鄭書鵬是第十九批到卡巴利亞援非的傳染病專家，任中國醫(yī)療隊(duì)副隊(duì)長，他們在卡巴利亞首都費(fèi)爾雷恩的中卡友好醫(yī)院工作。轉(zhuǎn)眼二年期限已到，醫(yī)療隊(duì)歸國的日期悄然而至?；貒?，書鵬最放心不下蓋斯姆醫(yī)生，老蓋在中國留學(xué)多年，即將升任中卡友好醫(yī)院外科主任，他是鄭書鵬在卡巴利亞最好的朋友。看到老蓋又在診室與患者擁抱道別，書鵬忍不住強(qiáng)調(diào)他接診要規(guī)范化，這樣才能保證自身的安全。
下班后鄭書鵬和謝云虎外出采買，他最喜歡到舊街道逛，雖然卡巴利亞經(jīng)濟(jì)并不發(fā)達(dá)，但他們生活簡單快樂，待人熱情真誠。老蓋中午親自下廚做了中國菜帶給鄭書鵬，得知老蓋在西紅柿炒雞蛋里放了醬油和老抽，鄭書鵬哭笑不得。
誰也沒想到十八床病人的到來，不僅打亂了援非醫(yī)療隊(duì)的回國計(jì)劃，還給當(dāng)?shù)貛砹烁膳碌臑?zāi)難。
2014年7月18日，老蓋接診了十八床的患者，他初步診斷病人可能得的是瘧疾，但很快十八床一直出血發(fā)燒，老蓋安排立即轉(zhuǎn)重癥監(jiān)護(hù)室。
鄭書鵬在街上接到了醫(yī)院電話。他在車上打電話向燕都省醫(yī)院馮剛院長匯報(bào)了患者癥狀，他懷疑是四級病毒，馮院長提醒他們要防止傳染，他馬上調(diào)專家過去。待書鵬趕到醫(yī)院時(shí)，十八床病人已經(jīng)進(jìn)了搶救室，王雯茜在擦滿地的血漬。
鄭書鵬正在看病歷時(shí)，謝云虎告訴他十八床病人沒了，書鵬馬上想到了老蓋，他要立即去趟斯賓塞。
泛非通訊組織《全球視界》記者何歡來到了聯(lián)合國難民營，正好老同學(xué)國超是志愿者前來接她。何歡看到難民營里有一對姐妹，國超介紹姐姐叫瑪雅，經(jīng)歷了兩次轟炸，父母在第一次轟炸中身亡，最好的朋友在第二次轟炸中沒了，前兩天妹妹一個(gè)人在難民營里誤吃了安眠藥，幸虧搶救及時(shí)給救過來了，但從那以后，瑪雅再沒說過話，現(xiàn)在她們是彼此唯一的親人。
斯賓塞四級實(shí)驗(yàn)室是卡巴利亞唯一一個(gè)可以檢測四級病毒的實(shí)驗(yàn)室，因負(fù)責(zé)人霍蘭德博士不在，華萊士博士只接收樣本，鄭書鵬告之情況危急，并說明自己有實(shí)驗(yàn)室的培訓(xùn)證書，華萊士才允許他們進(jìn)入。四級病毒的致死率極高，實(shí)驗(yàn)員需穿全隔離防護(hù)服，一旦進(jìn)入核心區(qū)，這身防護(hù)服就是實(shí)驗(yàn)員和高級病毒之間的唯一防線。在非洲，因人類和野生動物距離過近，很多危險(xiǎn)病毒都在此肆虐，鄭書鵬最擔(dān)心的是18床感染了四級病毒。
何歡看到瑪雅瘋了一樣打一個(gè)老婦人，趕緊把她拉開，國超告訴她，老婦人前天手里拿了一張兒子照片，她兒子身上穿著反叛軍的衣服，手里拿著機(jī)關(guān)槍，難民營里的人因?yàn)閼?zhàn)爭失去了一切，所以他們恨反判軍。何歡確認(rèn)了反判軍的衣服后，想起她來時(shí)拍過那個(gè)孩子的照片，后來聽同事說那個(gè)孩子已經(jīng)陣亡了，只有十九歲。何歡接到電話后即將啟程到卡巴利亞，她讓國超幫忙給營里的孩子們買點(diǎn)新衣服。
