馬云波得知趙嘉良身份有假，所謂的鐘良其實是警方曾經招募的線人，不過在許多年前就意外去世了。趙嘉良敢冒充警方線人的身份，這說明其中必定有問題。馬雯還在搶救，李飛郁郁寡歡，心如刀絞，李維民拍了拍李飛的肩膀，他只能承諾不讓制毒販毒分子漏網。李維民為了讓李飛安心，便告訴他，自己派出的第一組突擊小組直奔林氏祠堂去營救趙嘉良。可是李飛執意要去塔寨村，他要去干擾林耀東的思緒，要陪伴自己的父親一起面對危險。李維民的聲音顫抖了，他知道這次行動十分危險，不僅趙嘉良可能會犧牲，稍有不慎，李飛也會犧牲。李飛的眼睛紅了，誰也不能阻攔他的決定，他向李維民莊重地敬了一個禮，然后決絕地離開。李維民知道自己無法阻攔李飛，他獨自一個人坐在空蕩蕩的會議室里，回憶著那些離自己而去的戰友和親人，潸然淚下。
此時，塔寨村還在大規模制毒，林耀東瞇縫著眼睛打量制出來的毒品，林宗輝在祠堂里神情肅穆，趙嘉良則該吃吃該喝喝，沒有流露出一絲慌張。另一邊，警方的數百輛車、三架直升機、二十艘邊防巡邏快艇、一艘軍艦已經全部到位，等著和塔寨村制毒販毒團伙做最后一戰，李維民要求大家把塔寨全部掃干凈，抓獲一百八十二個制毒販毒團伙的骨干分子，端掉兩百七十一個制毒窩點，只有收尾行動完成得漂亮，才能不辱使命，對得起帽子上的警徽。
令人緊張的時刻就要來臨，各小組全部準備就緒，李維民給所有奮斗在一線的同志們講話，宣布破冰行動現在開始！李飛開車前往塔寨，中途給馬云波打電話，馬云波鄭重承諾自己一定會辦到答應李飛的事情。李飛非常嚴肅，他告訴馬云波，趙嘉良是自己的親生父親，希望馬云波進塔寨施以援手。馬云波二話不說，他穿好警服，戴好警帽，迅速上車前往塔寨。
李飛躡手躡腳進入塔寨，打暈了看守趙嘉良的混混，趙嘉良看見李飛又驚又喜，還很擔心李飛的安全。李飛明確表示，自己已經知道了趙嘉良的真實身份。趙嘉良見兒子愿意認自己為父親，他激動萬分，父子倆商議著行動計劃，趙嘉良打算等到斷網斷電，自己就去解決林耀東。李飛搖了搖頭，林耀東不是一般人物，他寧愿死，也不會被抓住。此時此刻，林耀東和林耀華偏偏沒有坐在監控面前，他們凝望著夜色中的塔寨，覺得風景平靜，然后打算去祠堂給祖宗上一炷香。
林耀東和林耀華來到祠堂，看見林宗輝還跪在這里，林耀東也面對祖宗牌位跪了下來，不解地詢問林宗輝在這里想什么。林宗輝眼中似乎有淚水呼之欲出，他很想知道，自己是不是林家的叛逆？回想這一輩子，自己沒有把壞人做徹底，可是也算不上是個好人。此時，突擊組按照預案已經開始清除塔寨的明哨暗哨，蔡永強等人全部開始行動。另一邊，李飛和趙嘉良聊天，趙嘉良詢問李飛有沒有女朋友，還勸他大膽追女孩。李飛沒有接話，他開始考慮下一步動作，應該去林耀東家里，先把林耀東按住。趙嘉良感慨兒子終于長大了，他難免想起二十多年前的情景，沒想到時光過得這么快。
武警們動作很快，解決了一路上把守的混混，卸除了監控。林耀東對此毫不知情，他還在祠堂同林宗輝談話，林耀東知道林宗輝最近情緒不好，他警告林宗輝不要添亂。
趙嘉良覺得這次行動很危險，他還是要交代好后事，于是趙嘉良告訴李飛，如果有個萬一，就把自己和素娟埋在一起。李飛的淚水漸漸盈滿了眼眶，趙嘉良激動地抱著兒子，想聽他喊一聲爸爸，可是李飛還無法適應，說什么也叫不出來。就在這時，外面忽然傳來了林耀東和林宗輝爭吵的聲音，趙嘉良放開李飛，李飛迅速把槍上膛，想將槍給趙嘉良，可是趙嘉良覺得李飛才是警察，他拿著槍才更合適。
