半澤直樹在推進帝國航空的重建。為了給富余人員尋找出路，他與東京中央證券的森山共同計劃了Sky?hope航空的新路線，但是，新路線的許可申請卻突然被拒絕了。金融廳發出業務改善命令，中野渡行長向金融廳長官低頭，這一切都被報道了出來。社會對東京銀行的非難也越來越嚴重。所有這些事的幕后黑手是國土交通大臣白井亞希子。半澤被動真格了的政府施加的壓力壓得透不過氣來。然而，這些事情發生的時機也太湊巧了，半澤懷疑向政府泄露行內秘密的叛徒不是紀本就是大和田。放棄債權的回答期限——“特別小組共同報告會”的日子越來越近，作為最后的希望，半澤去拜訪開發投資銀行的谷川。
在“特別小組共同報告會”上，半澤代表東京中央銀行與開發投資銀行一起拒絕放棄債權。然后，他從妻子小花那里聽說，智美小姐曾經是銀行職員，而且過去是中野渡行長的部下。另一方面，紀本常務試圖讓銀行接受放棄債權，甚至說賭上自己作為銀行職員的生命，結果卻失敗了，大和田差點能趕他下臺。然而，由于之前共同報告會的原因，中野渡行長反而提出了邀請證人的傳言。政界的大佬箕部干事長終于發動攻擊了。而紀本常務與政府相互勾結。帝國航空的山久把特別小組的重建草案拿給半澤看。半澤注意到虧損線路羽田·伊勢志摩線路被排除在裁撤名單之外。伊勢志摩正是箕部的選區，他為當地建設竭盡全力，機場也被贊為他的功績，當地人稱為“箕部機場”。半澤確信箕部掌握著解決一切的關鍵，便四處尋找線索。這時，他得知黑崎也追查箕部。就這樣，半澤打開了東京中央銀行那扇出人意料的“黑暗之門”。
半澤要打探合并前舊東京第一銀行曾給箕部干事長融資20億日元的事實。然而，證據顯示是已經亡故的前副行長牧野收取賄賂，半澤不得已只能罷手。而箕部的魔爪也伸向了同樣在追查箕部的金融廳黑崎，黑崎再次被調到國稅廳。半澤以黑崎最后留下的線索“伊勢志摩state”入手，飛往伊勢志摩。某人正在機場等著他。在伊勢志摩分行的同期幫助下，半澤開始徹底調查“伊勢志摩state”15年前的財務資料。而且他看到了一個意想不到的人物。半澤的懷疑逐漸得到了證實。