洪立趕到扇子店詢問趙嬸和蓮花是否得罪過和珅，趙嬸想起了前兩天買扇子的人。洪立遇見了為災民籌款而受傷暈倒的七爺，他在蓮花的指導下救了七爺，并與蓮花結為兄妹。洪立與蓮花從七爺那里得知瘟疫鬧得很厲害，他們決定到山上采藥醫治受災的百姓，結果遇到了和珅，和珅將洪立與蓮花出游的事情秉明了皇上，皇上召見洪立，洪立說蓮花姑娘不懂醫術。皇上知道洪立在撒謊，于是吩咐和珅從京城把太醫都叫來。七爺的仇人來扇子店鬧事，?洪立連蒙帶騙將那伙人趕走了。洪立拜蓮花為師，洪立與蓮花非常談得來。江北地區的瘟疫越來越厲害，洪立和蓮花準備去那邊治病救人，但是醫藥費還是不夠，洪立從家里偷偷拿走了一部分錢。
皇上派人盜取蓮花姑娘的一把黑扇子，看是否是過去一個太醫的，沒成想蓮花剛巧把扇子拿走了，放了一把普通的扇子在盒里，皇上看到扇子并不是黑色的水月蓮花扇，于是再沒有繼續追查。皇上對蓮花產生了好感，并以金爺的身份來到了扇子店，正趕上一幫人來扇子店鬧事，皇上驅走了鬧事的人，在蓮花姑娘面前爭得了面子，壓過了洪立。和珅向皇上報告了南方鬧瘟疫的情況，并把皇上請到了扇子店斜對面的一個藥店里，這個藥店是和珅專門為方便皇上與蓮花交往而盤下來的，和珅向皇上說了為賑濟災區選拔優秀醫生而舉行醫方擂臺的想法，皇帝同意了。洪立收到了醫方擂臺的請帖，皇上也推薦由蓮花出面做擂臺總裁決。為了讓洪立遠離蓮花，和珅把洪立與蓮花在一起的實情告訴了大梅。
洪立和蓮花為了災區的疫情和躲避和珅決定離開揚州前往災區治病救人，由于病人太多，洪立和蓮花的藥都用完了，蓮花姑娘也由于過度勞累病倒了，為了能夠有更多的藥救濟災民，洪立和蓮花準備回到揚州參加朝廷舉辦的醫方擂臺。擂臺如期舉行，對壘雙方分別是太醫院和洪立，裁判是蓮花姑娘。洪立的藥方因為結合了受災病人眾多的實際情況而勝過了華而不實藥材成本過高的太醫院一方，奪得了擂臺的冠軍，在暗中觀戰的皇上也覺得洪立應當勝出。大梅看到蓮花通情達理，在心里也慢慢接受了蓮花姑娘。蓮花見洪立人品醫德都不錯，決定收洪立為黑扇神醫門下之徒，而黑扇神醫的門歸要求加入醫門的外姓人必須娶蓮花姑娘為妻，洪立應允了下來。和珅告訴大梅洪立要娶蓮花姑娘，本以為大梅能大鬧一場，沒想到大梅并不生氣。