五位性格迥異女生住在歡樂頌小區，各自迎來事業、生活乃至感情的新挑戰。從事生命科學研究的葉蓁蓁，名副其實的工作狂，與歡喜冤家戴維從友情升華為愛情，順理成章確定戀愛關系。
天資聰慧的朱喆未被家庭擊垮，現在變得更加堅強豁達。反觀余初暉依舊是直率且疾惡如仇，對葉蓁蓁、朱喆和方芷衡充滿尊重和敬畏，唯獨與何憫鴻是水火不相容，隔三差五爆發爭吵，導致何憫鴻每次委屈痛哭，覺得大家都不喜歡自己。
方芷衡接近李其行的目的越發明顯，也讓李其行發現父親李勛的卑劣人品，毫不猶豫向母親捅破父親的丑事。奈何母親明知丈夫對家庭和婚姻有失忠誠，卻還是選擇隱忍，昧著良心控訴女受害者的過錯，只為保全自身與兒子的利益。李母態度證實葉蓁蓁曾經說過的話，李其行聽著母親的苦苦哀求，心下一片茫然。
一大清早，朱喆已經做好蝦餃邀請室友來吃。何憫鴻慎重考慮過，還是沒有采納朱喆的建議，言辭里處處維護宋礫。盡管朱喆表示沒有關系，可余初暉非常厭煩何憫鴻的軟弱無能，故意拿話激她鼓起勇氣爭取出路，否則永遠是林總監的眼中釘。
其實余初暉這么做的原因，也是希望何憫鴻看清現實，學會反抗精神。朱喆知道余初暉的小心思，透露何憫鴻的公司處于敏感期，目前還不會把她辭退，果然余初暉聽見后稍微感到安心些。
前往公司路上，葉蓁蓁察覺何憫鴻情緒低落，猶豫不定，便建議她應該主動申請辭職。何憫鴻拒絕辭職的原因是咽不下這口氣，但是葉蓁蓁提醒她理性的人會掌握主動權，第一時間會考慮辭職后的物質生活，以及未來前途，而絕非單純的意氣用事。
戴維來電告知李勛已經知道方芷衡的身份，希望她可以早做準備。方芷衡回應自己將相關資料提交給警方，就算李勛發現都無濟于事，這次他肯定會進監獄。財務突然發來消息透露她已落地香港，方芷衡做好獨自戰斗的準備，并且刪除李其行的聯系方式。
因為葉蓁蓁與陶教授共同做出來的實驗結果否定了原先的發病機理，如此一來，也就觸犯到太多人的利益，包括那些循著原先發病機理和藥廠合作的人。同事于淼森都提醒她稍微注意下，以免造成不必要的麻煩，葉蓁蓁找老爹咨詢意見，做好準備迎接會有學術造假或者生活作風的污蔑，堅信清者自清。
戴維作為中間人負責給李其行和方芷衡之間傳話，除此之外不想做出任何評價。一心撲在科研上的葉蓁蓁，無可避免地卷入工作非議和兩個家庭的拉鋸戰，幸好戴維懂得隨機應變，要與葉蓁蓁互相扶持抱團。
余初暉等人辦理完入職手續，繼而來到領導辦公室匯報工作，李總為此很是滿意，承諾只要他們拿出切實可行的方案就會批準經費。隨后余初暉融入進新的工作環境，三人分工合作，相處其樂融融，更決定最近三年都不會再有職場調動。李總看著他們布置好工位，直言夸贊動手能力強，是一支帶出去就能打的隊伍。
何憫鴻焦急地等待會議結束，看著來來往往的同事，始終沒有勇氣起身。林總監又在訓斥下屬，聽得何憫鴻膽戰心驚，豈料竟被喊進辦公室。何憫鴻干脆帶上辭職信來見林總監，再次強調自己不愿接觸宋礫，也是為了公司考慮。林總監指責何憫鴻錯誤的工作方式方法導致宋礫誤解，從而引發宋礫與公司之間發生公關危機災難，本就應該自覺去道歉。
