狄知遜身陷囹圄,狄仁杰一行人搬出王府,夢瑤問狄仁杰他和元芳是怎么回事,狄仁杰說沒事的。狄仁杰覺得現在只有媚娘可以幫助他了,他讓婉青留下保護夢瑤她們,他前去宮中。
當狄仁杰潛進媚娘寢宮的時候,恰好媚娘在和皇帝交流些什么,媚娘對皇帝說這樣對狄家父子下結論是否過于草率,她在這敏感時期還在為兩父子求情,皇帝很是不高興,勸媚娘不要再為狄家父子開脫,小心惹禍上身。
皇帝走后,狄仁杰現身出現,他很感謝媚娘在這個時候還為他們說話。狄仁杰想請求媚娘指點一二,媚娘說禁軍命案王家狄家同時徹查,狄家出事,王家獲益最大,狄仁杰也想到這了只是不敢相信,媚娘說她會幫助他的。
狄仁杰剛要出皇宮,王佑仁攔住了狄仁杰,他想要收買狄仁杰,但是狄仁杰不為所動,他以王大人為恥。一計不行再施一計,王大人突然招來一堆禁衛軍,雙方大打出手,婉青和蒙面的王元芳及時趕到救出了狄仁杰。王大人很是生氣派人趕緊包圍東??蜅?,幸虧元芳早一步把夢瑤和二寶接走了,他把夢瑤送他的手帕還給夢瑤,夢瑤傷心的說這是要永別了嘛,元芳說可能吧,自己保重。夢瑤答應他說,我可以離開,但是請不要傷害小虎,更加不要傷害自己,元芳什么都沒說決絕離去。
狄仁杰和婉青趕到客棧的時候屋里已經空無一人,官兵也撲了空,婉青問狄仁杰究竟黑衣人是誰,為什么不現身,狄仁杰說他不是不現身,而是無法現身。狄仁杰仔細查看房間,發現地下的滴蠟有些問題,他仔細一看有紙條,寫著望江亭。元芳回到家中,王大人早已經等候多時,他早猜出來是元芳所為,他警告元芳不要再這樣。
約狄仁杰的是酈妃娘娘,狄仁杰已經知道她是假的了,假酈妃也不多說什么,她只是想和狄仁杰做交易,讓他趁著看戲的時候刺殺武媚娘,狄仁杰并不答應。酈妃派人包圍狄仁杰,狄仁杰說就這幾個兄弟就想拿下他未免太小看他了,酈妃說他不是想抓他而是想他束手就擒。原來,酈妃先一步抓住婉青要挾他,狄仁杰為了婉青同意了交易,他找酈妃要來當初媚娘送她的玉簪交給婉青作為信物,但是似乎沒有那么簡單。
元芳在家里無意間發現家父和一個人在秘密交談些什么,什么兵變之類的,還囑托那個人不能讓元芳知道,元芳覺得很是奇怪。李婉青利用狄仁杰送給她的發簪掙脫了開來,她秘密潛入媚娘的寢宮,將這一切都告訴了媚娘,媚娘說如果狄仁杰不照著做會有很多麻煩,還不如將計就計,繼續去徐昭媛那里去看戲。
狄仁杰被關押起來,他利用蒙汗藥蒙暈侍衛偷偷潛入存放禁軍統領尸體的房間內,他發現了一塊玉佩。他又來到了案發現場,他突然發現周圍臺階好像少了些什么。
夢瑤和二寶策馬狂奔來到了暮然山莊,他們找到秋煙姑娘和太傅大人請求幫忙,太傅大人何其聰明,他一下子就來看出來一切罪魁禍首就是王大人,而很有可能和酈妃有關,夢瑤二寶跪求太傅大人幫忙,太傅大人說如果這件事真的是王佑仁主使的那么事情肯定不簡單,太傅大人發現禁軍并沒有由王佑仁統領,太傅大人突然拍桌子,說道大事不妙,長安要出事。
王大人向皇帝請奏,以擔心狄知遜擁兵自重為由調來西南西北兩隊軍隊,皇帝準奏。狄仁杰查探完一切重新回到被關押的地方,他像什么事情都沒發生一樣,找假酈妃要來自己的刀去刺殺媚娘。元芳回到府中,想到父親對他說過的話,他覺得自己的父親一定在做著不可告人的事情。夢瑤和太傅他們一起趕去長安,在半路上發現了西北軍,太傅覺得大事不妙盡快趕回長安,夢瑤發現了首領居然是元芳,她偷偷趕到元芳的營帳附近卻發現原來他們在密謀造反,夢瑤被守衛押進來,元芳說她是自己的相好想蒙騙過去那些將軍不讓他們發現什么。
高麗戲班開演,他們的目的不在于媚娘而是在于皇帝,媚娘挺身幫皇帝擋下一箭,幸虧這時候狄仁杰出現和那些刺客大打出手,救了皇帝。狄仁杰稟明皇帝他發現了索朗之死的原因,皇帝讓狄仁杰說清事情原委。
狄仁杰說出案發經過,并且狄仁杰證實在索朗的指甲縫里發現粉紅色的粉末,那香粉是小昭臉上的,而且還是西域特制。狄仁杰得到皇上的許可后說出她在酈妃房中聽到的話,蓮兒被皇上質問,皇上想知道小昭的尸體,狄仁杰推斷她的尸體就在水池中,經過侍衛的搜查的確發現了小昭的尸體。可是在狄仁杰指證徐昭媛的時候,拿出從索朗身上發現的玉佩,王佑仁解釋那是索朗為紀念母親所為,沒想到王大人早有安排收買了別人。這讓狄仁杰有些意外,他請求多給一些時間來調查,王佑仁等人請皇上賜死狄仁杰,狄仁杰和李婉青被押入天牢等候發落。
元芳和夢瑤帶著西北大軍一路到長安城,夢瑤相信元芳一定不會做出叛軍這樣的事情的,因為她相信元芳。元芳帶著西北軍利用金牌一路暢通無阻,順利進入長安城。
媚娘為皇帝擋了一箭,身受重傷,即使是這樣,她還是一直為狄仁杰求情,請求皇帝不要殺狄仁杰,皇帝心疼媚娘,他答應媚娘不會殺狄仁杰,一切從長計議。杜柯求見陛下,他誓死請柬說狄家父子絕對不會是謀反之人,但是因為皇帝太相信王大人被眼前事物所蒙蔽,他還是沒聽杜柯大人的,讓杜柯不要再管理朝堂之事了。
狄家父子一同被關入天牢,狄知遜后悔沒聽狄仁杰他娘的話,深入朝堂,結果惹禍上身,找來牢獄之災。狄仁杰給他父親介紹婉青,狄知遜知道關于婉青的一切,他勸解婉青如果能活著出去一定要好好地生活,不要被仇恨蒙蔽雙眼。
杜靜秋為了狄仁杰的事情來找武媚娘,媚娘帶著她去大牢,貍貓換太子,因為媚娘覺得王大人有陰謀大唐危在旦夕,現在只有用靜秋來換狄仁杰出來,因為只有狄仁杰出來才能挽回一切。
元芳帶著西北軍已經進入長安這里,王大人覺得大局已定,決定去天牢把狄知遜一干人等殺了。