一日，皇上私下帶著宮廷太監總管包公公微服出巡，一行來到竹山縣想借此之行順道見見思念已久的女兒凝香。途中他們遇見打劫貢船的海盜。皇上見此，只身上船幫助官兵抗賊，未料反被押船官朱魁誤傷落入水中。受傷的皇上被俞慧心救起。陰錯陽差之中，皇上反被誤認為水寇首領——混江龍……
因貢船于竹山縣被劫，竹山縣令杭鐵生難辭其咎。密謀奪權的王爺封鎖消息，企圖置皇帝于死地，遂指派太監崔潔押解鐵生進京問罪。途中巧遇凝香，鐵生方知原來凝香未死，且凝香亦表明愿陪同鐵生一同入京……
因鐵生失職之故，朝廷遂指派朱魁接替其職四處捉拿水寇。此時，被誤認為水寇首領的皇上亦被朱魁擒獲。而無意間發現皇上身份的崔公公，為助王爺奪權大計，便暗令不知情的朱魁欲除去皇上。鐵生只得喬裝打入水寇內部，并最終贏得首領混江龍的信任。