林宗輝指責林耀東毀了塔寨，那些原本樸實的人家，嘗到制毒帶來的巨額利潤甜頭之后，誰也不愿意再通過辛苦的勞動賺錢，而那些制毒人家的孩子都早早地輟學在家，不是跟著制毒，就是販毒。林耀東拼命反駁，塔寨村以前窮得要命，祠堂都是破破爛爛的，現在卻發生了天翻地覆的變化，這都是自己的功勞。林耀東死不悔改，他認為自己所做的一切并不是犯罪，而是為了整個林家。林宗輝氣的說不出話來，趙嘉良此刻卻悄悄摸到了祠堂外面。
警方分別在法國，香港部署完畢，即刻對朱鴻運，劉浩宇，黃達成進行抓捕，這些毒梟毫無防備，只能束手就擒。另一邊，林宗輝終于忍不住了，他坦然告訴林耀東，自己把塔寨所有制毒人家的名單交給了警方！此言一出，林耀東震驚得無以復加，林耀華和林燦等人更是大驚失色。林耀東難以置信地站起身，林宗輝撕心裂肺的怒吼，自己真的很想做一個聽話的好弟弟，但是為了不讓林家斷子絕孫，塔寨的毒必須清了。
林耀東恨得咬牙切齒，斥責林宗輝出賣族人和兄弟，這種叛徒不配為人！林宗輝冷笑著，他的臉上浮現出猙獰可怕的表情，什么是人？自己和塔寨人早就是鬼一般的存在！林宗輝的情緒越來越激動，他迫不及待想去見祖宗，在祖宗面前細數林耀東的罪狀，狠狠告他一狀！林耀東咆哮著與林宗輝爭吵，林宗輝索性一頭撞在墻上，眾人都驚呆了。
武警們在塔寨村里剪斷監控線路，遭到了村民混混的襲擊，雙方迅速展開殊死搏斗，隨著武警大量涌入，這些混混才知道大事不妙。林宗輝撞得頭破血流，他顫抖著聲音，讓林耀東送自己去見祖宗。林燦也恨透了林宗輝，便將手槍塞到林耀東手里。林耀東舉起槍來，頭上青筋畢露，他的手一直在抖，猶豫許久，最終還是狠不下心。林宗輝見此情景，發出滲人的笑聲，林耀東之前做了那么多壞事，殘害三寶、勝文、勝武，難道現在還怕送給自己一顆子彈嗎？還是怕自己向祖宗告狀呢？林宗輝干脆坐直了身子，怒斥林耀東根本沒有資格見到祖宗，這句話徹底激怒了林耀東，他憤怒地大喊一聲，再也控制不住自己，一槍崩了林宗輝。
行動小組清除了塔寨村所有的明哨暗哨，李維民讓大家按照行動預案斷網斷電，后續警力前往塔寨集結。此時，林天昊等人還在制毒，他們發現村里斷網斷電，連手機都沒有信號了，便察覺到情況不對。林耀東得知此事，知道是公安要對塔寨動手了，他趕緊吩咐林耀華，讓所有制毒人家銷毀賬本和證據，讓村民拖延時間防止警方入村。林耀華急匆匆去執行命令，林耀東則跪在祖宗牌位前磕頭。
林耀東告訴林燦，以后的林氏家族就將交到林燦手上。這時，趙嘉良終于現身了。林耀東顯得很平靜，他想知道趙嘉良到底是誰。趙嘉良緩緩提起二十年前的舊事，死于東莨菪堿的素娟，而自己就是素娟的丈夫，為了妻子追兇二十年。林耀東頭腦里的記憶越來越清晰，仿佛狂風卷走了風沙，只剩下真相，他終于回憶起來，自己解決了素娟以后，在房中的全家福照片上見過趙嘉良。當林耀東得知李飛是趙嘉良的兒子，他冷笑著感嘆，李家父子倆跟自己還真是有緣。趙嘉良盯著面前的仇人，新仇舊賬可以好好算一算了。
塔寨村的人正在銷毀證據的路上，可是警方的動作更快，成功將他們截獲，并繳獲了大量毒品和現金作為證據。在林氏祠堂里，林耀東心疼著自己精心經營的塔寨，將這一切責任都怪罪到趙嘉良頭上。這時，李飛挾持著林耀華走進來，林燦便迅速挾持了趙嘉良。李飛為了父親的安全，最終還是妥協了，林耀東正準備殺了這父子二人，馬云波竟然走進來，自稱來營救林耀東，條件是一起帶走趙嘉良和李飛。林耀東斟酌幾番，答應了馬云波提出的條件，誰知李飛剛剛上車，林燦竟然反悔，出其不意地一槍打死了趙嘉良。李飛雙手被銬住，他在車里看著父親被害，悲痛欲絕，可無力回天，趙嘉良在最后一刻看著兒子，慢慢閉上了眼睛。林耀東也上了馬云波的車，揚塵而去，李飛在車里淚流滿面，不停回頭看著倒在地上的父親。
