何東和羅啟晗路過吉貝菜市場時碰到運送病人的車輛發生車禍，車廂里有三名埃博拉疑似患者傷勢不明，司機左臂骨折，雖沒和患者接觸過，但傷口有出血，羅啟晗和急救中心聯系后幫司機包扎傷口，何東對其中一名幼童現場施救，但按壓心臟數次后孩子依然沒有反應，何東急了，立即脫掉防護服對其進行人工呼吸，不遠處的羅啟晗看到后眼淚直流，在他的努力下，孩子終于恢復了呼吸，救護車接走患者后，何東震驚地看到自己手臂上有血漬，他不允許羅啟晗靠近自己，看何東累得癱在了地上，羅啟晗淚流滿面。
回到醫院后，馮剛喝斥二人不要命了，安排對他們就地消殺后在駐地隔離，等待疑似患者檢測結果。
隔離病房里，羅啟晗坐在地上背靠墻安慰隔壁的何東：不用擔心，要死二人一起死，雖然她和病人血液沒接觸上，但皮膚表面可能已經接觸上了。何東抱歉之前是他不理解啟晗，一直認為自己是特別理智的醫生，但今天那個孩子躺在自己面前的時候，他明明知道有可能是埃博拉，也知道應該首先保護好自己，但還是摘下防護給他做了人工呼吸。羅啟晗認為何東做得對，如果不這么做，孩子就沒命了。何東決定如果二人這次都能出去，一定給啟晗買十箱辣條，在國內等著她回來，還要帶她去個地方。
馮剛見老高送的飯菜羅啟晗和何東都沒動，立即去通知二人：一家三口的檢測結果出來了是陰性，但需72小時內接受第二次檢測再確診，孩子的狀況是高度疑似，他們是高度接觸，何東不要惦記回國的事，等隔離期滿了再說，二人要下樓鍛煉身體，保持良好的身體素質和心理狀態，不允許把小高做的飯再剩下。
護士長吳秀娟奇怪今天卡方的護工都不見了，連瑪南也請了半天假。很快，醫護人員聽到了醫院門口有人請愿高呼：”抗擊埃博拉無罪”、”讓何醫生留下“。
副總統布瑞麗卡以與霍蘭德共事多年同事的身份，建議他撤消對何醫生的處罰，她認為何東因救人而受到懲罰會傷害中國醫療隊的感情，而且醫案委員會的調查結果證明了中國醫療隊的檢測和用藥都沒有問題，如果因此否定中國留觀中心所有的成績，會影響到抗擊埃博拉的團結，她剛聽說何醫生因對疑似患兒進行人工呼吸，回國的日期推遲了，希望霍蘭德利用這個時間再慎重考慮一下他的決定。
很快，馮剛接到卡巴利亞政府通知：恢復中國留觀中心轉診療的流程，何東隔離結束即返工作崗位。這個好消息讓大家為之振奮。馮剛轉而問責鄭書鵬今天醫院門口聚集請愿的事，提莫斯趕緊跑過來解釋這都是他的主意，多叫了幾個朋友，但他們都接受過中國醫生的幫助，是真心來援助的，瑪南也附和作證。馮剛笑道不要被別有用心的人利用了他們的善良。
隔離終于結束了，何東騎摩托車帶上羅啟晗來到爺爺何守承墓前，他把爸爸的遺像帶給爺爺，說他們父子生前連喝茶的時間都沒有，現在就讓爸爸在非洲陪著爺爺。羅啟晗這才明白，原來何東之前給她講的故事中連續工作四天四夜的醫生就是何東的爸爸。得知何東爸爸在鄰國的中國專家公墓里，羅啟晗敬佩他爺爺和父親一起犧牲在了非洲，足以見證他們對非洲的熱愛。何東說起家族人其實很忌諱談非洲，但偏偏經常收到非洲寄來的郵件，有小紀念品，還有各種語言?