十八床的病毒檢測結(jié)果是陽性，鄭書鵬立即想到了他的密接者：老蓋、護(hù)士長簡妮等等人。因卡巴利亞出現(xiàn)首例埃博拉病毒，中卡友好醫(yī)院緊急封鎖，院內(nèi)集中消殺，接診的病人被集中隔離。
晚上，王雯茜學(xué)習(xí)了埃博拉病毒癥狀后，想起自己擦拭地板血漬的場景嚇得渾身發(fā)抖，在這個(gè)異國他鄉(xiāng)的黑夜里，她忍不住哭了起來。
陳柏欣副院長宣布：中卡友好醫(yī)院即日起停診，所有人員不能離開駐地，接觸過十八床的醫(yī)護(hù)人員都已經(jīng)隔離，還有密切接觸的要及時(shí)上報(bào)。中國醫(yī)療隊(duì)援非五十年了，已積累了豐富的經(jīng)驗(yàn)，沒有發(fā)生過隊(duì)員感染。隊(duì)友們和隔離的王雯茜視頻，祝她生日快樂，其間突然有人問院長：他們中如果有人感染是否意味著要客死他鄉(xiāng)了？氣氛頓時(shí)悲涼起來，女隊(duì)員已經(jīng)有人低聲啜泣。
看到大家情緒低落，鄭書鵬鼓勵(lì)隊(duì)友們不用過度擔(dān)心，他們來自于流行病擅長的燕都省人民醫(yī)院，2003的非典都打了勝仗，埃博拉是他們研究了三十年的病毒，更不會輕易被它打倒。
2014年7月19日，老蓋隔著玻璃窗懇求書鵬放自己出去，他約了病人手術(shù)，鄭書鵬笑道給他準(zhǔn)備了禮物，等他病好后自己來看，二人隔空擁抱。
7月28日，燕都省人民醫(yī)院院長朱永成召集醫(yī)護(hù)人員開會，通知世界衛(wèi)生組織發(fā)布的公告：在西非爆發(fā)的埃博拉疫情正式確定為國際關(guān)注的公共衛(wèi)生事件，呼吁各國給予合作，衛(wèi)計(jì)委的領(lǐng)導(dǎo)也在日內(nèi)瓦會議上表態(tài)中國將和非洲人民站在一起，積極投身到抗擊埃博拉的戰(zhàn)爭中去。醫(yī)護(hù)人員聽后紛紛舉手表決愿意出征非洲，重癥醫(yī)學(xué)科主任范依林提醒大家不要一拍腦門就去非洲，要充分認(rèn)識風(fēng)險(xiǎn)才能正確做出決定。李院長連線援非的陳柏欣副院長，讓陳院長介紹當(dāng)?shù)匾咔榍闆r。與此同時(shí)，費(fèi)爾雷恩政府和霍蘭德博士也對當(dāng)?shù)孛癖娡▓?bào)疫情數(shù)據(jù)：截至目前死亡8例，均來自中卡友好醫(yī)院的醫(yī)護(hù)人員，他們當(dāng)前要重視院內(nèi)感染，防止更多人員傷亡。
鄭書鵬接到強(qiáng)森電話要出去，謝云虎本想一起，卻被陳柏欣拉著接待華新社記者采訪。