警方各個小組順利摸入塔寨，定點行動開始，蔡永強很快發現了趙嘉良的尸體，李飛卻不知所蹤，他迅速將這個消息報告給李維民，李維民大受打擊，他努力克制著悲傷的情緒，讓手下趕緊查李飛的位置，發現李飛在馬云波的警車上。各個抓捕小組陸續到位，蔡永強發現一個毒販眼神飄忽不定，似乎在看向旁邊的人家，他敏銳地察覺到其中必有問題，進入一看，這里竟然是制毒倉庫。
很快，正在企圖燒毀證據的林耀華被警方抓捕；林天昊打算逃跑，但并沒有得逞；林燦也被抓住，銬上了手銬。林小力故意假稱河前村的人來尋仇了，讓村民們一起出來反抗，但是很快被警方驅散了。黑暗的夜晚過去，黎明終于來臨，馬云波的警車一路駕駛到大海邊，林耀東滿懷期望地下車，卻沒看到理想中的船。這時馬云波出其不意地將林耀東鎖住，然后打開了李飛的手銬，他鄭重地告訴李飛，自己完成了承諾，現在就把林耀東交給李飛處置。馬云波告訴林耀東，他不該拿于慧來要挾自己，于慧就是從這里走入大海，走向了生命的盡頭。林耀東算是明白了，馬云波不會放過自己，他開始使出激將法，承認是自己用毒品害死了于慧，還用毒品拉馬云波下水，林耀東寧愿一死，也不想被警方抓住，所以他想讓馬云波一槍打死自己。
馬云波一字一句的回答，自己之所以進入塔寨，就是要讓林耀東活著，因為林耀東不配去死，他死有余辜，必須接受法律和人民的審判。說完這一切，馬云波將自己和李飛銬在一起，他以此來謝罪，作為一種懺悔。此時此刻，李維民正在看馬云波留給自己的信，里面還有馬云波和林耀東所有的通話錄音。在信中，馬云波深刻反省了自己所犯的錯誤，他知道這一切不可被原諒，所以只能盡力補贖，就算不再配得上英雄稱號，也要盡到警察的責任和義務。警車們很快呼嘯而至，來到海邊，李飛以涉嫌走私、運輸、販賣、制造毒品罪、故意殺人罪依法逮捕了林耀東。
李飛回去以后，跟李維民一起看到趙嘉良的遺體，李飛遺憾未能親口叫一聲爸爸，可是他們父子相隔20多年，始終無法開口叫一聲爸爸。而現在父親躺在這里，卻連說對不起的機會都不給自己。李維民悲痛萬分，腦海中閃現與好兄弟相處的點點滴滴，莊重地向遺體敬禮告別，李飛則跪倒在地，淚流滿面地向父親的遺體磕頭。
最終，林耀東、林耀華、林天昊、林燦因犯故意殺人罪，制造販賣毒品罪，被依法判處死刑，剝奪政治權利終身，沒收個人全部財產。陳文澤因嚴重違紀被開除黨籍和公職，涉嫌受賄瀆職，為制毒販毒分子充當保護傘，依法判處有期徒刑十五年。馬云波因嚴重違紀被開除黨籍和公職，涉嫌受賄瀆職，為制毒販毒分子充當保護傘，依法判處有期徒刑十二年。劉浩宇、黃達成、方天逸因犯走私，販賣毒品罪，洗錢罪，被依法判處死刑，剝奪政治權利終身，沒收個人全部財產。林景文因制造販賣毒品罪，并依法判處無期徒刑，剝奪政治權利終身，沒收個人全部財產。
經過驚心動魄的戰斗，犧牲了許多生命，破冰行動終于勝利完成，販毒分子全部落網，得到了應有的懲罰，這場聲勢浩大的緝毒行動大獲全勝，告別黑暗，迎來光明。
6個月后，陳珂收到李飛從新疆的來信。李飛信中詢問馬雯恢復情況，希望陳珂幫助馬雯復健。換了新的環境，李飛想念廣東的生活，也在逐漸適應新的生活和環境。他不再莽撞，也更珍惜來之不易的生命。李飛，陳珂，馬雯，再經歷過“破冰行動”之后，也彼此開啟了新的征程。