的感謝信，所以從小到大，他不知道對非洲應該是愛還是恨，他們的事也是奶奶告訴自己的，只是爺爺和爸爸都給奶奶說過同樣的話：說非洲需要他，非洲兄弟的眼里有一種純凈和渴望，所以他必須來到這里用自己的眼睛看看這個地方到底有什么魔力可以讓這兩個人丟下孤兒寡母前赴后繼地把自己埋在這里。何東哭了，他知道爺爺和爸爸都是英雄但從來不是自己的英雄。他從醫院院畢業那年，媽媽才把爸爸犧牲的過程告訴自己，大家都說他爸爸是個偉大崇高的醫生，但他只覺得爸爸很蠢，做為醫生他應該明白只有活著才能救更多的人，就算他是個普通人，也應該知道家里有母親、妻子和孩子在等著他回家。可是直到那天，他們在菜市場那個孩子就要死在自己面前的時候，他什么也沒有想，誰也沒有想起來，只想救他。何東痛哭流涕地對著爸爸遺像說對不起，他現在才明白治病救人永遠是他們不計生死的信仰。羅啟晗默默地坐在何東身邊，背出了醫學生誓言：…為了醫術的圣潔和榮譽奮斗終身……。她感謝何東讓自己真正感受到了醫學生誓言每一句話的意義。
何歡被烏爾曼約到了海邊，他想再幫老板最后一個忙，希望何歡不管發生什么，能夠公正地報道這件事。
新聞發布會上，總統塞爾瑞表示通過黑石塞一位關鍵人物獲悉了塔巴那西反政府武裝的罪行，但這并非出自塔巴那西本意，政府愿意對話解決爭端和分歧，埃克聲明軍方將保留隨時出兵的權利，在必要的時候動用武力換取和平。發布會后，埃克留下何歡，告訴她出于安全考慮，她的名字不會出現在政府和塔巴那西任何一個報告中，希望她能夠公正報道卡巴利亞。
楊楊晚上給鄭書鵬打電話，說瑪南媽媽抱著發燒的弟弟在門口請求救助，范副隊已經去處理。次日，鄭書鵬遺憾的告訴瑪南：她弟弟檢測結果是陽性，媽媽也要隔離。瑪南哭了，她不明白為什么一家人都這樣慘遭厄運？鄭書鵬和秀娟安慰她中國醫療隊有信心幫助她的親人恢復健康。
勞拉病情加重，布拉罕和副總統布瑞麗卡通話，希望她能夠安排勞拉接受專業治療，布瑞麗卡請示總統塞爾瑞后，塞爾瑞認為勞拉和塔巴那西不一樣，她理應及時得到救治，而且這是一個擁抱和平的機會，他安排埃克給勞拉開辟綠色通道，確保讓她順利通過關卡。
塔巴那西覺得塞爾瑞這么爽快答應不正常，他立即給塞爾瑞打電話，指出他這是個引蛇出洞的陰謀，塞爾瑞知道塔巴那西的顧慮，告訴他會安排中國醫療隊為勞拉治療，而且如果政府要動用武力，幾分鐘內炸彈就會出現在他的黑石塞，塔巴那西終于答應明早八點，雙方在緩沖地帶準時交接。
塞爾瑞總統親自給中國大使館打電話，希望他們派出一支醫療小分隊明天一早趕到兩軍對峙的緩沖區接勞拉，馮剛和范依林等人商量后，決定派鄭書鵬、何東和懂法語的秋虹一起去，馮剛叮囑他們，到了現場切勿卷入他國的政治斗爭，以免造成不必要的麻煩。
