最近一連串的事件牽扯出了根的殘黨，佐井在秘密研究所找到了線索。與此同時，早已清楚真正犯人是誰的巳月向博人透漏了消息，但博人卻怎么也不愿相信，因為操縱暗影的竟然是他們的班長堇。在遭到佐井抓捕時堇召喚出了鵺，狂暴的鵺勢必會給村子帶來災難性的打擊，巳月接到的任務是殺掉堇從而停止鵺的活動，面對這種局面博人又會做出怎樣的選擇？
鵺與其他通靈獸的區別在于棲息環境，卡卡西推測鵺已經帶著堇前往異世界，他們無法主動干涉，而唯一可以阻止堇的只有跟過去的博人和巳月。知道了真相的博人依舊將堇看做同班同學，在他的眼里堇還是那個時刻為班里同學著想的班長。堇聽到這些后情緒發生了變化，圍繞在堇身上的黑影漸漸淡去。
幽靈事件解決后博人的神秘力量就再也沒有發動過，但他更擔心的是班長堇的現狀。校舍接近完工，志乃老師讓大家重新組隊進行實戰訓練，這是為了讓同學們多做嘗試，借此找到畢業后能夠一起組隊的同伴，這個時候大家都想起了缺席的堇。堇現在的狀況非常尷尬，要不要回到學校還得看她本人的意愿，為此志乃親自去探望了堇。