一九四零年秋，由于國民黨軍統(tǒng)局諜報(bào)人員侯坤的變節(jié)與叛變，軍統(tǒng)局上海諜報(bào)站遭到了日軍的血洗。侯坤帶著日本人去抓軍統(tǒng)上海站的副站長萬木林，光哥收到了組織上的消息要除掉近日即將抵達(dá)上海的大漢奸鄒博庵，光哥看到了之后問那個(gè)送情報(bào)的人他們都跟組織上失去聯(lián)系這么長時(shí)間了，這情報(bào)是哪里來的。
這時(shí)候光哥發(fā)現(xiàn)了有兩個(gè)人發(fā)現(xiàn)了他的偽裝一直在跟蹤著他，隨后他讓那個(gè)人坐下來要給他拔牙假戲真做。漢奸看光哥真的是個(gè)拔牙的大夫不像是共產(chǎn)黨之后就走了。萬木林在被抓捕逃跑的時(shí)候崴了腳剛好遇見了騎自行車經(jīng)過的光哥，光哥讓他坐上了自行車帶著他逃走了。
佐藤帶著人沒有抓到萬木林回去之后收到了將軍的嚴(yán)厲責(zé)罵，他限佐藤三日之內(nèi)一定要抓住萬木林。萬木林給軍統(tǒng)局發(fā)電報(bào)說了侯坤變節(jié)的事情，請(qǐng)求火速支援重組上海站，顧雪峰被任命為軍統(tǒng)上海站站長，李鳳凰，周海萍，歐陽琴和齊玉環(huán)這四個(gè)人也被調(diào)到上海。他們要組建軍統(tǒng)站在上海的十三釵隊(duì)伍，啟動(dòng)僵尸計(jì)劃，激活那些長期潛伏的僵尸，繼續(xù)執(zhí)行蔣委員長下達(dá)的鐵血鋤奸計(jì)劃。
鄒博庵抵達(dá)上海火車站之后歐陽琴率先開了槍準(zhǔn)備刺殺，李鳳凰帶著周海萍和齊玉環(huán)掩護(hù)撤退的時(shí)候李鳳凰被光哥救了一下。武田將軍回到六國賓館跟鄒博庵見了面，說讓他受驚了。李鳳凰回去之后問歐陽琴為什么要提前開槍，她說現(xiàn)在不是沖動(dòng)意氣用事的時(shí)候，一定要以大局為重。
隨后李鳳凰給她們?nèi)齻€(gè)人制定了計(jì)劃，晚上的時(shí)候她們四個(gè)人去教堂跟萬木林見了面，萬木林說她們是軍統(tǒng)特工不是江湖女俠，她們這次已經(jīng)打草驚蛇，會(huì)影響下一步的行動(dòng)計(jì)劃。李鳳凰晚上暗殺了日本行動(dòng)隊(duì)長佐藤，武田將軍任命宮野為日軍特工行動(dòng)隊(duì)的隊(duì)長。
宮野讓侯坤去D博準(zhǔn)備引出軍統(tǒng)暗殺他的人趁機(jī)一網(wǎng)打盡，光哥在D博的時(shí)候遇見了李鳳凰，光哥告訴自己妹妹叮當(dāng)說一會(huì)兒讓她早點(diǎn)回家等著自己。隨后光哥走到了李鳳凰身邊說了一句人生何處不相逢。光哥又救了李鳳凰一次，晚上光哥在回家的時(shí)候被李鳳凰給綁了回去。
萬木林先是踢了光哥幾腳掀開了他頭上的麻袋之后發(fā)現(xiàn)時(shí)光哥，萬木林一下子慌了神，光哥劈頭蓋臉的罵了萬木林一頓。隨后萬木林給李鳳凰說這光哥是他的救命恩人，晚上萬木林跟光哥喝醉了酒結(jié)為了兄弟。第二天光哥把萬木林他們帶到了自己租的地方讓他們落腳安身。
李鳳凰她們還是要決心除掉侯坤，晚上的時(shí)候他們?nèi)ジ栉鑿d準(zhǔn)備殺了侯坤，這時(shí)候?qū)m野帶著日本憲兵趕來包圍了她們。這時(shí)候李鳳凰壓著侯坤出來說給他們一輛車，宮野說將軍有命要全殲軍統(tǒng)站的人。這時(shí)候光哥看李鳳凰她們四個(gè)人有危險(xiǎn)就沖了出去，萬木林沒有攔住他。
李鳳凰他們撤到了舞廳里面之后被一個(gè)賣藝的女孩子給救了，他們從后門出來之后被漢奸給包圍了。李鳳凰說光哥就是個(gè)掃門興，遇見他就倒霉，那漢奸胡三寶要他們投降，這時(shí)候顧雪峰開著車來救走了他們。回去之后顧雪峰說大家辛苦了，還強(qiáng)調(diào)了一下紀(jì)律，隨后就走了。顧雪峰臨走的時(shí)候讓李鳳凰激活將是計(jì)劃，并且調(diào)查光哥。
光哥給那個(gè)受傷的女孩子取出了子彈，隨后光哥個(gè)李鳳凰說現(xiàn)在不能去買藥品，日本人肯定有埋伏，他決定去郊區(qū)買點(diǎn)草藥。這個(gè)女的叫麻翠花，是武田安插在十三釵里面的內(nèi)應(yīng)，她弟弟被抓住威脅，麻翠花沒有辦法才這么做的。武田回去之后告訴宮野說現(xiàn)在一定要抓住顧雪峰，他不是一個(gè)簡單的人物。
