李一嬋出院，林潔玉親自送她到車站，此時(shí)何玉山也帶著項(xiàng)懷瑾趕到車站，兩人都非常吃驚，竟然能在馬蘭看到彼此，但是，多年的默契迅速讓兩人明白各自所承擔(dān)的任務(wù)，闊別多年的夫妻倆緊緊擁抱在一起。
援朝找到建國(guó)，告訴他自己的爸爸，汽車團(tuán)的司機(jī)小馬在大河沿?zé)o人區(qū)找到了他弟弟建軍的鞋子，上面還壓著塊石頭。與此同時(shí)，小馬也將這個(gè)消息告訴了何玉山。他們分析，這一定是人為所謂，不然的話石頭不可能恰巧壓在鞋子上。正當(dāng)他們分析著建軍的下落，建國(guó)跑了進(jìn)來(lái)，拽著爸爸讓他立刻去找弟弟。何玉山把建國(guó)拽到外面，教訓(xùn)了他兩句，但還是答應(yīng)他有時(shí)間一定去找建軍。
何玉山向司令員請(qǐng)了幾天的假，小馬開車?yán)麃?lái)到大河沿，想尋找建軍的蛛絲馬跡，但何玉山認(rèn)為，即使建軍真的被周邊的牧民救下了，牧民放牧居無(wú)定所，也很難發(fā)現(xiàn)他們的蹤跡，兩個(gè)人只能抱著試試看的心理，分頭尋找線索。小馬在搜尋中發(fā)現(xiàn)了羊糞，確定這之前有人來(lái)這里放牧，但兩個(gè)人直到天黑前也沒發(fā)現(xiàn)一個(gè)人影，接下去的兩天也是這個(gè)結(jié)果，何玉山只能返回，臨行前，他把建軍曾經(jīng)玩過(guò)的撥浪鼓壓在了石頭下面，希望救下建軍的牧民會(huì)發(fā)現(xiàn)帶給他們新的消息。
林儒丫來(lái)到基地一年多，一直都沒懷孕，她找到林玉潔，詢問自己如何才能要一個(gè)孩子，林玉潔建議她和徐遠(yuǎn)征抽空來(lái)醫(yī)院檢查。回去后，林儒丫讓徐遠(yuǎn)征去醫(yī)院檢查，但徐遠(yuǎn)征覺得自己根本不可能有任何問題，覺得受到了侮辱，大半夜跑出了家門在營(yíng)地里生悶氣。
小歡的爸爸李指導(dǎo)員找到林儒丫，說(shuō)自己的老婆因?yàn)椴荒軄?lái)新疆而要改嫁，讓同時(shí)女人的林儒丫出出主意，男兒有淚不輕彈，看著自己的兒子，李指導(dǎo)員不禁流了眼淚。恰巧徐遠(yuǎn)征回到家，看到老李掉眼淚，竟然笑話起他來(lái)，老李很尷尬，帶著小歡逃出了徐遠(yuǎn)征的家。林儒丫對(duì)徐遠(yuǎn)征有氣，就故意氣他說(shuō)如果不是因?yàn)樗?dāng)初的那封信，自己也很可能改嫁了，聽到這句話，徐遠(yuǎn)征震驚不已。
自從妻子說(shuō)當(dāng)初險(xiǎn)改嫁的事兒，徐遠(yuǎn)征開始疑神疑鬼，他找到林玉潔問起林儒丫不懷孕的原因，是否和其他男人有關(guān)，當(dāng)即被林玉潔轟出了醫(yī)院，氣不過(guò)的他又給岳母寫信，但就是這封信里，徐遠(yuǎn)征不小心將國(guó)家秘密研制原子彈的事透露了出去。保密部門沒有將這封信發(fā)出去，徐遠(yuǎn)征也因?yàn)樯嫦有孤秶?guó)家機(jī)密被停止，張司令找到徐遠(yuǎn)征，告訴他很可能面臨著被攆出羅布泊的處罰，自己也無(wú)能為力。何玉山找司令員求情，請(qǐng)求司令員讓徐遠(yuǎn)征戴罪立功。