本來何憫鴻還在猶豫是否辭職，畢竟這件事情完全不在她的設想中，如何保障后續生活還是最大問題。可是林總監蔑視的態度，以及刻薄的言語，徹底擊垮何憫鴻的自尊心，毅然決然選擇離開公司。
如今李勛已被警方逮捕，方芷衡所做的努力終于沒有白費，曾經深受其害的女孩們紛紛向她表達感謝。葉蓁蓁得知后迫不及待跟戴維分享這個好消息，篤定方芷衡今天晚上肯定會回家。
正如葉蓁蓁所料，方芷衡下班后回到住處，在電梯間遇見余初暉。因為何憫鴻躲在家里嚎啕大哭，余初暉和朱喆不便于進去打擾，索性坐在門外聊天。方芷衡走出過往的陰影，逐漸被大家的熱情激發心底柔軟的一面，性格變得開朗。
葉蓁蓁和方芷衡聊完天往回走，看見余初暉和朱喆還坐在樓道，邀請她們來家里坐坐。三人討論起何憫鴻辭職的事情，難免有些感慨，余初暉更是對何憫鴻恨鐵不成鋼，滿腦子風花雪月，完全不懂得職場上的鉤心斗角。
第二天早上，葉蓁蓁拉著方芷衡跑步，回來還不忘給大家帶早餐。何憫鴻躺在床上不吃不喝，盯著天花板出神，看起來頹廢至極。為能讓何憫鴻重新振作起來，余初暉和朱喆故意拿話激她，認為她出身學歷都不如葉蓁蓁，沒有公主命還有公主病，遭到生活的教訓就一蹶不振。
方芷衡往家走察覺到有人尾隨，索性將計就計引對方到胡同，等在原地直至對方出現，一眼認出她就是李勛的妻子。雖然二人沒有比較大的沖突，但是方芷衡已經變相警告李勛妻子，令她想要惹事的心略有收斂。
研究所領導想讓女下屬們都去飯局做陪客，葉蓁蓁完全不買賬，當場將傳話的男同事大罵一頓，在場眾人圍觀看熱鬧，直到于淼森出面勸和才草草結束。葉蓁蓁完全不在乎這種做法是否得罪領導，她還讓女徒弟跟在身邊工作，若是有類似飯局就推掉。
余初暉八卦葉蓁蓁在研究所發生的事情，又恰巧沒有帶茶杯，鐘鵬浩給她準備杯子和零食，不經意間流露出對她的喜歡。正當余初暉想方設法委婉回絕鐘鵬浩，忽然收到何憫鴻的群發消息，也知道她辭職的真正想法。
疾惡如仇的余初暉準備替何憫鴻出一口惡氣，主動向朱喆請教如何收拾林總監，確保可以一擊必中。朱喆建議余初暉借用輿論東風拋出最刺激的爆料，變相離間公司高層管理的關系，攻擊林總監公報私仇。果然這篇文章經過余初暉的微博發布后，立刻引起軒然，更是吸引陸總的注意。
朱婷婷和丈夫來上海蜜月旅行，第一時間就跑到朱喆曾經工作的酒店，意外得知朱喆早已離職。由于酒店客房部經理與朱喆關系較好，朱喆通過她知道妹妹突襲酒店的事情，忍不住向葉蓁蓁傾訴煩惱。葉蓁蓁心疼朱喆脫離不了這種原生家庭，吸血鬼姐弟的騷擾，也因為她的遭遇，感恩自己有個好父母。
隨著輿論發酵已到無法收場的地步，陸總帶著林總監親自上門找何憫鴻，無外乎兩個原因：其一是邀請何憫鴻重回公司；其二是希望何憫鴻擺平這場風波。何憫鴻拒絕回公司，表示自己可以當槍手寫文賺錢，朱喆和葉蓁蓁尊重她的選擇，決定代替她出面交涉。