鄭書鵬意識到，當(dāng)?shù)厝说臒崆楹蜆酚^使埃博拉疫情已經(jīng)迅速蔓延，強(qiáng)森經(jīng)營著一間酒吧，他是擁有多個(gè)博士學(xué)位的天才，也是實(shí)驗(yàn)室的高級研究員，前段時(shí)間鄭書鵬讓他幫忙設(shè)計(jì)一個(gè)疫情風(fēng)險(xiǎn)系統(tǒng)，他現(xiàn)在做出來了，雖然目前這個(gè)系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)的功能只有當(dāng)初預(yù)想的10%，但至少可以幫助卡巴利亞開展疫情防御工作了，鄭書鵬非常感謝強(qiáng)森的幫助。
老蓋隔著圍欄要找鄭書鵬，說有禮物要送給他，謝云虎答應(yīng)一定幫他轉(zhuǎn)達(dá)。老蓋被護(hù)士帶走后，謝云虎突然意識到自己的手剛才接觸了老蓋抓過的欄桿。
鄭書鵬根據(jù)強(qiáng)森提供的跟蹤系統(tǒng)，很快追查到十八號不是來自病歷上記錄的山宜村，而是來自桑宜村。他回醫(yī)院后謝云虎躲在屋里不敢見他，書鵬只好隔著窗子告訴他調(diào)查結(jié)果。之后，他在隔離病人記錄板上看到：28日老蓋已經(jīng)有了發(fā)熱癥狀，書鵬心里一沉，他最擔(dān)心的事還是發(fā)生了。
燕都省人民醫(yī)院中西醫(yī)結(jié)合科主治醫(yī)師何東和腫瘤外科主治醫(yī)師羅啟晗一起在體育場鍛煉體能，何東立志要去援非，他聽說檢測隊(duì)已經(jīng)出發(fā)了，判斷派醫(yī)療隊(duì)是遲早的事，羅啟晗提醒他一定做足必要的準(zhǔn)備。
謝云虎晚上接到了妻子文燕硯的視頻電話，燕硯懷孕了，她看出云虎狀態(tài)不對，追問原因，云虎開始說可能感染了埃博拉，后來趕緊改口說只是瘧疾。掛了電話，燕硯有了分娩癥狀，立即和媽媽一起去了醫(yī)院。7月28日，所有接觸過十八床的醫(yī)護(hù)人員除了老蓋和王雯茜，其他的全部死亡。
卡巴利亞政府向公眾通報(bào)：十八床病人來自反武裝控制的桑宜村，隨著卡巴利亞首席埃博拉專家凱拉慕博士感染埃博拉身亡，卡巴利亞的醫(yī)療力量更加捉襟見肘，他們迫切希望得到國際援助，請求各國派出醫(yī)療隊(duì)支援。
何歡找到桑宜村的甘姆了解情況，甘姆介紹他們村人很多在黑石寨打工開采鉆石，好像最近那些人都沒回來。半路上，何歡碰到了同事伊莎貝拉準(zhǔn)備假扮無國界醫(yī)生到桑宜村，她與何歡擁抱道別。
甘姆回憶那天他和往常一樣騎車送香蕉，看到了何歡讓他在村子里等的馬克（鉆石掮客），甘姆發(fā)現(xiàn)馬克進(jìn)寨后一直沒有離開。
鉆石礦區(qū)里，馬克把介紹埃博拉病毒的書拿給反武裝首領(lǐng)塔巴那西看，參謀長寞塞斯過來匯報(bào)最近一個(gè)月出現(xiàn)疑似癥狀的工人和他們的家屬已經(jīng)隔離了。馬克問起阿達(dá)瑪，寞塞斯抱歉沒及時(shí)發(fā)現(xiàn)阿達(dá)瑪感染，導(dǎo)致他趁亂逃出黑石寨求醫(yī)。馬克說一個(gè)月前，黑石寨出現(xiàn)不明傳染病時(shí)，吉布森就讓他們抓緊防疫，結(jié)果不但桑宜村醫(yī)生被感染死了，還白白損失了兩條走私船，寞塞斯有些惱火，質(zhì)問馬克為何還不走，馬克說他在等塔巴那西降價(jià)出售鉆石。這時(shí)侍衛(wèi)長烏爾曼過來服務(wù)寞塞斯。
