夜斗與毘沙門一役，以突然趕到的小福用大黑打開了通往黃泉的“風穴”，“時化”驟起妖怪大量涌出而暫靠一段落。
雪音在之后離開日和的家，來到天神的神社，想離開夜斗，讓天神把自己收為神器，但被拒絕。雪音依然在邪念的驅使下繼續做出刺傷夜斗的舉動，夜斗也因身上的“安無”（ヤスミ，也稱“恙”，神明因神器的墮落而被不潔的異質感染）而越來越虛弱。
正當雪音一個人跑到公園里時，被夜斗叫做“野良”的少女再次出現在了他的面前。
夜斗與雪音新接到委托，來自于日和同校的學生——荻原學，一個面對同級生的欺凌，只會懦弱地獨自流淚而不去行動起來勇敢反抗的孩子。
然而，面對這樣的場所——只要是活著的學生每天都能來的的學校，已是死靈的雪音的心中又會生出怎樣的感觸、掀起怎樣的波瀾呢？
由于雪音所犯的種種錯誤，夜斗被“恙”折磨得越來越嚴重，陷入了極度危險的狀態。為了拯救夜斗，必須對讓他陷于此境的神器——雪音進行“禊”，讓他對自己的種種罪行做出真正的懺悔。然而，要進行“禊”，則需要有三名其他神器……