朱喆以何憫鴻表姐的身份來見兩位高層領導，直接挑明何憫鴻絕不會再回公司。陸總表態會尊重何憫鴻的選擇，瞬時說明來意，希望何憫鴻可以公開發布聲明，否認自己辭職是受公司迫害。
也正因陸總和林總監焦急的態度顯露無疑，朱喆故意喊價抬高他們所謂的有償報酬，精準無誤地打壓對方氣焰，也算是替何憫鴻出了一口惡氣。何憫鴻拒絕接受對方開出的條件，就算吃虧也要維護公道，便讓朱喆陪她下樓去見陸總和林總監。
因為李勛妻子的跟蹤，方芷衡感覺到一絲危機，立馬將此事告知葉蓁蓁，除了提醒她安全防范之外，還把事情原委全盤托出。方芷衡之所以能夠成功扳倒李勛，不僅僅是指控他職場騷擾女性，更是源于一位潛伏公司內部的財務幫助，此人手里掌握李勛大量經濟犯罪的證據。
在方芷衡看來，這件事最終是以李勛坐牢為代價，就連李其行醉駕肇事都無可幸免。如此沉重且帶有摧毀性的結果，勢必會引來李勛家強烈的報復，遠比預想還要嚴重，方芷衡自責連累葉蓁蓁，但是葉蓁蓁自愿幫助，毫不后悔。
何憫鴻鼓起勇氣拒絕林總監送來的兩萬塊錢，聲稱自己不能昧著良心發微博澄清，他們應該為做過的事情負責。此話說完，何憫鴻帶著朱喆和余初暉就離開，余初暉在心里默默給何憫鴻點贊，可嘴上還要對她各種奚落。
這天晚上，葉蓁蓁與方芷衡把酒言歡，喝到盡興時唱起歌來，身心都得到放松。反觀何憫鴻和余初暉暫且和好，二人在朱喆的幫助下，準備一桌好菜，美名其曰是慶祝何憫鴻重生，開啟新的生活。
等到次日清早，何憫鴻親自下廚烙餅，余初暉和余初暉聊起各自的煩惱，無論是爛賭家暴的父親，亦或是勢利貪婪的弟妹，相同的境遇讓她們難以感受親情溫暖。方芷衡想盡辦法打聽李家的情況，總覺得李其行的反應太過平靜，擔心會有一場猝不及防的暴風雨，提前給葉蓁蓁打個預防針。
自從上次被余初暉看穿心思，鐘鵬浩也就不再掩飾對她的愛意。然而余初暉直截了當拒絕，表示自己的家庭有問題，完全不適合他這種本分老實的人家，以后可以繼續做正常的朋友同事，唯獨戀人關系是絕無可能。
輿論風波過后，林總監被總公司召回，宋礫知道事情真相，主動來找何憫鴻道歉，并且感謝她為底層作者發聲。這件事情讓何憫鴻感受到從未有過的尊重和滿足，為此沾沾自喜，朱喆提醒她關于微博文章內容存在臆測成分，主要是根據現有線索合理推測，希望她不要到處宣傳，更不要愧疚林總監因她而受處分。
無論任何行業，關乎利益之爭必定血雨腥風，就連葉蓁蓁都難以逃脫。毫不意外，外界都在瘋傳葉蓁蓁與陶教授有不正當男女關系，小部分人看得透徹，大部分人是跟風謾罵，更有甚者添油加醋扭曲事實。
于淼森認為葉蓁蓁就算不去回應，照樣還有更多惡意的臟水潑來，唯一辦法就是加強自身心理建設，遲早會有大白真相的一天。戴維來到所里找葉蓁蓁，宣布自己辭職買了一輛車，準備到處旅游散心，好好享受生活。關于李其行的事情，戴維猜測他因事務纏身，分身乏術，恐怕想在上海立足相當艱難，就算留在上海，若是沒有李勛的庇護，照樣還得從基層慢慢熬。