何歡從甘姆處得知這次馬克來了后黑石寨的戒備越來越嚴(yán)，她決定親自前去一探究竟，以無國界醫(yī)生身份先進(jìn)入反武裝緩沖區(qū)。路上，何歡看到一群人圍著一具尸體在親吻，甘姆告訴她這是當(dāng)?shù)氐娘L(fēng)俗。他們到達(dá)醫(yī)療點(diǎn)后，碰到了莫塞斯和布拉罕醫(yī)生，甘姆說布拉罕是來替換之前失蹤的醫(yī)生，何歡主動上前和布拉罕打招呼，說自己是來幫助他們的，布拉罕看了她一眼一言不發(fā)就走了。莫塞斯叫何歡過去摘下口罩檢查，還要看她的證件，沒想到何歡遞上護(hù)照后，莫塞斯開車揚(yáng)長而去。何歡由此斷定這個(gè)地方已經(jīng)爆發(fā)埃博拉了。
午飯時(shí)，鄭書鵬來看老蓋，看他吃得狼吞虎咽稍稍安心，他送給了老蓋一件印有中國國旗的白大褂，老蓋非常開心，回送了書鵬一個(gè)木雕石猴，還把志愿者提莫斯介紹給書鵬，他現(xiàn)任埃博拉調(diào)度員。書鵬離開后，老蓋馬上放下了碗筷，讓提莫斯給自己拿紙和筆。
2014年8月12日，老蓋病危，鄭書鵬沖到隔離區(qū)對昏迷的老蓋喊道：不要當(dāng)逃兵！他穿手術(shù)服的同時(shí)腦海里迅速浮現(xiàn)出了二人曾在海邊奔跑聊天的場景，老蓋當(dāng)時(shí)對著大海吶喊他有個(gè)夢想就是想回中國，書鵬笑道這很簡單，他一定能實(shí)現(xiàn)。鄭書鵬做好準(zhǔn)備趕到病房時(shí)，發(fā)現(xiàn)渾身是血的老蓋搖搖晃晃地從病床上爬起來要出去，醫(yī)護(hù)人員呼叫了警衛(wèi)，書鵬懇求警衛(wèi)不要開槍，他趕緊拿了張隔離膜捂到了老蓋身上，就這樣，老蓋直挺挺地?fù)湓卩崟i身上去世了。當(dāng)?shù)厝苏f老蓋的詐尸是不想孤獨(dú)地離去，書鵬想至少在老蓋生命的最后一刻他是在朋友的懷抱里離開的。
國內(nèi)，馮剛副院長做為先遣專家考察歸來，朱院長開會通知：醫(yī)院已接到上級指示，將派出醫(yī)療隊(duì)和檢測隊(duì)一起，前往卡巴利亞執(zhí)行抗疫任務(wù)，院里連夜對報(bào)名人員綜合能力篩選后初選出四十位，經(jīng)測試后最終將確定二十位人員，由馮剛副院長帶隊(duì)前往卡巴利亞執(zhí)行援非醫(yī)療救助，院里對醫(yī)療隊(duì)的要求是：打勝仗零感染！三天準(zhǔn)備，16號出發(fā)。有人提出：卡巴利亞已經(jīng)出現(xiàn)院內(nèi)感染，如何保證醫(yī)療隊(duì)不被感染？馮剛介紹說，衛(wèi)計(jì)委領(lǐng)導(dǎo)已會同各國流行病專家以最快的迅速制定出了援非醫(yī)療隊(duì)同志的安全防護(hù)措施和操作流程，并將于15日前準(zhǔn)備好他們在無人區(qū)生活半年的物資采購，保證安全送到卡巴利亞，他們的吃穿用度是國家任務(wù)沒有商量。他相信在國家強(qiáng)有力的支持下，醫(yī)療隊(duì)一定能順利完成抗疫任務(wù)。會后，馮剛即組織開始體能測試，測試不通過者直接淘汰。