次日，中國派出的醫療小分隊在副總統的陪同下準時到達二軍緩沖區把勞拉接上了救護車，正要走時，何歡趕了過來，她得知勞拉情況不樂觀，腦海中浮現出了與勞拉相處的一幕幕場景：是勞拉把她從寞塞斯手里救了出來，說她們如此相似，是一件值得慶祝的事，是勞拉迎著戰火沖進疫區，讓他們幸免遇難。虛弱的勞拉快不行了，她一直在呼喚塔巴那西，讓秋虹轉告：希望他能抬起頭看看月亮。在布瑞麗卡副總統的許可下，埃克才允許塔巴那西進入政府軍領地靠近勞拉，但不允許他帶走勞拉的尸體，因為感染埃博拉的尸體，政府要統一掩埋，塔巴那西不同意，面對埃克的槍口，他突然挾持了何東，雙方正在僵持，瓦托馬村酋長來了，酋長說塔巴利亞曾承諾給他們建立一個更好的卡巴利亞，但連年來只有無休止的戰爭，埃博拉就是懲罰他們的武器，分裂只能帶來傷害，塔巴那西的理想只是幻覺。這時總統塞爾瑞也趕到了，他告訴塔巴那西他挾持的何醫生是何守承醫生的孫子，何守承醫生曾救過他們家族的命，她媽媽就是何醫生爸爸的守墓人，他答應要完成守墓人的家族誓言，中國醫生無私幫助過他們，他這樣做是與整個卡巴利亞為敵。他們可以坐下來共同商討卡巴利亞的未來。塔巴那西提出政府要對自己的士兵尊嚴對待，埃克認為這是士兵的權利，塞爾瑞完全同意。在大家的共同努力下，塔巴那西終于放開了何東，愿意與政府對話。
回來路上，鄭書鵬感慨沒想到何東的爸爸竟然是何守承醫生，而他當年種下的因得到了今天的果，令人震驚的同時也讓人唏噓。
謝云虎在P2工作時突然暈倒，所幸檢測結果是陰性，馮隊告訴大家：國內接老謝的飛機正在來的路上，明天無論什么結果，都會送老謝回去治療。
次日，鄭書鵬坐在床邊給昏迷的老謝讀書，他感嘆兄弟倆一起來到非洲，沒想到會以這種方式分別，他心里清楚老謝每天都為大家忙前忙后，一個好覺都沒睡過，認識他是自己這輩子的幸運，也希望把這個幸運給到他，盼望他一定要醒過來，家里有嫂子和兒子還等他回家。臨走時，鄭書鵬在老謝手背上寫了“加油”。
晚上，陳院長親自過來接云虎回國，鄭書鵬流著淚向院長道歉沒照顧好云虎，云虎在擔架上臨上飛機時突然舉起了寫著“加油”的那只手，所有隊友齊呼“虎哥加油”！
經過多輪談判，卡巴利亞政府軍正式收編判軍，并收押反政府武器和財產，衛生部派遣防疫小組進駐桑宜村進行全面消殺。
鄭書鵬親自來接布拉罕，因長時間聯系不上他，卡巴處亞衛生部調了一個新院長，布拉罕很榮幸能與中國醫療隊一起抗擊埃博拉，他絲毫不在意職位。
回去后，鄭書鵬告訴何歡，瑪南的弟弟和媽媽已經康復可以出院了。謝云虎經國內專家的全力救治，也在慢慢恢復，只是現在也查不清楚是什么讓他感染上病毒的，何歡感慨人類掌控了埃博拉，又會出現新的未知病毒，人類就是這樣，在食物鏈中吃也被吃。
親人康復出院本是好消息，瑪南卻發愁他們無家可歸了，因為薩坶的妻子，也就是瑪南的阿姨被瑪南弟弟傳染了埃博拉，村里不讓他們回去了。鄭書鵬和何歡找到族長，希望他能通融，因為大家的敵人是病毒而不是彼此，族長最終決定組織一個潔凈儀式，以消除村人的顧慮，但關鍵還是要讓薩坶原諒他們，鄭書鵬讓瑪南先參加儀式，他們去和薩姆談。
薩姆一看到鄭書鵬和何歡，就明白了他們的來意，他非常抵觸，堅持認為善良的妻子因幫瑪南媽媽照顧孩子，不幸染上埃博拉離世，而她的孩子卻活了過來，鄭書鵬告訴他瑪南爸爸在抗擊疫情中犧牲，現在瑪南當了一名護士繼續為之奮斗，她正在替母親參加潔凈儀式，薩姆情緒激動，一氣之下將他們轟走。