李鳳凰在家里面給大家說現(xiàn)在敵人的力量十分的強(qiáng)大，這萬木林副站長又是個(gè)膿包，這段時(shí)間他們都不要出門，靜等著金釵一號(hào)過來下達(dá)命令。光哥聽了之后說那他和叮當(dāng)能做些什么，李鳳凰說他是成事不足敗事有余，遇見他就會(huì)一直倒霉。
武田將軍經(jīng)常去找一個(gè)叫徐子宴的中國女人下棋，他告訴宮野說中國文化博大精深，要是想不戰(zhàn)而屈人之兵就要好好的學(xué)習(xí)中國的文化，這樣就會(huì)更好的統(tǒng)治他們。萬木林給大家開會(huì)說李鳳凰怎么能隨便的把無關(guān)的人麻翠花給帶到組織里面來，李鳳凰跟萬木林吵了起來，他說光哥還是無關(guān)人員怎么也就進(jìn)來了。
李鳳凰生氣的出來說從今天開始任何人不準(zhǔn)隨便出來，要是有什么事情必須要給自己請(qǐng)假，歐陽琴有點(diǎn)看不慣李鳳凰的作風(fēng)，對(duì)她說的話總是嗤之以鼻。
有八個(gè)軍統(tǒng)女行動(dòng)員接到了僵尸行動(dòng)的計(jì)劃之后過來李鳳凰他們住的地方報(bào)道，一個(gè)女的是青樓的頭牌叫月娥，另一個(gè)女的叫顧亞楠伸手十分敏捷是個(gè)神偷，帶上李鳳凰剛好是十二個(gè)，還差一個(gè)一號(hào)金釵剛好是十三個(gè)人。她們當(dāng)中最小的只有十七歲，李鳳凰說在一號(hào)金釵沒有現(xiàn)身之前由自己二號(hào)金釵來代替主持工作。
光哥被李鳳凰和歐陽琴的飛刀嚇得不輕，麻翠花給李鳳凰請(qǐng)假說自己想出來走走，李鳳凰說不行，從現(xiàn)在開始她就是十三釵的編外隊(duì)員，殺日本人有的是時(shí)候。李鳳凰晚上的時(shí)候一個(gè)人跑出來殺了四個(gè)日本人還有一個(gè)大漢奸，隨后她早上在大家吃飯的時(shí)候他拿著漢奸的人頭放在了萬木林的面前。
萬木林只好宣布在一號(hào)金釵出現(xiàn)之前由二號(hào)金釵李鳳凰擔(dān)任隊(duì)長，李鳳凰開始注意到了徐子宴，她去了徐子宴的房間拿槍頂住了徐子宴的頭，徐子宴說自己不是漢奸，她究竟想要干什么。李鳳凰說現(xiàn)在她只有兩條路可以選擇，一個(gè)是自己的朋友，另一個(gè)是自己的敵人。
這時(shí)候顧雪峰出來了，原來顧雪峰跟徐子宴是有過一段故事的人，顧雪峰想讓徐子宴加入他們軍統(tǒng)鋤奸報(bào)國。徐子宴讓顧雪峰和李鳳凰走吧，這時(shí)候武田過來找徐子宴，他們倆趕緊藏了起來。武田進(jìn)到了徐子宴的房間之后和她一起說話，他給徐子宴送了一串自己親手在日本撈上來的珍珠，表明了自己的心意。
宮野在徐子宴家附近發(fā)現(xiàn)了一輛可疑的汽車，武田讓宮野盯住那輛汽車，徐子宴跟武田出來了之后李鳳凰說他們錯(cuò)過了一個(gè)殺掉武田最好的機(jī)會(huì)。顧雪峰說徐子宴對(duì)他們絕對(duì)有用，他可能就是一顆讓武田滿盤皆輸?shù)钠遄樱瑳]有自己的命令不讓李鳳凰擅自動(dòng)徐子宴。
宮野在顧雪峰和李鳳凰坐的汽車上面放了炸彈，李鳳凰無意間發(fā)現(xiàn)了這個(gè)炸彈，她才和顧雪峰在危急關(guān)頭跳車逃過了一劫。武田帶著徐子宴去見了上海的張會(huì)長，張會(huì)長被武田將軍授意可以做鴉片的生意，他對(duì)武田將軍是感恩戴德。晚上的時(shí)候李鳳凰帶著顧雪峰回到了住的地方。
顧雪峰給大家開會(huì)說讓她們十三釵打出自己的威風(fēng)出來，隨后顧雪峰安排了第二天的任務(wù)，他讓李鳳凰第二天跟著他去上海飯店執(zhí)行任務(wù)，其他的人一律不準(zhǔn)外出。第二天顧雪峰帶著李鳳凰去了上海飯店見了戴局長派來的人，那個(gè)叫駱駝的傳達(dá)了上峰的命令說讓他帶領(lǐng)十三釵誅殺大漢奸鄒博庵。
武田接到了駱駝的行蹤消息，隨后讓宮野帶著集合隊(duì)伍準(zhǔn)備去抓捕駱駝。隨后駱駝?dòng)謧鬟_(dá)了日本人的蒲公英計(jì)劃，日本人準(zhǔn)備在江中地區(qū)建立一個(gè)培訓(xùn)日本殺手的基地，要是這個(gè)計(jì)劃成功之后對(duì)他們的黨政機(jī)關(guān)都是一個(gè)很大的威脅，上峰的命令是讓他們組織破壞這個(gè)計(jì)劃。
武田帶著人包圍了上海飯店準(zhǔn)備抓捕駱駝，顧雪峰發(fā)現(xiàn)了之后說現(xiàn)在他們只有突圍了，這時(shí)候?qū)m野帶著人開始搜查了飯店的房間。