卡巴利亞，黑石寨設(shè)了關(guān)卡，何歡和甘姆進(jìn)不去，兩人在寨子外意外發(fā)現(xiàn)有一群穿防護(hù)服的人，從寨子里押出來了很多人像要掩埋，逃跑者槍斃。二人暴露后被帶到了莫寨斯面前，莫塞斯二話不說舉槍就要?dú)⑺麄儯螝g趕緊解釋自己是無國界醫(yī)生，可以幫助他們切斷感染源，見莫塞斯不為所動，布拉罕醫(yī)生氣憤地說這里情況復(fù)雜，只靠自己一個(gè)外科醫(yī)生根本無法有效防止疫情蔓延，把何歡留下能夠幫助他們抗擊疫情，他毫不畏懼地走到莫塞斯槍口下讓他看著辦，正在二人對峙時(shí)，塔巴那西妻子勞拉過來了，她提醒莫塞斯布拉罕現(xiàn)在是村里唯一的醫(yī)生，他這樣做會害死所有人，莫塞斯只好作罷。
王林的體能測試沒有過關(guān)，他生氣自己平時(shí)訓(xùn)練非常努力，一腔熱血卻敗給了冰冷的數(shù)字，懇求院里再給自己一次機(jī)會。馮剛告訴大家：二十減一等于零，埃博拉通過接觸傳播，如果他們中有一個(gè)人感染，哪怕只有萬分之一的疏漏，他們所有人的骨灰就會永遠(yuǎn)留在異國他鄉(xiāng)，正是為了避免這萬分之一的疏漏，他們今天才制定了非常嚴(yán)苛的體能數(shù)據(jù)指標(biāo)。
8月15日，提莫斯把老蓋的遺書交給了鄭書鵬，遺書中老蓋說了兩件事：第一，請求書鵬解剖自己的尸體用以進(jìn)行埃博拉病毒研究，這是他對自己國家和世界所能做的最后一點(diǎn)貢獻(xiàn)。只可惜，目前卡巴利亞的醫(yī)療條件無法滿足老蓋這個(gè)遺愿。第二，在他死后，朋友們不要難過和自責(zé)，他認(rèn)為死亡是另一種存在方式，他們終將會相遇。這樣當(dāng)了逃兵離開是他此生最大的遺憾。最后他懇求鄭書鵬幫自己挽救苦難的國家，幫助同胞們一起戰(zhàn)勝埃博拉。
鄭書鵬通過大使館向卡巴利亞政府提交了申請，希望他們批準(zhǔn)自己留在卡巴利亞繼續(xù)抗疫，現(xiàn)在當(dāng)?shù)蒯t(yī)護(hù)人數(shù)犧牲人數(shù)已經(jīng)過半，他請求進(jìn)入桑宜村，在危急時(shí)刻履行醫(yī)生的職責(zé)治病救人，為此他愿承擔(dān)一切后果不計(jì)生死。
中國駐卡馬利亞大使柳蔭楠給陳柏欣打電話說，絕對不能掉以輕心，昨天從國外入境的女乘客疑似埃博拉，已經(jīng)緊急隔離了，檢測結(jié)果還沒有出來，他們離疫情只有一個(gè)航班的距離。
王雯茜終于解除了隔離，陳柏欣率全體隊(duì)員歡迎她歸隊(duì)，他高興地宣布：所有隊(duì)員檢驗(yàn)結(jié)果全部陰性，很快他們都可以回家了！正在這時(shí)，謝云虎跑過來匯報(bào)說鄭書鵬不見了！
卡巴利亞政府召開疫情通報(bào)會之前，向媒體公布了鄭書鵬遞交的援非申請，宣布正式聘請鄭書鵬做為外國專家進(jìn)入桑宜村指導(dǎo)疫情防控工作。