張司令對(duì)何玉山說(shuō)這件事情他們兩個(gè)表態(tài)是沒有用的，但話里話外還是想對(duì)徐遠(yuǎn)征網(wǎng)開一面。徐遠(yuǎn)征知道老何為他求情，半夜到他的門口喊老何，說(shuō)自己欠了他一個(gè)人情，將來(lái)如果老何有需要，可以隨時(shí)叫他還人情。睡眼惺忪的何玉山起床出門來(lái)見徐遠(yuǎn)征，但這時(shí)徐遠(yuǎn)征已經(jīng)離開了。
調(diào)查組讓徐遠(yuǎn)征將事情的來(lái)龍去脈再說(shuō)一遍，徐遠(yuǎn)征承認(rèn)是自己太委屈，因?yàn)榻o岳母寫了那封信，讓岳母知道自己干的事業(yè)有多么重要。何玉山又找到張司令打聽對(duì)徐遠(yuǎn)征的處理意見，張司令傳達(dá)了基地黨委對(duì)徐遠(yuǎn)征的處理決定，記大過(guò)一次，但保留他的院長(zhǎng)職務(wù)，繼續(xù)留在基地工作。徐遠(yuǎn)征又投入了到工兵團(tuán)忙碌的工作當(dāng)中，他讓警衛(wèi)員再次給何玉山帶話，人情他一定還上。
麗薩被接到了馬蘭，見到了一年多沒見的建國(guó)，還有許多新的小伙伴。建國(guó)帶麗薩看了戈壁灘上很多新奇的東西，還和林玉潔見了面。麗薩問起為什么不見建軍，建國(guó)告訴麗薩，建軍被大風(fēng)刮丟了，但他相信，建軍終有一天會(huì)回來(lái)，只是需要很長(zhǎng)時(shí)間罷了。
戈壁灘的環(huán)境惡劣，馬蘭小學(xué)的環(huán)境也很簡(jiǎn)陋，麗薩很快失去了對(duì)戈壁灘的新鮮感，到處都讓從小嬌慣的她不適應(yīng)。教室天花板炙熱的陽(yáng)光，飲用水里的小蟲子，又臟又丑的廁所，都讓麗薩抓狂。但幸好有小伙伴們陪著她，幾個(gè)月后，麗薩漸漸適應(yīng)了基地的生活。學(xué)校放假，爸爸交給他一項(xiàng)任務(wù)，那就是用電燈泡的溫度，模擬母雞孵小雞時(shí)的溫度，用科學(xué)的方法讓雞蛋孵出小雞來(lái)。二十多天后，小雞果真破殼而出，麗薩把同學(xué)們都召到了家，一起觀看自己孵出來(lái)的小雞。
工兵團(tuán)的戰(zhàn)士們集體患病拉肚子，徐遠(yuǎn)征也不例外，因此工兵團(tuán)的任務(wù)耽擱了，這也讓科研所里的項(xiàng)懷瑾夫婦有了難得的假期，可以回家陪麗薩。何玉山眼睛看不清，來(lái)找林潔玉看病，林潔玉說(shuō)他這是患上了夜盲癥，原因就是營(yíng)養(yǎng)不良。
張司令來(lái)到醫(yī)院，詢問工兵團(tuán)大大范圍腹瀉的原因，林潔玉認(rèn)為戰(zhàn)士們是因?yàn)楹攘烁浇缓V元素的孔雀河河水才發(fā)生的腹瀉，基地的止瀉藥根本不夠用，只能用土辦法——吃大蒜。張司令把采購(gòu)大蒜的任務(wù)交給何玉山，何玉山連夜帶著戰(zhàn)士們乘車去外面找大蒜。
