平安夜，在極寒之地的俄羅斯，一筆病毒交易成交了……
女子瑪雅從走私團伙的一名男子處，得到了殺人病毒。她此舉的目的是想，在日本制造一場病毒恐怖事件。
該計劃的代號為“BOOLDY?MONDAY”。隨后，瑪雅來到日本，并槍殺了一路追蹤自己的俄羅斯諜報人員，而后隱匿行蹤。
負責該事件的警察廳秘密部隊“third-i”為了破解諜報人員所留下的暗號，請求就讀于彌代學院高中部的高木藤丸（三浦春馬），侵入俄羅斯的軍用電腦。從外形上看，藤丸不過就是一個普普通通的高中生而已。但實際上，他竟是人稱“Falcon”的天才黑客。他曾運用自己高超的黑客技術揭發了多起非法行為。經過一番苦戰，藤丸終于將一個文件夾下載成功。這個神秘的文件夾中究竟隱藏著怎樣不為人知的事實……正當此時，一女子折原瑪雅（吉瀨美智子）又以彌代學院教師的身份出現。
購物步行街發生的一連串事件，不過是恐怖分子集團制造的煙霧彈。藤丸與“third-i”竭力避免犧牲者的出現，他們都意識到，此次事件只不過是悲劇前的一場序曲。
一心記掛著妹妹遙（川島海荷）的藤丸趕到醫院，卻被眼前的情景所驚呆。整個病房中，不見遙的身影，而她的主治醫生，京子（宮澤美保）已昏迷。正在藤丸心緒不寧之時，電話突然響起。打來電話的正是捉走遙的男人。他威脅道，“要想救你妹妹，就去侵入third-i的系統。”藤丸終于趕到遙的所在之地，然而這里卻被安放了定時炸彈。爆炸時間漸漸逼近，藤丸最終做何選擇……
另一方面，third-i本部得到消息，稱“一名女性送來了真的病毒”。終于，病毒的魔手偷偷的伸向了普通市民。恐怖分子集團接連不斷的設下陷阱。藤丸就讀的學校的生物老師，折原瑪雅也露出自己的本性來。
藤丸和音彌（佐藤健）懷疑在俄羅斯發生的"圣誕節的虐殺"的影像中出現的女人是生物老師折原。兩人為確認真偽，便潛入了折原老師的公寓。面對發現了自己的真實身份的藤丸，折原終于暴露出來本來面目，在藤丸快被殺之際，被?THIRD-i?'成功救出。捕獲折原，開始對其盤問關于恐怖組織的所在地。對嚴刑拷問完全不屈服的折原卻說出了如果以藤丸同行作為條件的話就愿意帶他們去恐怖組織的秘密基地。
藤丸決定和加納(松重豐收)、寶生(片瀨那奈)、折原一起乘車，在這輛車中，發生了沖突。折原泄露了在「THIRD-i」中有恐怖組織的間諜。事到如今，不知信誰才好，車內被不安的氣氛籠罩，究竟誰是背叛的人？?把藤丸帶出去的折原等人的目的是什么??與此同時，一個神秘的男人正在向藤丸等人靠近……