潔凈儀式上，瑪南當眾哭訴媽媽失去了丈夫，無意把病毒帶給了族人，自己愿意代她受過，失去阿姨媽媽倍感難過，活著就是為了贖罪，懇求族人允許他們留在村子里，幫助照顧阿姨的孩子，她愿意代替母親接受鞭撻。鑼鼓響起，眼看巫師的鞭子馬上就要落在瑪南身上，薩姆趕了過來，他改變了心意，告訴族人妻子生前很善良，這次的悲劇只是場意外，瑪南和妻子一樣善良勇敢，妻子也不愿看她最愛的親人受傷，就算趕走他們，妻子和瑪南爸爸也回不來了，疫情已經過去，生活終將繼續。他愿意原諒他們，這里永遠是他們的家。瑪南流著淚向薩姆叔叔鞠躬道謝，保證謹守諾言。
韓勇奇在新聞中聽到：反政府武裝塔巴那西宣布投降，鉆石走私案也浮出了水面，它與卡巴利亞境內的多起謀殺案有關，經與國際刑警合作，一名不知名媒體記者參與了深度調查，韓勇奇明白了這就是女兒冒著生命危險堅持的意義。
經卡方政府批準，中國留觀中心正式升級為中國留觀診療中心，副總統布瑞麗卡親自前來剪彩。
中國自主研發的埃博拉疫苗已經進入臨床試驗階段，鄭書儀院長帶領相關專家已到達卡巴利亞，甘姆笑問何歡馬上要采訪書鵬的姐姐一定很緊張，埃博拉馬上要過去了，塔巴那西也受到了應有的懲罰，他感謝何歡信守承諾，何歡笑道已和鄭書鵬約好等疫情結束就重回桑宜村，一邊喝棕櫚酒一邊唱歌，二人正愉快地聊著天，突然一個摩托車騎手橫在馬路中間將汽車逼停，之后迅速掏槍瞄準何歡連發二槍，甘姆見狀撲上去用自己的身體護住何歡，瞬間倒在血泊中。
何歡被送到中卡醫院急救，她因失血過多生命垂危，鄭書鵬讓抽自己的血，韓勇奇站在門口向大家鞠躬致謝。輸血中，鄭書鵬腦海里浮現出一幕幕與何歡相識、相知的場景，她的執著、樂觀、勇敢、善良深深占據著鄭書鵬的心，他和韓勇奇一樣，心里祈望著何歡能夠渡過難關，再回到他們身邊。
幾個月后，鄭書鵬和布拉罕、瑪南、甘姆等人到桑宜村宣傳埃博拉防疫知識。鄭書鵬來到何歡的墓前告訴她，卡巴利亞的疫情已經好轉，下周新的醫療隊就要來了，他得回去了。瑪南已經離開了中卡醫院，正在復習功課備考中國大學。想想他當初滿腔熱血報名來援非，一心想幫這里的人擺脫病毒，沒想到兩年時間過去了，改變的卻是自己，他學會了和不太熟悉的人擁抱，學會了用不太干凈的杯子喝棕櫚酒，學會了用謙虛和尊重的方式去和與自己意見不同的人相處，這里的一草一木都讓他睹物思人，同時提醒著他一切已經物是人非。他一定會遵守諾言，等這里沒有了疾病和戰爭，就來渡個假，因為何歡他們都還在這里。
埃博拉疫情經過前所未有的國際合作取得了勝利，中國醫療隊不辱使命，他們遭遇了酷暑、洪水、犧牲，也見證了友誼協作，這使他們更加敬畏自然和生命，更加珍惜和親人自由擁抱的每一分鐘，他們經歷過生死而不懼生死，無時無刻不在相互支撐，每時每刻都在互相關懷，在最危險的環境里做最熟悉的救死扶傷。不管是現在還是未來，鄭書鵬堅信：只要病毒還在，他們就會一直戰斗下去，為人類之健康奮斗終身！