何玉山去了很多地方，都沒有找到大蒜，只能去找當(dāng)?shù)伛v軍想辦法。到了駐軍某師部，何玉山一眼就認(rèn)出這個(gè)師的師長(zhǎng)是當(dāng)年的老戰(zhàn)友老吳。何玉山請(qǐng)求老戰(zhàn)友幫忙給兩車大蒜，但卻又不能說(shuō)大蒜要運(yùn)往哪里，這讓吳師長(zhǎng)犯了難，大蒜屬于軍用物資，如果上級(jí)問起來(lái)大蒜給了哪里，他所說(shuō)不出來(lái)，是要擔(dān)責(zé)任的。但何玉山卻告訴他，他現(xiàn)在所做的事雖然是最高機(jī)密，但確是為了老百姓過(guò)上和平的生活，吳師長(zhǎng)終于答應(yīng)將兩車大蒜交給何玉山。
隨著基地出具規(guī)模，基地的各項(xiàng)條件也有所改善。為了治療戰(zhàn)士們長(zhǎng)期缺乏蔬菜造成的營(yíng)養(yǎng)不良和夜盲癥，上級(jí)調(diào)配了大量維生素藥品。而基地自身也養(yǎng)了幾頭奶牛，專門供應(yīng)給長(zhǎng)身體的孩子們補(bǔ)充營(yíng)養(yǎng)。負(fù)責(zé)分配牛奶的是一位叫做李珊珊的未婚姑娘，但大家都習(xí)慣叫她“李奶奶”。
李奶奶偶然結(jié)識(shí)了基地電影放映隊(duì)的李開炮，兩個(gè)人經(jīng)過(guò)撮合最終結(jié)了伴侶，這也是基地成立以來(lái)的成就的第一對(duì)新人。基地的同事們?yōu)槎伺e辦了樸素但隆重的婚禮，由張司令員親自主持，就連總部首長(zhǎng)都給兩位新人發(fā)來(lái)了賀電。
軍隊(duì)?wèi)?zhàn)士們好多從參加完抗美援朝就直接來(lái)到馬蘭，多年未回家，很多人吵著求情、請(qǐng)假，因此張司令頒布了命令，不準(zhǔn)再有人向他求假。但和玉城還是為自己的警衛(wèi)員楊振祿請(qǐng)假，楊振祿的兩個(gè)哥哥都在戰(zhàn)場(chǎng)上犧牲了，可謂一門忠烈。張司令破例準(zhǔn)了他一個(gè)月的假，但當(dāng)何玉山把買好的火車票交給他時(shí)，他卻將火車票死得粉碎，他說(shuō)他不能搞特殊，只有所有戰(zhàn)士都能回家了，他才能回家，這讓何玉山非常生氣，但張司令聽了卻非常感動(dòng)，讓何玉山對(duì)楊振祿通報(bào)嘉獎(jiǎng)。
基地醫(yī)院護(hù)士急缺，張司令讓何玉山去回去召幾個(gè)女兵來(lái)，經(jīng)過(guò)醫(yī)護(hù)培訓(xùn)，充實(shí)到基地醫(yī)院當(dāng)護(hù)士。何玉山來(lái)到了天津某軍隊(duì)醫(yī)院，一進(jìn)醫(yī)院的門就看到墻上掛著一位叫曾倩倩的女護(hù)士多次受到嘉獎(jiǎng)，能力十分突出，便和醫(yī)院政委點(diǎn)名要曾倩倩。曾倩倩很早就勵(lì)志想去戰(zhàn)場(chǎng)救死扶傷，因此是非愿意去馬蘭。何玉山帶著曾倩倩和其他幾位同期招收的女兵回到馬蘭，沿途的顛簸讓這些女孩子都暈了車，狂吐不止。
新來(lái)的女護(hù)士們受到了基地的熱烈歡迎。但入夜大家準(zhǔn)備休息的時(shí)候，其中一位女護(hù)士便忍不住埋怨這個(gè)鬼地方條件太苦，連洗漱的水都沒有。其中一位女護(hù)士看不慣她嬌生慣養(yǎng)，責(zé)怪了她幾句。曾倩倩好心將自己僅有的一點(diǎn)水給了那位女兵。