黑手就是藏本。
他推測藏本是要趁武藤父子靈魂互換之機在公開節目上駁倒泰山，從而達到奪取政權的目的。泰山團隊決定假裝中了藏本的圈套，然后出其不意一舉打敗藏本，并請南真衣協助為總理設計新選型。
在節目現場，戴著耳機由秘書和父親場外遙控的翔精疲力盡，一直相信泰山是天生的政治家的狩屋孝司鼓勵他堅持下去。接下來的直播中，在場遙控的泰山失言，令翔陷入困境。摘掉耳機的翔利用自己熟悉底層青年生活現狀的優勢，讓藏本啞口無言，獲得了觀眾的支持。
另一方面，翔(靈魂是泰山)為了取得學分來到大學。在那里，他遇到了村野繪理香，對方邀請他參加當晚舉行的生日派對。被繪理香的美貌迷住的翔(靈魂是泰山)高高興興地跑去赴約。
他與繪理香的追求者發生沖突，新田理現身替他解圍。新田理報告，藏本的秘書真鍋曾在聚會上出現。正當翔(靈魂是泰山)欲與繪理香親熱時，對方一語道破了泰山父子“靈魂”互換的秘密。